不同植物Mlo基因全基因組鑒定及系統(tǒng)進化分析
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【部分圖文】:
圖117個物種進化時間樹
對29種代表性植物進行系統(tǒng)進化分析,得到了17種植物的進化時間樹(圖1)。其中,褐藻門植物長囊水云(Ectocarpussiliculosus)于1768百萬年前最先獨立出來,隨后16種植物分化形成3個分支,一支為金牛鴕球藻(Ostreococcustauri)和鞭毛藻(Os....
圖2植物Mlo保守基序分布
此外,25對直系同源基因被鑒定(表3),其中10對來自毛果楊,8對來自葡萄,7對來自二穗短柄草,6對來自玉米,黃瓜、水稻和無油樟各4對,3對來自藻類,1對來自擬南芥;28對旁系同源基因被鑒定(表3),其中8對來自毛果楊,4對來自擬南芥,番茄、玉米和小立碗蘚各3對,黃瓜和江南卷柏各....
圖3植物Mlo基因染色體定位,基因簇和基因重復
高等植物Mlo含5~8個跨膜螺旋結(jié)構(gòu),大多數(shù)為7個;而不同藻類變化較大,整體較高等植物略少。信號肽是用于引導蛋白跨膜轉(zhuǎn)移的N端活性多肽(龍芳等,2013),本研究發(fā)現(xiàn)只有部分Mlo具有信號肽,這與陳玲等(2012)低等植物都有一個信號肽的結(jié)論不盡一致,可能與物種進化及自身特性有關(guān)....
圖4164個植物Mlo系統(tǒng)發(fā)育樹
系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建有助于分析基因間的進化關(guān)系。本研究發(fā)現(xiàn)164個Mlo可聚為Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ三個區(qū)組,被子植物Mlo主要聚在ⅠA組,江南卷柏Mlo聚在ⅠA組和ⅢB組,小立碗蘚Mlo聚在ⅠB組和ⅢA組,幾乎所有藻類Mlo聚在Ⅱ組。推測Mlo基因可能出現(xiàn)在苔蘚植物分化之后、蕨類植物分化之前,....
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