PLA3基因生物信息學分析及在赤霉素調(diào)控水稻種子萌發(fā)中的作用
發(fā)布時間:2024-01-25 14:43
水稻(Oryza sativa) PLA3基因編碼谷氨酸羧肽酶,影響種子萌發(fā)等生長發(fā)育過程。本研究運用CRISPRCas9技術(shù)獲得‘日本晴’水稻pla3突變體,該突變體具有胚變大、易萌發(fā)的表型。通過對PLA3蛋白進行多物種同源比對和進化分析,發(fā)現(xiàn)其具有較高的保守性。對PLA3基因的時空表達和響應(yīng)不同激素的表達進行了分析,發(fā)現(xiàn)其在胚中表達較高,并受赤霉素(GA)等誘導。同時對PLA3蛋白的亞細胞定位、種子萌發(fā)過程中GA的含量及轉(zhuǎn)錄組學差異等進行分析,結(jié)果表明:PLA3定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng);野生型與pla3種子萌發(fā)中不同階段(12和30 h)胚內(nèi)GA含量差異較大;轉(zhuǎn)錄組測序篩選獲得與GA信號途徑相關(guān)的41個差異基因; pla3中信號途徑基因如GID2表達出現(xiàn)明顯上調(diào)。綜上所述, PLA3基因與種子萌發(fā)相關(guān)并參與GA調(diào)控種子萌發(fā)的過程。
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料與試劑
1.2 生物信息學分析
1.3 PLA3亞細胞定位實驗
1.4 用LC-MS/MS測定GA含量的方法
1.5 轉(zhuǎn)錄組測序
2 實驗結(jié)果
2.1 PLA3基因生物信息學相關(guān)分析
2.1.1 PLA3蛋白系統(tǒng)進化樹構(gòu)建
2.1.2 PLA3基因時空表達特異性分析
2.1.3 PLA3基因響應(yīng)植物激素的表達分析
2.1.4 PLA3蛋白亞細胞定位
2.2 PLA3對種子萌發(fā)的影響及其與GA的關(guān)系
2.2.1 PLA3對種子萌發(fā)的影響
2.2.2 野生型與pla3種子萌發(fā)過程中GA含量的差異比較
2.2.3 野生型與pla3種子萌發(fā)過程中轉(zhuǎn)錄組差異基因分析
3 討論
本文編號:3885007
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料與試劑
1.2 生物信息學分析
1.3 PLA3亞細胞定位實驗
1.4 用LC-MS/MS測定GA含量的方法
1.5 轉(zhuǎn)錄組測序
2 實驗結(jié)果
2.1 PLA3基因生物信息學相關(guān)分析
2.1.1 PLA3蛋白系統(tǒng)進化樹構(gòu)建
2.1.2 PLA3基因時空表達特異性分析
2.1.3 PLA3基因響應(yīng)植物激素的表達分析
2.1.4 PLA3蛋白亞細胞定位
2.2 PLA3對種子萌發(fā)的影響及其與GA的關(guān)系
2.2.1 PLA3對種子萌發(fā)的影響
2.2.2 野生型與pla3種子萌發(fā)過程中GA含量的差異比較
2.2.3 野生型與pla3種子萌發(fā)過程中轉(zhuǎn)錄組差異基因分析
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