發(fā)布時間：2017-06-23 06:15

  本文關(guān)鍵詞：ssc-miR-486靶基因預(yù)測及生物信息學(xué)分析，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：通過對ssc-miR-486進(jìn)行靶基因預(yù)測及生物信息學(xué)分析,以探索其影響豬脂肪沉積的作用機(jī)制。首先利用實(shí)時熒光定量PCR技術(shù)對脂肪沉積能力相差較大的萊蕪豬和大白豬皮下脂肪組織中ssc-miR-486表達(dá)情況進(jìn)行比較研究,然后利用miRBase、Ensembl、NCBI等數(shù)據(jù)庫及miRanda、PITA、RNAhybrid、Cytoscape、JASPAR、Promoter Scan等軟件對ssc-miR-486進(jìn)行生物信息學(xué)分析,包括保守性分析、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)預(yù)測、靶基因預(yù)測、GO富集分析和KEGG信號通路富集分析。結(jié)果表明,ssc-miR-486在脂肪沉積能力較強(qiáng)的萊蕪豬皮下脂肪組織中發(fā)生顯著上調(diào)。生物信息學(xué)分析結(jié)果發(fā)現(xiàn),miR-486在各物種間非常保守,ssc-miR-486啟動子區(qū)域有SREBP1、SREBP2等多個轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn),獲得的229個靶基因顯著富集于脂質(zhì)代謝、脂質(zhì)生物合成、細(xì)胞代謝等生物學(xué)過程及類固醇生物合成、磷脂肌醇代謝、PPAR等信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路中。結(jié)果表明,ssc-miR-486參與了豬脂肪沉積或脂肪代謝的調(diào)控,為今后研究脂肪沉積提供基礎(chǔ)理論支撐。
【作者單位】： 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所;
【關(guān)鍵詞】： ssc-miR- 生物信息學(xué) 脂肪沉積 豬
【基金】：轉(zhuǎn)基因生物新品種培育科技重大專項(xiàng)(2009ZX08008-004B;2008ZX08008-003) 國家“863”計(jì)劃項(xiàng)目(2008AA10Z140) 國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(30571339) 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新項(xiàng)目(ASTIP-IAS05);中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院創(chuàng)新基金項(xiàng)目(2004-院-1) 國家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展計(jì)劃(“973”計(jì)劃項(xiàng)目)(2015CB943100) 中央級公益性科研院所基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)專項(xiàng)資金項(xiàng)目(2013ywf-yb-5;2013ywf-zd-2)
【分類號】：Q811.4;R589.2
【正文快照】： 肥胖是一種代謝綜合征,是當(dāng)今全球侵蝕人類健康的常發(fā)病之一。目前,肥胖已經(jīng)成為重要的世界性健康問題,據(jù)保守估計(jì),大約有50%人口處于超重狀態(tài),而且,在未來的幾年里,肥胖的人數(shù)將達(dá)到7億[1-2]。此外,肥胖并發(fā)癥比如心腦血管疾病、二型糖尿病、胰島素抵抗、阻塞性睡眠呼吸暫停

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本文編號：474131