鈴鐺子AlPMT基因的克隆及表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2025-02-26 20:46
本研究意在為進(jìn)一步研究鈴鐺子中AlPMT基因的生物學(xué)功能奠定基礎(chǔ)。選用茄科已發(fā)表的PMT基因序列進(jìn)行多重序列比對(duì),并以此結(jié)果進(jìn)行簡(jiǎn)并引物設(shè)計(jì),經(jīng)PCR擴(kuò)增及測(cè)序后得到鈴鐺子中AlPMT基因的全長(zhǎng)核苷酸序列。AlPMT基因全長(zhǎng)為1 296 bp,共編碼有339個(gè)氨基酸,預(yù)測(cè)Al PMT蛋白分子量為37.2 kD,等電點(diǎn)為5.73。系統(tǒng)進(jìn)化分析顯示Al PMT蛋白與顛茄、三分三的PMT蛋白有較高的親緣關(guān)系。轉(zhuǎn)錄模式分析表明AlPMT基因在鈴鐺子的根、莖、葉中均有表達(dá),但是在根中表達(dá)量較高,同時(shí)證明該研究克隆的AlPMT基因與鈴鐺子中托品烷類生物堿的合成密切相關(guān)。
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料
2 方法
2.1 RNA的提取與cDNA的合成
2.2 AlPMT基因的克隆
2.3 AlPMT基因的生物信息學(xué)分析
2.4 AlPMT基因的組織表達(dá)譜分析
3 結(jié)果與分析
3.1 鈴鐺子AlPMT的克隆和序列特征分析
3.2 AlPMT基因編碼蛋白的生物信息學(xué)分析
3.2.1 理化性質(zhì)分析
3.2.2 AlPMT編碼蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
3.2.3 AlPMT氨基酸序列與保守結(jié)構(gòu)域分析
3.2.4 AlPMT編碼的蛋白信號(hào)肽和亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)分析
3.2.5 AlPMT分子進(jìn)化樹的構(gòu)建
3.3 AlPMT基因的組織表達(dá)和誘導(dǎo)表達(dá)分析
3.3.1 AlPMT基因的組織表達(dá)分析
3.3.2 AlPMT基因的誘導(dǎo)表達(dá)分析
4 討論
5 結(jié)論
本文編號(hào):4034360
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料
2 方法
2.1 RNA的提取與cDNA的合成
2.2 AlPMT基因的克隆
2.3 AlPMT基因的生物信息學(xué)分析
2.4 AlPMT基因的組織表達(dá)譜分析
3 結(jié)果與分析
3.1 鈴鐺子AlPMT的克隆和序列特征分析
3.2 AlPMT基因編碼蛋白的生物信息學(xué)分析
3.2.1 理化性質(zhì)分析
3.2.2 AlPMT編碼蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
3.2.3 AlPMT氨基酸序列與保守結(jié)構(gòu)域分析
3.2.4 AlPMT編碼的蛋白信號(hào)肽和亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)分析
3.2.5 AlPMT分子進(jìn)化樹的構(gòu)建
3.3 AlPMT基因的組織表達(dá)和誘導(dǎo)表達(dá)分析
3.3.1 AlPMT基因的組織表達(dá)分析
3.3.2 AlPMT基因的誘導(dǎo)表達(dá)分析
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