本文關(guān)鍵詞：對結(jié)腸癌中CD133相關(guān)基因及通路的生物信息學(xué)篩選，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：目的:尋找與結(jié)腸癌干細(xì)胞表面標(biāo)志物CD133表達(dá)密切相關(guān)的基因及其參與的生物過程。方法:通過生物信息學(xué)方法,利用GEO數(shù)據(jù)庫中結(jié)腸癌基因芯片數(shù)據(jù),結(jié)合R2平臺(tái),篩選出與CD133表達(dá)顯著相關(guān)的基因,分析相關(guān)基因在不同性別、腫瘤原發(fā)部位及分期中的表達(dá)差異。同時(shí),利用GO及KEGG工具對與CD133表達(dá)顯著相關(guān)基因進(jìn)行基因本體和KEGG通路分析。結(jié)果:130例結(jié)腸癌標(biāo)本中126例檢測出CD133表達(dá),與CD133表達(dá)顯著相關(guān)基因共598個(gè)(正相關(guān)504個(gè),負(fù)相關(guān)94個(gè)),且正負(fù)相關(guān)性前7位基因的表達(dá)與患者性別、腫瘤原發(fā)部位及分期無明顯關(guān)系(P0.05)。對基因本體及KEGG通路分析后發(fā)現(xiàn),598個(gè)相關(guān)基因參與O聚糖合成、鞘糖脂合成等多個(gè)腫瘤相關(guān)生物過程。結(jié)論:CD133在結(jié)腸癌中普遍表達(dá),CD133表達(dá)相關(guān)的基因參與了多個(gè)腫瘤生物過程,為深入研究結(jié)腸癌干細(xì)胞分子標(biāo)志物相關(guān)基因及其參與的生物過程提供了一定參考。
【作者單位】： 武漢大學(xué)中南醫(yī)院消化內(nèi)科;湖北省腸病醫(yī)學(xué)臨床研究中心&腸病湖北省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;武漢大學(xué)中南醫(yī)院腫瘤科;青海省第五人民醫(yī)院腫瘤科;
【關(guān)鍵詞】： CD 結(jié)腸癌干細(xì)胞 生物信息學(xué) 基因芯片
【基金】：國家自然科學(xué)基金青年基金資助項(xiàng)目(編號:210700130)
【分類號】：R735.35
【正文快照】： 結(jié)腸癌是全球高發(fā)的惡性腫瘤之一。近年來,國內(nèi)其發(fā)病率也呈現(xiàn)逐年上升趨勢。O’Brien等研究發(fā)現(xiàn)CD133+的人結(jié)腸癌干細(xì)胞具有自我更新和分化、重建成結(jié)腸癌細(xì)胞群體的能力,極少量這種細(xì)胞就能分化成新的腫瘤細(xì)胞進(jìn)而增殖形成腫瘤[1],提示CD133可能是結(jié)腸癌腫瘤干細(xì)胞的表面標(biāo)

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本文編號：475866