發(fā)布時(shí)間：2024-03-31 05:37

　　【目的】為探索StBCK1基因功能的重要影響位點(diǎn)。【方法】通過(guò)CTAB法提取了玉米大斑病菌4個(gè)小種的基因組DNA,克隆StBCK1基因的關(guān)鍵序列,利用DNAMAN、MEGA和NetPhos2.0 Server比對(duì)了玉米大斑病菌不同小種間的遺傳差異,并分析StBCK1的蛋白質(zhì)磷酸化位點(diǎn)。【結(jié)果】StBCK1的蛋白質(zhì)激酶結(jié)構(gòu)域位于DNA序列的4155～5016位,肽鏈的1385～1672位;在DNA序列比對(duì)中發(fā)現(xiàn)3個(gè)SNP位點(diǎn);1個(gè)位點(diǎn)導(dǎo)致氨基酸由亮氨酸轉(zhuǎn)變?yōu)楸奖彼?2個(gè)位點(diǎn)導(dǎo)致絲氨酸突變?yōu)楫惲涟彼岷吞於０吠蛔優(yōu)楫惲涟彼?3個(gè)位點(diǎn)差異均與蛋白質(zhì)磷酸化位點(diǎn)相關(guān)。【結(jié)論】3個(gè)位點(diǎn)的多態(tài)性影響了蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能,進(jìn)而影響了玉米大斑病菌的致病性差異。

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【部分圖文】：

圖1基因組DNA的瓊脂糖凝膠檢測(cè)

通過(guò)比較玉米大斑病菌不同小種的StBCK1基因的功能結(jié)構(gòu)域序列發(fā)現(xiàn),11-29E與其它小種相比,第2位堿基由G突變?yōu)門(mén),發(fā)生了顛換;01-23、NY001和其他4種菌株相比,第243位堿基由C突變?yōu)門(mén),發(fā)生了轉(zhuǎn)換;11-29E與其它小種相比,第860位堿基由A突變?yōu)門(mén),發(fā)生了....

圖2StBCK1蛋白激酶結(jié)構(gòu)域的位置

圖1基因組DNA的瓊脂糖凝膠檢測(cè)2.4功能結(jié)構(gòu)域氨基酸序列變化

圖3DNA序列比對(duì)結(jié)果

在氨基酸序列的第1位氨基酸的比對(duì)(圖4)發(fā)現(xiàn)11-29E與其他致病小種相比,氨基酸由絲氨酸變?yōu)楫惲涟彼釣殄e(cuò)義突變,該變化會(huì)影響α螺旋的形成,使其含量減少,可能導(dǎo)致MAPK信號(hào)通路相關(guān)蛋白接受信號(hào)后同源二聚化的形成。第89位氨基酸的比對(duì)中01-23、NY001和其他4種菌株相比,氨....

圖4蛋白質(zhì)序列比對(duì)

圖3DNA序列比對(duì)結(jié)果圖5StBCK1基因的氨基酸序列磷酸化位點(diǎn)預(yù)測(cè)

本文編號(hào)：3943528