肝癌大數(shù)據(jù)基礎上的雙基因聯(lián)合預后標記物篩選及INTS8預后效能分析
發(fā)布時間:2023-08-29 22:13
目的肝細胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)是全球第六大常見腫瘤,也是癌癥相關死亡的第三大原因。目前,HCC的治療主要以臨床分期作為指導,尤其是巴塞羅那分期(BCLC)被廣泛接受和應用。HCC的治療方法主要有手術切除、局部消融、化療、肝移植、經(jīng)導管肝動脈化療栓塞(TACE)或動脈內(nèi)灌注化療等。肝切除術為主的綜合治療是現(xiàn)階段首選和最常用的治療手段,但患者術后5年生存率只有60%左右。術后復發(fā)是威脅肝癌患者長期生存的主要原因。肝癌復發(fā)是一個多因素、多基因參與的過程,目前人們對其復雜的分子機制尚未完全闡明。為了更好地了解和揭示肝癌復發(fā)的新機制,發(fā)現(xiàn)肝癌治療的新靶點,進一步改善肝癌患者的預后,迫切需要尋找有效的診斷和預后生物標志物。方法1.首先在pubmed上通過肝細胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)、總生存期(Overall survival,OS)、無疾病生存期(Disease-free survival,DFS)關鍵詞搜索,找到與癌癥相關的基因。下載TCGA數(shù)據(jù)并對已找到癌癥基因表達量進行賦值,利用Kaplan-Meier分析單基...
【文章頁數(shù)】:95 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
個人簡歷
英漢縮略詞對照表
摘要
ABSTRACT
第一部分 基于TCGA數(shù)據(jù)庫的肝癌相關基因預后生物標記物的篩選
1.前言
2.研究對象與方法
2.1 檢索關鍵詞和文獻納入標準
2.2 TCGA隊列樣本信息
2.3 基于TCGA數(shù)據(jù)分析與HCC預后相關的基因
2.4 基因的蛋白質(zhì)相互作用預測
3.統(tǒng)計學方法
4.結(jié)果
4.1 基于文本挖掘篩選肝癌預后標記物基因
4.2 TCGA樣本信息
4.3 基于TCGA數(shù)據(jù)庫篩選17 個與肝癌預后相關的基因
4.4 基因組合的HCC預后能力評估
4.5 蛋白質(zhì)相互作用預測結(jié)果
5.討論
第二部分 INTS8 編碼蛋白表達水平與HCC患者預后關系
1.前言
2.材料和方法
2.1 主要試劑
2.2 設備
2.3 方法
2.4 結(jié)果判讀
3.統(tǒng)計學方法
4.結(jié)果
4.1 90 例樣本基本信息
4.2 90 例肝癌樣本INTS8 免疫組化染色結(jié)果
4.3 INTS8 在癌和癌旁表達差異
4.4 INTS8 表達與HCC患者預后的關系
5.討論
小結(jié)與展望
結(jié)論
參考文獻
綜述 CDT1與腫瘤預后相關研究
參考文獻
致謝
本文編號:3844385
【文章頁數(shù)】:95 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
個人簡歷
英漢縮略詞對照表
摘要
ABSTRACT
第一部分 基于TCGA數(shù)據(jù)庫的肝癌相關基因預后生物標記物的篩選
1.前言
2.研究對象與方法
2.1 檢索關鍵詞和文獻納入標準
2.2 TCGA隊列樣本信息
2.3 基于TCGA數(shù)據(jù)分析與HCC預后相關的基因
2.4 基因的蛋白質(zhì)相互作用預測
3.統(tǒng)計學方法
4.結(jié)果
4.1 基于文本挖掘篩選肝癌預后標記物基因
4.2 TCGA樣本信息
4.3 基于TCGA數(shù)據(jù)庫篩選17 個與肝癌預后相關的基因
4.4 基因組合的HCC預后能力評估
4.5 蛋白質(zhì)相互作用預測結(jié)果
5.討論
第二部分 INTS8 編碼蛋白表達水平與HCC患者預后關系
1.前言
2.材料和方法
2.1 主要試劑
2.2 設備
2.3 方法
2.4 結(jié)果判讀
3.統(tǒng)計學方法
4.結(jié)果
4.1 90 例樣本基本信息
4.2 90 例肝癌樣本INTS8 免疫組化染色結(jié)果
4.3 INTS8 在癌和癌旁表達差異
4.4 INTS8 表達與HCC患者預后的關系
5.討論
小結(jié)與展望
結(jié)論
參考文獻
綜述 CDT1與腫瘤預后相關研究
參考文獻
致謝
本文編號:3844385
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