水稻作為一種重要的經(jīng)濟農(nóng)作物,為全世界超過百分之五十的人口提供糧作物。水稻在長期進化的過程中受到自然選擇的作用,部分重要的優(yōu)勢性狀得以保留并在不斷的人工馴化過程中獲得很好的提升,從而讓水稻更好地抵御來自外界的生物或非生物脅迫。本研究利用轉(zhuǎn)錄組分析方法比較兩種不同亞種的栽培水稻Nipponbare(粳稻,japonicarice cultivar)和 93-11(秈稻,indica rice cultivar)在響應(yīng)子囊菌稻瘟病菌(Pyriculariaoryzae)的方式上的不同。從檢測到的差異表達基因集中,我們發(fā)現(xiàn)兩種水稻在響應(yīng)稻瘟病菌侵染有很大差異,并且在進化上高度保守的直系同源基因所表現(xiàn)出的表達差異性是兩種水稻對稻瘟病菌差異響應(yīng)的一個重要因素。進一步分析結(jié)果表明直系同源基因上游啟動子區(qū)域的高水平核酸多態(tài)性與它們的差異性基因表達模式呈現(xiàn)正相關(guān),而由啟動子區(qū)域的核酸多態(tài)性所造成的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點多態(tài)性是這些響應(yīng)稻瘟病菌的直系同源基因在兩種水稻中展現(xiàn)出差異表達模式的重要原因。從這些結(jié)果我們可以總結(jié)出粳稻和秈稻在受到長期自然選擇和人工馴化的過程中可能進化出兩種不同的機制來抵御稻瘟病菌的侵...

【文章頁數(shù)】：49 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖２－１實驗材料處理的流程??Ｆｉｇ?２－１?Ｔｈｅ?ｗｏｒｋｆｌｏｗ?ｏｆ?ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔ??

２．２．１實驗材料處理流程??所選取的Ｎｉｐｐｏｎｂａｒｅ和９３－１１水稻種子于田間栽培，待水稻長出適宜的葉??苗后放置黑暗環(huán)境下生長。實驗材料的處理如圖２－１所示。取一組未接種稻瘟??病菌的水稻苗并提取ＲＮＡ做為對照組。另取一組水稻苗分別接種ＦＪ８１２７８和??Ｇｕｙｌｌ兩種稻....

圖２－３?Ｒｅａｄｓ中每個位點的堿基分布及質(zhì)量分布

魯?Ｌｏｗ?Ｑｕａｌｉｔｙ：?０．６１％??？?Ｃｌｅａｎ?Ｒｅａｄｓ：?９８．９０％??圖２－４原始測序數(shù)據(jù)中被過濾的數(shù)據(jù)??Ｆｉｇ．２－４?Ｔｈｅ?ｆｉｌｔｅｒｅｄ?ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ?ｒｅａｄｓ?ｉｎ?ｒａｗ?ｒｅａｄｓ?ｄａｔａ??１０??

圖２－４原始測序數(shù)據(jù)中被過濾的數(shù)據(jù)??Ｆｉｇ．２－４?Ｔｈｅ?ｆｉｌｔｅｒｅｄ?ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ?ｒｅａｄｓ?ｉｎ?ｒａｗ?ｒｅａｄｓ?ｄａｔａ??

ｐｏｓｉｔｉｏｎ?ａｌｏｎｇ?ｒｅａｄｓ??Ｏ??圖２－３?Ｒｅａｄｓ中每個位點的堿基分布及質(zhì)量分布。橫坐標為堿基在ｒｅａｄｓ中的位置，縱坐??標為減基的百分比，左右各半表示雙端測序數(shù)據(jù)的ｌｅｆｔ?ｒｅａｄｓ和ｒｉｇｈｔ?ｒｅａｄｓ，Ｑ２０和Ｑ３０??分別表示堿基質(zhì)量９９％和９９....

圖３－２?３０個樣本原始測序數(shù)據(jù)的過濾結(jié)果，其中ｘ軸代表三十個樣本的名字，ｙ軸代表雙??端ｒｅａｄｓ的數(shù)量，不同顏色代表不同類型的測序數(shù)據(jù)

?ｍｍｍｍ??ＦＪ８７：?ＦＪ８１２７８?ＧＹ１１：?Ｇｕｙ１１??圖３－１兩種菌株對兩個水稻品種的致病性檢測??Ｆｉｇ?３－１?Ｐａｔｈｏｇｅｎｉｃｉｔｙ?ｏｆ?ｔｗｏ?ｉｓｏｌａｔｅｓ?ｉｎ?ｔｗｏ?ｒｉｃｅ?ｃｕｌｔｉｖａｒｓ??４Ｅ？０７?ＢＨｉｇｈ?Ｑｕａｌｉｔｙ?■ｒ....

本文編號：3957850