斑馬魚尾鰭再生中相關(guān)基因的表達及血根堿對其再生過程的影響
發(fā)布時間:2023-11-24 18:55
再生,即發(fā)育成熟的個體,受到機械或自然傷害后的組織,仍然存在在原有基礎(chǔ)上發(fā)育成完整個體的能力。與哺乳動物相反的是,硬骨魚魚鰭組織在剪鰭后具有很強的再生潛能,其尾鰭再生過程是研究組織再生分子基礎(chǔ)的一個重要模型。最近,斑馬魚作為組織或器官遺傳學(xué)研究的模式脊椎動物而出現(xiàn),對傷害的反應(yīng),斑馬魚主要的鰭結(jié)構(gòu)再生的非?,在剪鰭或損傷后,由各種再生相關(guān)基因表達引起級聯(lián)反應(yīng),使得丟失尾鰭結(jié)構(gòu)仍然能夠恢復(fù)到原來的大小。因為基質(zhì)金屬蛋白酶(matrix metalloproteinases,MMPs)與細胞外基質(zhì)(extracellular matrix,ECM)的降解和重塑有關(guān),能夠影響細胞遷移,是細胞外基質(zhì)在健康、疾病、發(fā)育、再生過程中周轉(zhuǎn)的關(guān)鍵酶。所以,我們又對mmp9和mmp13這兩個基因進行生物信息學(xué)分析,在NCBI GeneBank中,查找到mmp9 cDNA序列全長2801 bp,其中102bp的5ˊUTR區(qū)和656 bp的3ˊUTR區(qū),ORF長2043 bp,編碼680個氨基酸序列,相對分子質(zhì)量是76589.27 Da,等電點pI為5.63。對蛋白的二級結(jié)構(gòu)分析發(fā)現(xiàn)α螺旋有145個,占2...
【文章頁數(shù)】:71 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
1 前言
1.1 再生的研究
1.1.1 再生生長機制
1.1.2 不同組織再生研究
1.2 魚鰭再生研究
1.2.1 魚鰭再生的發(fā)現(xiàn)
1.2.2 斑馬魚魚鰭基本結(jié)構(gòu)
1.2.3 斑馬魚魚鰭再生過程
1.2.4 尾鰭再生相關(guān)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)組織
1.2.5 基質(zhì)金屬蛋白酶及可能參與魚鰭再生的其它基因
1.3 血根堿對炎癥的抗性以及對再生的促進作用
1.4 魚鰭再生研究現(xiàn)狀及目的和意義
1.4.1 魚鰭再生研究現(xiàn)狀
1.4.2 魚鰭再生研究的目的和意義
2 材料與方法
2.1 材料
2.1.1 實驗動物
2.1.2 克隆載體和宿主菌
2.1.3 常用儀器和設(shè)備
2.1.4 主要試劑
2.1.5 主要溶液配方
2.2 方法
2.2.1 再生魚鰭RNA的提取
2.2.2 反轉(zhuǎn)錄cDNA
2.2.3 制備斑馬魚尾鰭再生石蠟切片
2.2.4 石蠟切片HE染色
2.2.5 血根堿飼養(yǎng)斑馬魚
2.2.6 實時熒光定量(Real-time quantitative PCR)
2.2.7 原位雜交研究mmp9和mmp13兩個基因在尾鰭再生部位的表達
3 結(jié)果與分析
3.1 再生尾鰭RNA的提取
3.2 魚鰭再生的形態(tài)學(xué)分析
3.3 mmp9和mmp13基因序列分析
3.3.1 mmp9基因序列分析
3.3.2 mmp13基因序列分析
3.4 基因mmp9和mmp13在魚鰭再生過程中的表達模式
3.4.1 基因mmp9和mmp13表達水平分析
3.4.2 原位雜交結(jié)果分析
3.5 血根堿溶液最終濃度的確定
3.6 血根堿溶液處理后再生尾鰭的形態(tài)學(xué)變化
3.7 血根堿處理對mmp9和mmp13的表達水平的影響
3.8 血根堿處理對魚鰭再生相關(guān)基因表達水平的影響
4 討論
4.1 斑馬魚尾鰭再生中的基因表達水平分析
4.2 血根堿處理對魚鰭再生中基因表達的影響
4.3 結(jié)論和展望
參考文獻
致謝
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文目錄
本文編號:3866396
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摘要
ABSTRACT
1 前言
1.1 再生的研究
1.1.1 再生生長機制
1.1.2 不同組織再生研究
1.2 魚鰭再生研究
1.2.1 魚鰭再生的發(fā)現(xiàn)
1.2.2 斑馬魚魚鰭基本結(jié)構(gòu)
1.2.3 斑馬魚魚鰭再生過程
1.2.4 尾鰭再生相關(guān)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)網(wǎng)絡(luò)組織
1.2.5 基質(zhì)金屬蛋白酶及可能參與魚鰭再生的其它基因
1.3 血根堿對炎癥的抗性以及對再生的促進作用
1.4 魚鰭再生研究現(xiàn)狀及目的和意義
1.4.1 魚鰭再生研究現(xiàn)狀
1.4.2 魚鰭再生研究的目的和意義
2 材料與方法
2.1 材料
2.1.1 實驗動物
2.1.2 克隆載體和宿主菌
2.1.3 常用儀器和設(shè)備
2.1.4 主要試劑
2.1.5 主要溶液配方
2.2 方法
2.2.1 再生魚鰭RNA的提取
2.2.2 反轉(zhuǎn)錄cDNA
2.2.3 制備斑馬魚尾鰭再生石蠟切片
2.2.4 石蠟切片HE染色
2.2.5 血根堿飼養(yǎng)斑馬魚
2.2.6 實時熒光定量(Real-time quantitative PCR)
2.2.7 原位雜交研究mmp9和mmp13兩個基因在尾鰭再生部位的表達
3 結(jié)果與分析
3.1 再生尾鰭RNA的提取
3.2 魚鰭再生的形態(tài)學(xué)分析
3.3 mmp9和mmp13基因序列分析
3.3.1 mmp9基因序列分析
3.3.2 mmp13基因序列分析
3.4 基因mmp9和mmp13在魚鰭再生過程中的表達模式
3.4.1 基因mmp9和mmp13表達水平分析
3.4.2 原位雜交結(jié)果分析
3.5 血根堿溶液最終濃度的確定
3.6 血根堿溶液處理后再生尾鰭的形態(tài)學(xué)變化
3.7 血根堿處理對mmp9和mmp13的表達水平的影響
3.8 血根堿處理對魚鰭再生相關(guān)基因表達水平的影響
4 討論
4.1 斑馬魚尾鰭再生中的基因表達水平分析
4.2 血根堿處理對魚鰭再生中基因表達的影響
4.3 結(jié)論和展望
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