目的分析江蘇省腮腺炎病毒(Mumps virus,MuV)流行株SH基因特征和G基因型MuV全基因序列特征。方法對江蘇省2013-2015年流行性腮腺炎病例的咽拭子標(biāo)本進(jìn)行MuV分離和基因分型,分析F和G基因型MuV的SH基因特征;對G基因型MuV進(jìn)行全基因序列測定和拼接,重點分析F、HN和N蛋白基因特征。結(jié)果共獲得2013-2015年178株F基因型和6株G基因型MuV流行株。SH基因親緣關(guān)系樹顯示,F、G基因型流行株與其參考株之間核苷酸遺傳距離分別為0.048-0.010、0.032-0.054,且G基因型形成兩個獨立分支。全基因序列分析顯示,G基因型MuV的HN蛋白出現(xiàn)N-糖基化位點增加或減少,發(fā)生HN蛋白E356D、Y442S、I279T和I287V變異、N蛋白L457A、T466N、M492I和N495H變異以及F蛋白K101R變異。結(jié)論江蘇省2013-2015年MuV流行株以F基因型為主;并發(fā)現(xiàn)G基因型MuV且發(fā)生一定變異。

【文章頁數(shù)】：6 頁

【部分圖文】：

圖1江蘇省2013-2015年MuV流行株SH基因親緣關(guān)系樹

5株G基因型MuV流行株全基因序列測定成功，基因組全長均為15345個核苷酸，未發(fā)現(xiàn)核苷酸或氨基酸插入和缺失，其全基因組與A基因型疫苗株（JL株、S79株）、其他國家G基因型、N基因型MuV的核苷酸平均遺傳距離分別為0.069、0.014、0.041。將5株MuV全基因組....

圖2江蘇省2013-2015年G基因型MuV全基因組親緣關(guān)系樹

圖1江蘇省2013-2015年MuV流行株SH基因親緣關(guān)系樹以JL(AF338106）、S79(HQ416906）疫苗株為參考株，5株G基因型MuV流行株的全基因序列有129-131個氨基酸位點變異，與JL株、S79疫苗株均存在25個N-糖基化位點，其中HN蛋白的N12S變....

本文編號：3920192