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紫玉蘭MlSOC1基因亞細(xì)胞定位及花芽分化時(shí)期的表達(dá)分析

發(fā)布時(shí)間:2024-12-11 00:16
   為了探究SOC1基因在紫玉蘭(Magnolia liliflora)成花過程中的作用,通過對(duì)景寧木蘭轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)(NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)編號(hào):SRP129819)進(jìn)行篩選,利用同源克隆的方法得到2個(gè)SOC1基因的編碼區(qū)序列;運(yùn)用在線生物信息學(xué)分析工具對(duì)這2個(gè)基因進(jìn)行序列分析,并結(jié)合實(shí)時(shí)熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction, q RT-PCR)分析這2個(gè)基因在紫玉蘭不同花芽分化期的表達(dá)模式。將獲得的2個(gè)SOC1基因分別命名為MlSOC1-1和MlSOC1-2,其中:MlSOC1-1長(zhǎng)度為666 bp,編碼221個(gè)氨基酸;MlSOC1-2長(zhǎng)度為654 bp,編碼217個(gè)氨基酸。2個(gè)SOC1基因都具有保守的SOC1基序,屬于SOC1/TM3亞家族基因。系統(tǒng)進(jìn)化樹分析結(jié)果顯示,MlSOC1-1與皺葉木蘭(Magnolia praecocissima)中的SOC1同源基因親緣關(guān)系最近,而MlSOC1-2與北美木蘭(M. virginiana)中的SOC1同源基因親緣關(guān)系最近,2個(gè)基因都與木蘭科木蘭...

【文章頁數(shù)】:10 頁

【部分圖文】:

圖1 紫玉蘭花芽分化過程

圖1 紫玉蘭花芽分化過程

紫玉蘭于晚春開花,在木蘭屬植物中為花葉同開類型。經(jīng)過近一個(gè)月的新枝抽梢,在頂端開始出現(xiàn)新芽。在花芽分化過程中,芽外部依次形成幾層被白色或淺褐色毛的佛焰苞狀苞片。紫玉蘭每年只進(jìn)行一次花芽分化,從5月初開始頂芽分化,至6月中上旬分化結(jié)束。根據(jù)石蠟切片的結(jié)果,可將紫玉蘭花芽分化劃分為6....


圖2 MlSOC1-1和MlSOC1-2基因核苷酸序列比對(duì)

圖2 MlSOC1-1和MlSOC1-2基因核苷酸序列比對(duì)

通過與其他物種的多個(gè)氨基酸序列進(jìn)行比對(duì)發(fā)現(xiàn),紫玉蘭MlSOC1-1和MlSOC1-2編碼的氨基酸序列與其他物種中SOC1編碼的氨基酸序列的同源性都達(dá)了65%以上,且與木蘭科植物更為相近,序列同源性達(dá)90%以上。同時(shí)發(fā)現(xiàn),MlSOC1-1和MlSOC1-2與其他植物如葡萄(Viti....


圖6 MlSOC1-1/2蛋白亞細(xì)胞定位

圖6 MlSOC1-1/2蛋白亞細(xì)胞定位

根據(jù)MlSOC1-1和MlSOC1-2基因在紫玉蘭花芽分化不同階段葉片和花芽中的表達(dá)分析發(fā)現(xiàn),2個(gè)基因無論是在葉片還是花芽中,其表達(dá)模式均有所差異,其中:MlSOC1-1的表達(dá)模式為由高到低再升高,該基因在成花轉(zhuǎn)變及花芽分化初期具有較高的表達(dá)量,且在花芽分化的花瓣原基分化期到雌蕊....


圖7 MlSOC1-1和MlSOC1-2在不同花芽分化期葉和花芽中的表達(dá)分析

圖7 MlSOC1-1和MlSOC1-2在不同花芽分化期葉和花芽中的表達(dá)分析

在以往的研究中發(fā)現(xiàn),大多數(shù)植物只存在一個(gè)SOC1同源基因,只有少數(shù)物種具有多個(gè)SOC1同源基因[26]。本次試驗(yàn)在紫玉蘭中發(fā)現(xiàn)2個(gè)SOC1基因,經(jīng)過比對(duì)發(fā)現(xiàn),其序列同源性并不一致。MlSOC1-2的氨基酸序列與MlSOC1-1有一定的差異性,但通過多物種氨基酸同源蛋白序列比對(duì)以及....



本文編號(hào):4015880

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