目的識(shí)別與肝細(xì)胞癌(HCC) 5年生存期相關(guān)的關(guān)鍵基因并探討其作用機(jī)制。方法利用癌癥基因組圖譜(TCGA)數(shù)據(jù)庫(kù)獲取HCC基因轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)信息及臨床表型信息,利用R語(yǔ)言中edgeR包將該轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化,篩選log FC絕對(duì)值>2,FDR<0.01的基因作為表達(dá)差異基因,并應(yīng)用DAVID進(jìn)行功能和通路富集分析,構(gòu)建蛋白-蛋白互作網(wǎng)絡(luò)(PPI),選擇PPI連接度(degree)≥8且排名前10位的基因?yàn)楹蜻x關(guān)鍵基因,最后繪制Kaplan-Meier生存曲線鎖定關(guān)鍵基因。結(jié)果共得到383個(gè)與HCC 5年生存期相關(guān)的差異表達(dá)基因,通過(guò)PPI篩選出10個(gè)候選關(guān)鍵基因,進(jìn)行Kaplan-Meier生存分析,最終確定了8個(gè)與HCC 5年生存期密切相關(guān)的關(guān)鍵基因,包括GCG、PTH、HTR5A、CRH、CRHR1、CALCA、ADCY2和GAST。結(jié)論上述關(guān)鍵基因主要參與神經(jīng)內(nèi)分泌調(diào)節(jié),與HCC相關(guān)的研究鮮有報(bào)道,為今后提供新的研究方向。

【文章頁(yè)數(shù)】：5 頁(yè)

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 癌癥基因組圖譜（the cancer genome atlas,TCGA）數(shù)據(jù)下載
    1.2 差異表達(dá)基因分析
    1.3 功能和通路富集分析
    1.4 候選關(guān)鍵基因篩選
    1.5 結(jié)果驗(yàn)證
2 結(jié)果
    2.1 識(shí)別差異表達(dá)基因
    2.2 功能和通路富集分析
    2.3 候選關(guān)鍵基因篩選
    2.4 生存曲線分析
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