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利用Meta分析挖掘玉米在非生物和生物脅迫誘導(dǎo)下的核心響應(yīng)基因

發(fā)布時間:2024-04-27 00:46
  玉米是世界第一大糧食作物,在全球的飼料作物和工業(yè)原料作物中也占有非常重要的地位。玉米在我國種植區(qū)域廣泛,種植地區(qū)之間的氣候差異較大。作為固著生物,環(huán)境脅迫很大程度上會抑制作物的產(chǎn)量。由于氣候變暖導(dǎo)致極端氣候的增加以及病蟲害對于作物的脅迫,迫切需要開發(fā)出能夠抵御多種脅迫的品種。然而,我們對于玉米如何廣泛地應(yīng)對不同脅迫的響應(yīng)機(jī)制的了解還很有限。本研究中通過對公共數(shù)據(jù)庫中可以獲得的玉米6種非生物脅迫以及4種生物脅迫的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行Meta分析,以鑒定玉米在非生物和生物脅迫下的核心響應(yīng)基因。主要結(jié)果如下:1.對玉米在經(jīng)受干旱3天、干旱6天、冷脅迫、熱脅迫、低氮脅迫、鹽脅迫這6種非生物脅迫的轉(zhuǎn)錄表達(dá)情況進(jìn)行分析,分別鑒定到1208、1246、3218、1668、2662、1411個差異表達(dá)基因。接著利用Meta分析,綜合每個基因在6種脅迫下的P值以及脅迫處理后表達(dá)的差異倍數(shù),共鑒定到425個非生物脅迫核心響應(yīng)基因(metaDEG);同樣,對玉米在經(jīng)受蚜蟲、粘蟲、尾孢菌、炭疽刺盤孢菌屬這4中生物脅迫的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行分析,分別鑒定到682、383、1986、433個差異表達(dá)基因。接著對這4中生物脅迫下基...

【文章頁數(shù)】:94 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖1-1試驗技術(shù)路線圖

圖1-1試驗技術(shù)路線圖

沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文19理解玉米如何在不同環(huán)境脅迫下進(jìn)行響應(yīng)的機(jī)制,并可以應(yīng)用于遺傳育種中提高玉米在環(huán)境脅迫中的耐受性。本研究的技術(shù)路線見圖1-1。圖1-1試驗技術(shù)路線圖Figure1-1Theexperimentaltechnologyroadmap


圖2-1在不同非生物條件下玉米差異表達(dá)基因的數(shù)量Figure2-1Numberofdifferentexpressiongenesinmaizeunderdifferentabioticstress

圖2-1在不同非生物條件下玉米差異表達(dá)基因的數(shù)量Figure2-1Numberofdifferentexpressiongenesinmaizeunderdifferentabioticstress

第二章非生物和生物脅迫下核心響應(yīng)基因(metaDEG)的鑒定22上調(diào)表達(dá)的差異表達(dá)基因和697個下調(diào)表達(dá)的差異表達(dá)基因。在熱脅迫下有1206個上調(diào)表達(dá)的差異表達(dá)基因和1456個下調(diào)表達(dá)的差異表達(dá)基因。在鹽脅迫下有816個上調(diào)表達(dá)的差異表達(dá)基因和595個下調(diào)表達(dá)的差異表達(dá)基因。對玉....


圖2-2在不同生物條件下玉米差異表達(dá)基因的數(shù)量Figure2-2Numberofdifferentexpressiongenesinmaizeunderdifferentabioticstress

圖2-2在不同生物條件下玉米差異表達(dá)基因的數(shù)量Figure2-2Numberofdifferentexpressiongenesinmaizeunderdifferentabioticstress

沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文23圖2-2在不同生物條件下玉米差異表達(dá)基因的數(shù)量Figure2-2Numberofdifferentexpressiongenesinmaizeunderdifferentabioticstress注:橫軸為生物脅迫的類型,縱軸為對應(yīng)每種脅迫下的差異表達(dá)....


圖2-3非生物脅迫和生物脅迫下metaDEG的數(shù)量Figure2-3NumberofmetaDEGunderabioticandbioticstress

圖2-3非生物脅迫和生物脅迫下metaDEG的數(shù)量Figure2-3NumberofmetaDEGunderabioticandbioticstress

第二章非生物和生物脅迫下核心響應(yīng)基因(metaDEG)的鑒定24Zm00001d020780)與物質(zhì)的轉(zhuǎn)運(yùn)(Zm00001d044442和Zm00001d019228)有關(guān)。有15個基因在生物脅迫和非生物脅迫中均下調(diào)表達(dá),其中9個基因(Zm00001d006193、Zm00001....



本文編號:3965106

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