為揭示棉花耐鹽分子機制,篩選出棉花鹽脅迫應(yīng)答相關(guān)基因.文章從4個新疆主栽棉花品種中篩選得到一個對鹽脅迫具有強耐受性的‘新陸中69號’,并在鹽脅迫下對棉花根系進行了轉(zhuǎn)錄組分析.結(jié)果表明:有891個基因表達量上調(diào),666個基因表達量下調(diào); GO富集分析結(jié)果表明:差異表達基因數(shù)量較多的主要集中在分子功能、細胞組分、生物學(xué)過程中; KEGG分析結(jié)果表明:差異表達基因主要參與木質(zhì)素生物合成和植物MAPK信號通路.

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

圖1棉花品種間耐鹽性比較

選擇經(jīng)0.50%NaCl處理的新陸中69號品種根系提取RNA，進行轉(zhuǎn)錄組分析．IlluminaHiseq平臺測序結(jié)果表明:CK1、CK2、NaCl1、NaCl2獲得的原始Reads分別是49841082、41348682、42165466、45793106....

圖2棉花根系差異表達基因的火山圖

與對照材料相比(圖2)，經(jīng)過0.50%NaCl處理6d后的棉花植株中有1557個基因表達量發(fā)生顯著變化．其中，在鹽脅迫條件下，有891個基因表達量增加，而666個基因表達量出現(xiàn)下調(diào)．2.4差異表達基因GO和KEGG注釋分析

圖3棉花根系差異表達基因的GO和KEGG注釋分析

利用qRT-PCR檢測棉花鹽脅迫處理后上述基因的表達變化，結(jié)果表明:編號為Cot-AD05721和Cot-AD49287的基因上調(diào)表達;編號為Cot-AD54195、Cot-AD56209、Cot-AD17346、Cot-AD34390、Cot-AD50458、Cot....

圖4qRT-PCR檢測在棉花鹽脅迫時差異基因的表達

圖3棉花根系差異表達基因的GO和KEGG注釋分析3討論

本文編號：3992851