為了探究AUX/IAA家族基因在結(jié)球甘藍(lán)葉片與莖尖發(fā)育過程中的功能,篩選出對(duì)甘藍(lán)葉片與莖尖發(fā)育具重要影響的相關(guān)AUX/IAA基因。試驗(yàn)以結(jié)球甘藍(lán)品系"519"為材料,通過對(duì)蓮座期葉片與莖尖,結(jié)球期葉片與莖尖的轉(zhuǎn)錄組比較分析,篩選出在兩個(gè)組織中均表達(dá)差異顯著的2個(gè)AUX/IAA基因,分別為BoIAA2與BoIAA19。采用PCR技術(shù)分別獲得基因BoIAA2與BoIAA19的編碼序列,其CDS(coding sequence)全長分別為519 bp、585 bp,編碼172、194個(gè)氨基酸;進(jìn)一步序列分析發(fā)現(xiàn)BoIAA2、BoIAA19分別與大白菜BrIAA2、油菜BnIAA19氨基酸同源相似性均達(dá)99%,且均具有AUX/IAA蛋白的DomainⅠ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ特異性結(jié)構(gòu)域。利用熒光定量PCR分析表明BoIAA2和BoIAA19在葉片、莖尖中的表達(dá)量均呈現(xiàn)出結(jié)球期高于蓮座期的變化趨勢(shì),與轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果相符;對(duì)其結(jié)合蛋白基因BoTIR1和BoARF8進(jìn)行表達(dá)分析,結(jié)果顯示二者與BoIAA2、BoIAA19在葉片、莖尖中不同時(shí)期的表達(dá)量變化趨勢(shì)一致;由此,推測(cè)BoIAA2和BoIAA19可能通過...

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試驗(yàn)材料
    1.2 葉片卷曲指數(shù)的測(cè)定
    1.3 甘藍(lán)總RNA的提取
    1.4 轉(zhuǎn)錄組差異基因的篩選及基因克隆驗(yàn)證
    1.5 生物信息學(xué)分析
    1.6 AUX/IAA家族基因Bo IAA2與Bo IAA19的表達(dá)分析
    1.7 外源IAA誘導(dǎo)后基因Bo IAA2與Bo IAA19的表達(dá)分析
    1.8 AUX/IAA結(jié)合蛋白基因Bo ARF8和Bo TIR1的表達(dá)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 轉(zhuǎn)錄組篩選AUX/IAA家族基因
    2.2 Bo IAA2與Bo IAA19的基因克隆與分析
    2.3 Bo IAA2與Bo IAA19基因的生物信息學(xué)分析
        2.3.1 甘藍(lán)Bo IAA2基因的序列分析
        2.3.2 甘藍(lán)Bo IAA19基因的序列分析
        2.3.3 甘藍(lán)AUX/IAA蛋白的亞細(xì)胞定位
        2.3.4 甘藍(lán)AUX/IAA蛋白核定位信號(hào)NLS預(yù)測(cè)
        2.3.5 甘藍(lán)AUX/IAA蛋白序列比對(duì)及保守域分析
    2.4 甘藍(lán)Bo IAA2、Bo IAA19及其同源氨基酸序列的進(jìn)化樹分析
    2.5 基因Bo IAA2與Bo IAA19在甘藍(lán)不同時(shí)期的表達(dá)分析
    2.6 外源IAA誘導(dǎo)后基因Bo IAA2與Bo IAA19的表達(dá)分析
    2.7 AUX/IAA結(jié)合蛋白基因Bo ARF8和Bo TIR1的表達(dá)分析
3 討論



本文編號(hào)：3943301