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基于代謝組學(xué)的轉(zhuǎn)基因水稻生物安全評(píng)價(jià)方法研究

發(fā)布時(shí)間:2024-02-21 18:20
  代謝組學(xué)因其全面無(wú)偏向性、非靶標(biāo)輪廓分析的技術(shù)優(yōu)勢(shì),成為目前轉(zhuǎn)基因生物安全評(píng)價(jià)技術(shù)研究的熱點(diǎn)。以轉(zhuǎn)基因抗蟲水稻及其非轉(zhuǎn)基因受體為研究對(duì)象,采用基于超高效液相色譜-四級(jí)桿-飛行時(shí)間串聯(lián)質(zhì)譜(UPLC-QTOF/MS)分析的轉(zhuǎn)基因作物代謝組評(píng)價(jià)技術(shù)流程,對(duì)代謝組提取方法、數(shù)據(jù)處理方法、分析平臺(tái)等進(jìn)行了探索。結(jié)果表明,應(yīng)用80%甲醇水能有效提取水稻苗期葉片中的代謝物;經(jīng)UPLC分離、QTOF/MS分析、正交校正的偏最小二乘辨別分析(OPLS-DA)等計(jì)算方法,能夠有效發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)基因水稻及其受體之間的差異代謝物。本研究建立的完整的轉(zhuǎn)基因水稻代謝組分析方法具有分辨率高、易掌握的優(yōu)點(diǎn)。本研究豐富了現(xiàn)有的轉(zhuǎn)基因生物安全評(píng)價(jià)的內(nèi)容和方法,為轉(zhuǎn)基因生物安全管理提供技術(shù)支撐。

【文章頁(yè)數(shù)】:8 頁(yè)

【部分圖文】:

圖1不同濃度提取溶劑下BPI圖

圖1不同濃度提取溶劑下BPI圖

對(duì)優(yōu)化的代謝組分析方法的穩(wěn)定性、精密度和重復(fù)性進(jìn)行了考察。同一份樣品提取液分別放置0h、5h、10h、20h、30h、40h之后,進(jìn)行UPLC-QTOF分析,其相對(duì)保留時(shí)間的RSD<5%,主要共有峰面積的RSD≤7%,說(shuō)明樣品提取溶液至少在40h內(nèi)基本保持穩(wěn)定;精密....


圖7差異代謝物在兩組樣本中的分布情況

圖7差異代謝物在兩組樣本中的分布情況

3.2代謝組學(xué)分析平臺(tái)本研究的目標(biāo)為建立一套完整的轉(zhuǎn)基因水稻代謝組生物安全評(píng)價(jià)技術(shù)流程,包括外界脅迫處理、取樣節(jié)點(diǎn)和組織、樣品前處理、樣品代謝組分析、數(shù)據(jù)處理、代謝途徑和非預(yù)期效應(yīng)分析等步驟。在代謝組分析過程中,常用的代謝組學(xué)分析技術(shù)有核磁共振(NMR)[20]、氣質(zhì)聯(lián)用(GC....


圖2轉(zhuǎn)基因水稻及其受體苗期葉片的PCA分析圖

圖2轉(zhuǎn)基因水稻及其受體苗期葉片的PCA分析圖

應(yīng)用基于R語(yǔ)言的軟件包MAIT對(duì)代謝組數(shù)據(jù)進(jìn)行數(shù)據(jù)處理。該軟件的分析步驟包括peakdetection、peakannotation、statisticalanalysis,具備PCA、OPLS-DA、SVM、KNN等預(yù)測(cè)、統(tǒng)計(jì)分析功能。對(duì)苗期樣本進(jìn)行、代謝組差異篩選、差異....


圖449個(gè)差異代謝物在兩組樣本中的分布情況

圖449個(gè)差異代謝物在兩組樣本中的分布情況

圖5轉(zhuǎn)基因抗蟲水稻苗期葉片代謝物相關(guān)性分析通過相關(guān)性分組(圖5)和歐式距離分組(圖6),均獲得差異代謝物為21597、21401、3221、11767、9152、23412。其含量詳細(xì)信息見圖7。



本文編號(hào):3905728

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