前列腺癌是男性生殖系統(tǒng)中最常見的惡性腫瘤,嚴(yán)重威脅男性健康。它的發(fā)生發(fā)展涉及多條信號通路,發(fā)病機制較為復(fù)雜。流行病學(xué)研究發(fā)現(xiàn),前列腺癌的發(fā)病率和異質(zhì)性存在種族差異,黑種人發(fā)病率最高,白種人次之,亞裔人最低,并且生活在西方的亞裔人比本土亞裔人發(fā)病率高。目前,對于前列腺癌種族和人群異質(zhì)性的分子機制研究相對較少。本課題從分子和系統(tǒng)層次出發(fā),探究不同種族人群前列腺癌基因、基因網(wǎng)絡(luò)與生物功能的關(guān)系。首先,構(gòu)建了包含5,629個節(jié)點、65,671條邊的人類前列腺癌蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)(HPC-PPIN)。其次,分別將篩選出的黑種、白種、黃種人(主要是亞裔人)的差異表達基因數(shù)據(jù)映射到HPC-PPIN上,得到人種特異性前列腺癌蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò),并通過分析網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)和生物學(xué)功能,發(fā)現(xiàn)黑種人網(wǎng)絡(luò)中基因所富集的特有信號通路最多,白種人次之,亞裔人最少,三者共同的通路為74條,并且黑種人和白種人最顯著的富集在癌癥的分子機制、糖皮質(zhì)激素受體等信號通路上,亞裔人種更多的富集在樁蛋白信號、白介素6等免疫相關(guān)的通路上。此外,基于對黑種人群和白種人群分析數(shù)據(jù)的進一步細(xì)化,研究了不同人種前列腺癌分期(Ⅱ期和Ⅲ期)的異質(zhì)性...

【文章頁數(shù)】：99 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
中文摘要
abstract
第1章 引言
    第1.1節(jié) 研究背景
    第1.2節(jié) 國內(nèi)外研究現(xiàn)狀
    第1.3節(jié) 研究目的和意義
    第1.4節(jié) 本文的組織架構(gòu)
第2章 多組學(xué)數(shù)據(jù)收集與處理
    第2.1節(jié) 基因表達譜
        2.1.1 不同人種前列腺癌數(shù)據(jù)收集與處理
        2.1.2 不同人種前列腺癌分期數(shù)據(jù)收集與處理
    第2.2節(jié) 蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)
        2.2.1 人類蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)收集與處理
        2.2.2 前列腺癌相關(guān)基因收集與整理
        2.2.3 人類前列腺癌蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)(HPC-PPIN)的構(gòu)建
    第2.3節(jié) 本章小結(jié)
第3章 不同人種前列腺癌異質(zhì)性研究
    第3.1節(jié) 不同人種前列腺癌差異表達基因分析
        3.1.1 基因本體論分析
        3.1.2 通路富集分析
        3.1.3 重疊度分析
    第3.2節(jié) 人種特異性前列腺癌蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建
    第3.3節(jié) 人種特異性網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析與生物功能研究
        3.3.1 網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析
        3.3.2 基因本體論分析
        3.3.3 通路富集分析
    第3.4節(jié) 本章小結(jié)
第4章 不同人種前列腺癌分期異質(zhì)性研究
    第4.1節(jié) 不同人種前列腺癌分期差異表達基因分析
        4.1.1 基因本體論分析
        4.1.2 通路富集分析
    第4.2節(jié) 人種分期特異性前列腺癌蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建
    第4.3節(jié) 人種分期特異性網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析與生物功能研究
        4.3.1 網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析
        4.3.2 基因本體論分析
        4.3.3 通路富集分析
    第4.4節(jié)本章小結(jié)
第5章 結(jié)論與展望
    第5.1節(jié) 課題總結(jié)
    第5.2節(jié) 展望
參考文獻
攻讀碩士學(xué)位期間(待)公開發(fā)表的論文
附錄
致謝



本文編號：4014749