基于TCGA數(shù)據(jù)庫的腎癌自噬相關基因預后模型的建立與應用
發(fā)布時間:2023-08-06 18:42
目的利用TCGA數(shù)據(jù)庫建立預測腎透明細胞癌預后的自噬相關基因預后模型,分析自噬相關基因預后模型與腎透明細胞癌各臨床病理特征之間的關系。方法通過R語言軟件篩選出TCGA數(shù)據(jù)庫中腎透明細胞癌樣本及正常樣本中差異表達的自噬相關基因,Cox比例風險回歸模型從中篩選和建立多基因預后模型,計算預后評分。根據(jù)預后評分的中位數(shù)將患者分為高風險組和低風險組。利用Kaplan-Meier生存曲線分析高風險組及低風險組生存差異。將臨床病理因素和預后評分因素納入Cox回歸模型分析腎透明細胞癌患者的生存影響因素。根據(jù)臨床病理因素與腎癌自噬相關基因預后模型預后評分的相關性,驗證多基因模型對腎透明細胞癌患者中的預后價值。結(jié)果共篩選出8個差異基因(BNIP3、ATG16L2、CASP4、RGS19、EIF4EBP1、CX3CL1、SPHK1、BID)建立腎癌自噬相關基因預后模型。預后風險評分(RS)公式為:RS=0.274×ATG16L2的表達量-0.294×BNIP3的表達量+0.415×CASP4的表達量-0.424×RGS19的表達量+0.238×EIF4EBP1的表達量-0.199×CX3CL1的表達量+0....
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 一般資料
1.2 研究方法
1.3 統(tǒng)計學方法
2 結(jié)果
2.1 自噬相關差異基因的篩選
2.2 自噬相關差異基因多基因預后模型的建立
2.3 TCGA數(shù)據(jù)庫中選取的腎透明細胞癌患者的臨床特征
2.4 腎透明細胞癌患者生存影響因素的Cox回歸分析及多指標ROC曲線
2.5 腎癌自噬相關基因預后模型臨床相關性分析
3 討論
本文編號:3839849
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1 材料與方法
1.1 一般資料
1.2 研究方法
1.3 統(tǒng)計學方法
2 結(jié)果
2.1 自噬相關差異基因的篩選
2.2 自噬相關差異基因多基因預后模型的建立
2.3 TCGA數(shù)據(jù)庫中選取的腎透明細胞癌患者的臨床特征
2.4 腎透明細胞癌患者生存影響因素的Cox回歸分析及多指標ROC曲線
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