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番茄轉(zhuǎn)錄因子基因SlWRKY16的克隆及原核表達(dá)分析

發(fā)布時(shí)間:2024-03-21 03:51
  從栽培番茄(Solanumlycopersicum)‘M82’中克隆到1個(gè)WRKY家族基因SlWRKY16。研究結(jié)果顯示:SlWRKY16包含1 497 bp的完整開放讀碼框,編碼498個(gè)氨基酸,理論分子量為55.5 kD,含有1個(gè)WRKYGQK保守結(jié)構(gòu)域和C2H2鋅指結(jié)構(gòu)域,屬于Ⅱb類WRKY轉(zhuǎn)錄因子基因,且定位于細(xì)胞膜上;栽培番茄Sl WRKY16與潘那利番茄Sp WRKY6(XP015064265.1)、馬鈴薯St WRKY6(XP006350473.1)同源性最高。qRT-PCR結(jié)果顯示SlWRKY16在番茄不同組織中均有表達(dá),葉片中的表達(dá)量最高;短時(shí)間非生物脅迫下該基因的表達(dá)量顯著降低。此外,重組菌pET-30a-SlWRKY16在NaCl、甘露醇脅迫下生長均明顯低于對照菌pET-30a。綜上,番茄SlWRKY16基因可能在響應(yīng)非生物脅迫過程中具有負(fù)調(diào)控效應(yīng)。

【文章頁數(shù)】:11 頁

【部分圖文】:

圖1番茄SlWRKY16的PCR擴(kuò)增

圖1番茄SlWRKY16的PCR擴(kuò)增

SlWRKY16的啟動(dòng)子區(qū)含有大量光響應(yīng)元件和ABA、赤霉素、茉莉酸甲酯等激素響應(yīng)元件(表2),暗示其可能是1個(gè)誘導(dǎo)型啟動(dòng)子,受光等因素誘導(dǎo)表達(dá),進(jìn)而參與非生物脅迫響應(yīng)。SlWRKY16包含498個(gè)氨基酸,理論分子量約為55.5kD,等電點(diǎn)為8.17,推測的分子式為C2389H....


圖2SlWRKY16與不同物種WRKY轉(zhuǎn)錄因子氨基酸序列多重比對

圖2SlWRKY16與不同物種WRKY轉(zhuǎn)錄因子氨基酸序列多重比對

對SlWRKY16及19個(gè)同源序列進(jìn)行比對,并用MEGA5.0構(gòu)建進(jìn)化樹。結(jié)果(圖3)顯示:SlWRKY16與潘那利番茄SpWRKY6(XP_015064265.1)高度同源(97.85%),其次馬鈴薯StWRKY6(XP_006350473.1,92%),與美花煙草NsWRK....


圖3SlWRKY16與其他植物WRKY蛋白質(zhì)的系統(tǒng)進(jìn)化樹分析

圖3SlWRKY16與其他植物WRKY蛋白質(zhì)的系統(tǒng)進(jìn)化樹分析

為了進(jìn)一步探索了SlWRKY16在栽培番茄‘M82’不同組織以及受鹽和干旱脅迫的誘導(dǎo)下的表達(dá)情況,qRT-PCR分析結(jié)果顯示,該基因在根、莖、葉中均有表達(dá),且葉片中表達(dá)量最高(圖5,A);在200mmol·L-1NaCl或15%PEG6000的5h短時(shí)間脅迫下,SlWRKY....


圖4SlWRKY16的亞細(xì)胞定位

圖4SlWRKY16的亞細(xì)胞定位

圖3SlWRKY16與其他植物WRKY蛋白質(zhì)的系統(tǒng)進(jìn)化樹分析圖5SlWRKY16的轉(zhuǎn)錄表達(dá)模式分析



本文編號:3933785

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