罕見病發(fā)病率低,但患者基數(shù)大且難以診療,嚴(yán)重危害患者身體健康的同時(shí)對(duì)患者家庭和社會(huì)造成嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)。隨著第二代測(cè)序技術(shù)的成熟,基因檢測(cè)技術(shù)已廣泛應(yīng)用于罕見遺傳病的檢測(cè)。然而傳統(tǒng)的臨床基因檢測(cè)報(bào)告流程存在著局限性,一方面遺傳疾病學(xué)知識(shí)來(lái)源分散,無(wú)法快速準(zhǔn)確的獲取遺傳疾病學(xué)知識(shí);一方面現(xiàn)階段測(cè)序數(shù)據(jù)存儲(chǔ)方式無(wú)法實(shí)現(xiàn)大規(guī)�；颊邤�(shù)量下跨患者變異信息的高效檢索、篩選和統(tǒng)計(jì)利用;另一方面罕見遺傳病難以診斷,缺乏候選疾病推薦服務(wù)以輔助遺傳病診斷決策;另外工作流程還缺乏系統(tǒng)的信息化管理。這些不足嚴(yán)重影響著傳統(tǒng)臨床基因檢測(cè)報(bào)告的性能,使其已不能滿足現(xiàn)階段的臨床需求。因此亟待針對(duì)其中關(guān)鍵問(wèn)題開展針對(duì)性應(yīng)用研究,并建立服務(wù)于臨床的基因檢測(cè)報(bào)告系統(tǒng)來(lái)輔助臨床基因檢測(cè)報(bào)告工作。本論文的具體研究工作包括:(1)服務(wù)于臨床基因檢測(cè)報(bào)告的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)知識(shí)庫(kù)構(gòu)建。以權(quán)威遺傳病變異數(shù)據(jù)解讀指南為基礎(chǔ),結(jié)合臨床基因檢測(cè)報(bào)告實(shí)踐需求,對(duì)常用的12種遺傳疾病學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行整合收錄,在將原始數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化和結(jié)構(gòu)化存儲(chǔ)的基礎(chǔ)上,根據(jù)多種臨床場(chǎng)景的需求設(shè)計(jì)15張數(shù)據(jù)庫(kù)表間關(guān)系和使用規(guī)則,并利用原始知識(shí)生成遺傳疾病學(xué)知識(shí)網(wǎng)絡(luò),構(gòu)建了精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)...

【文章頁(yè)數(shù)】：86 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖１．１傳統(tǒng)測(cè)序方式和ＮＧＳ測(cè)序方式發(fā)現(xiàn)致病基因數(shù)量統(tǒng)計(jì)??１．１．３傳統(tǒng)臨床基因檢測(cè)報(bào)告流程??臨床醫(yī)師通過(guò)分析患者ＮＧＳ測(cè)序的大量基因變異數(shù)據(jù)，并結(jié)合權(quán)威遺傳疾??

保持了高準(zhǔn)確性的前提下能大幅度降低測(cè)序??的成本和測(cè)序時(shí)長(zhǎng)（由幾年縮短為一周），特別是全外顯子組測(cè)序（ｗｈｏｌｅ－ｅｘｏｍｅ??ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ，?ＷＥＳ）和目標(biāo)區(qū)域測(cè)序技術(shù)，可僅僅對(duì)約２２０００個(gè)外顯子或針對(duì)特??定臨床表型相關(guān)的數(shù)百基因進(jìn)行測(cè)序［１４］，已經(jīng)廣泛用于臨床新....

圖１．２傳統(tǒng)臨床基因檢測(cè)報(bào)告流程??

浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文?＾??１１?＇?■??＇￣￣￣．■一—１??這庫(kù)??ＺＺＬ??宦網(wǎng)檢索??ｖ雜??獲取?＿患者表型１０?????篆釀史??圖１．２傳統(tǒng)臨床基因檢測(cè)報(bào)告流程??然而，傳統(tǒng)的臨床基因檢測(cè)報(bào)告流程在實(shí)踐過(guò)程中存在一些問(wèn)題，嚴(yán)重影響??了臨床基因檢測(cè)報(bào)告工作的效率和....

圖２．１精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)知識(shí)庫(kù)數(shù)據(jù)表設(shè)計(jì)圖??２．３數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建結(jié)果??精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)知識(shí)庫(kù)整合了臨床基因檢測(cè)報(bào)告流程中常用的罕見遺傳病疾病知??識(shí)庫(kù)、表型知識(shí)庫(kù)、基因和突變知識(shí)庫(kù)、參考文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)等多類遺傳疾病學(xué)知識(shí)??

ｎ?ｄｂｓｎｐ?ｖａｒｉａｔｉｏｎ?ｄｂｖａｒ??ｊ?Ｉ?Ｂ因本體?１?Ｉ?ｄｂｓｎｐ突変?Ｉ?ｄｂｖａｒ突變?：??ｇｅｎｅ?ｎｃｂｉ??Ｌ－一???ｉ?￣｜人類參考基因?：??ｅｎｓｅｍｂｌ?ｖａｒｉａｔｉｏｎ?ｃｉｉｎｖａｒ?ｖａｒｉａｔｉｏｎ?ｈｇｍｄ?ｖａｒｉａｔｉｏｎ....

圖２．２ＨＰＯ（ＣＨＰＯ）本體層次結(jié)構(gòu)（鼻竇炎部分）??本文共整合與遺傳疾病相關(guān)的標(biāo)準(zhǔn)表型共５７３６條，通過(guò)公式（２．１）計(jì)算任??意表型節(jié)點(diǎn)之間的最短距離構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)表型相似性網(wǎng)絡(luò)，并通過(guò)多維標(biāo)度分析??

浙江大學(xué)碩士學(xué)位論文?服務(wù)于臨床基因檢測(cè)報(bào)告的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)知識(shí)庫(kù)構(gòu)建??“慢性鼻竇炎”節(jié)點(diǎn)到“鼻竇炎”節(jié)點(diǎn)之間最短距離為】，“急性鼻竇炎”節(jié)點(diǎn)??到“鼻竇炎”節(jié)點(diǎn)最短距離也為１，則節(jié)點(diǎn)“慢性鼻竇炎”和“急性鼻竇炎”之??間的距離為２。ｄｗａｘ表示在整合的ＨＰＯ標(biāo)準(zhǔn)表型數(shù)據(jù)庫(kù)中任意表型....

本文編號(hào)：4049728