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蘋果砧木不定根發(fā)育轉(zhuǎn)錄組及候選基因MdRRs和MdCRFs篩選與表達(dá)分析

發(fā)布時間:2024-04-20 03:11
  不定根發(fā)育在蘋果砧木無性繁殖中起著重要作用。目前,不定根發(fā)育研究主要集中在發(fā)育過程的解剖學(xué)觀察、內(nèi)源激素水平檢測、相關(guān)基因克隆、表達(dá)和功能分析,以及不定根調(diào)控技術(shù)的開發(fā)等,不定根發(fā)育過程中基因共表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)尚未得到很好的確立。為深入研究不定根形成的分子機(jī)理,解析不定根發(fā)育過程中的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò),挖掘關(guān)鍵候選基因,本研究以蘋果砧木‘T337’組培苗為試材,測定內(nèi)源激素含量,對不定根發(fā)生過程進(jìn)行細(xì)胞水平的結(jié)構(gòu)觀察,關(guān)鍵時期進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組測序,并對篩選出的候選基因家族成員進(jìn)行了系統(tǒng)鑒定,利用RT-qPCR檢測其在不同組織和不同發(fā)育時期的表達(dá)模式,為進(jìn)一步研究蘋果砧木不定根發(fā)育分子機(jī)理奠定基礎(chǔ)。研究結(jié)果如下:1確定了蘋果砧木‘T337’不定根的發(fā)育過程的3個關(guān)鍵時期:形成層細(xì)胞分裂期(3-5 d),不定根原基形成期(5-7d),不定根的分化形成期(9-11d)。外源IBA處理顯著誘導(dǎo)了內(nèi)源激素含量變化,其中AUX和BR在S2的含量顯著上調(diào);CTK和JA在S3的含量也顯著上調(diào);GA和ABA在S4含量顯著下調(diào);對不定根發(fā)育4個關(guān)鍵時期高通量測序,共鑒定出4294個與激素、糖信號、機(jī)械傷信號、細(xì)胞周期誘...

【文章頁數(shù)】:102 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖2-1蘋果砧木‘T337’不定根形成過程變化和解剖觀察注:AR形成的時間過程:S1(階段1)表示莖基部接入生根培養(yǎng)基(0d);S2(階段2)表示莖基

圖2-1蘋果砧木‘T337’不定根形成過程變化和解剖觀察注:AR形成的時間過程:S1(階段1)表示莖基部接入生根培養(yǎng)基(0d);S2(階段2)表示莖基

第二章蘋果砧木不定根發(fā)育的轉(zhuǎn)錄組152.3結(jié)果與分析2.3.1蘋果砧‘T337’不定根生過程的形態(tài)學(xué)觀察在對照處理條件下蘋果砧木‘T337’在4個時期不產(chǎn)生不定根(圖2-1)。在IBA處理條件下,蘋果砧木‘T337’在S4時期形成愈傷組織并分化為根(圖2....


圖2-2不定根形成過程中蘋果砧木‘T337’莖基部(生根區(qū))中的激素含量和激素比變化

圖2-2不定根形成過程中蘋果砧木‘T337’莖基部(生根區(qū))中的激素含量和激素比變化

表現(xiàn)出先上升后下降的變化趨勢(圖2-2A)。赤霉素(GA)在S2時含量最高(圖2-2A)。脫落酸(ABA)在S1時的含量較低,而在S2,S3和S4時期差異不顯著(圖2-2A)。油菜素內(nèi)酯(BR)在S3時含量最高,從S3到S4顯著下降28%。茉莉素....


圖2-4蘋果砧木‘T337’不定根形成過程中生長素相關(guān)的差異基因的表達(dá)模式

圖2-4蘋果砧木‘T337’不定根形成過程中生長素相關(guān)的差異基因的表達(dá)模式

蘋果砧木不定根發(fā)育轉(zhuǎn)錄組及候選基因MdRRs和MdCRFs篩選與表達(dá)分析20IBA處理條件下,ARF9相對表達(dá)水平從S1到S2的表現(xiàn)出顯著性上調(diào)(圖2-4B)。ARF1和ARF11的相對表達(dá)水平從S2到S3顯著性下調(diào)(圖2-4B)。PIN1....


圖2-5蘋果砧木‘T337’不定根形成過程中細(xì)胞分裂素相關(guān)差異基因在莖基部的表達(dá)模式

圖2-5蘋果砧木‘T337’不定根形成過程中細(xì)胞分裂素相關(guān)差異基因在莖基部的表達(dá)模式

鑒定與細(xì)胞分裂素相關(guān)的差異表達(dá)基因可見附錄:表S5。代表性的基因包括細(xì)胞分裂素響應(yīng)因子(CRF4),細(xì)胞分裂素氧化酶基因(CKX7),組氨酸基酶1(AHK1)和細(xì)胞分裂素響應(yīng)因子1(GATA1)等。將篩選的差異表達(dá)基因進(jìn)行聚類分析(圖2-5A),并在不定根形成期間使用R....



本文編號:3958785

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