發(fā)布時間：2024-03-10 05:41

　　該文為探究MAPK15基因的結(jié)構(gòu)和功能,根據(jù)冬瓜(Benincasa hispida (Thunb.) Cogn.)轉(zhuǎn)錄組高通量測序結(jié)果,采用RT-PCR方法從冬瓜中分離得到MAPK15基因的完整編碼序列,命名為BhMAPK15。序列分析表明,BhMAPK15開放閱讀框(ORF)長1 704 bp,編碼567個氨基酸。亞細胞定位預測表明,BhMAPK15可能定位于細胞核或細胞質(zhì)。以NCBI數(shù)據(jù)庫為基礎(chǔ),從數(shù)據(jù)庫中獲得模式植物水稻、擬南芥和其他不同物種間的MAPK15家族成員,分析該基因與這些成員的氨基酸序列、保守基序,并構(gòu)建系統(tǒng)進化樹。經(jīng)系統(tǒng)進化樹分析表明,BhMAPK15屬于D組家族成員,與甜瓜、南瓜、黃瓜和苦瓜的相似性較高。氨基酸序列和保守基序結(jié)果表明,該基因家族成員保守性較高。實時熒光定量PCR分析表明,BhMAPK15在不同組織器官中均有表達,且非生物脅迫處理可以上調(diào)BhMAPK15的表達水平。上述研究結(jié)果表明,BhMAPK15基因可能在冬瓜響應非生物脅迫中發(fā)揮作用。

【文章頁數(shù)】：12 頁

【部分圖文】：

圖1冬瓜BhMAPK15基因ORF擴增結(jié)果

利用課題組前期獲得的冬瓜轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果,對MAPK基因進行搜索,初步得到冬瓜MAPK候選基因。利用NCBI數(shù)據(jù)庫對候選基因結(jié)構(gòu)域、ORF完整性等方面進行驗證,最終得到1個具有完整ORF的MAPK基因序列。根據(jù)基因的序列設(shè)計ORF引物,冬瓜葉片cDNA為模板,進行PCR擴增,結(jié)果發(fā)....

圖2冬瓜BhMAPK15核苷酸序列及其相應的氨基酸序列

圖1冬瓜BhMAPK15基因ORF擴增結(jié)果2.2冬瓜BhMAPK15氨基酸序列分析

圖3冬瓜BhMAPK15三級結(jié)構(gòu)預測

利用SOPMA預測BhMAPK15蛋白二級結(jié)構(gòu),結(jié)果顯示,無規(guī)則卷曲(randomcoil)、α螺旋(alphahelix)為該蛋白主要構(gòu)成元件,分別占蛋白總氨基酸的41.80%和40.92%;利用Phyre2預測BhMAPK15蛋白三級結(jié)構(gòu),結(jié)果如圖3所示。圖4冬瓜BhM....

圖4冬瓜BhMAPK15蛋白親疏水性分析

圖3冬瓜BhMAPK15三級結(jié)構(gòu)預測利用DNAMAN5.0對BhMAPK15氨基酸序列預測分析。結(jié)果(圖4A和圖4B)表明,BhMAPK15第219位的半胱氨酸(Cys)分值最高(2.61),疏水性最強,第130位的苯丙氨酸(Phe)分值最低(–1.86),親水性最強。同時從....

本文編號：3924328