發(fā)布時間：2023-05-27 01:53

　　物種之間的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系及物種形成過程一直以來都是進(jìn)化生物家研究的焦點。系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系重建可以清楚地顯示物種之間的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,而物種形成過程的研究能夠從本質(zhì)上解釋物種進(jìn)化的進(jìn)程。隨著測序技術(shù)的發(fā)展,計算機(jī)科學(xué)及生物信息學(xué)軟件的開發(fā)給系統(tǒng)發(fā)育分析及物種形成過程的研究注入了新的活力。櫟屬物種存在廣泛的種間雜交,引起了植物分類學(xué)家們的注意。然而,關(guān)于櫟屬物種的界定和種間系統(tǒng)發(fā)育的相關(guān)研究非常有限。本文中,依據(jù)蒙古櫟(Quercus mongolica)和歐洲夏櫟(Q.robur)的轉(zhuǎn)錄組序列,開發(fā)了19對在白櫟組(section Quercus)中直系同源的單拷貝核基因序列。使用5個葉綠體位點,探討葉綠體DNA變異在中國分布的白櫟組物種中的共享情況,從而進(jìn)一步探討葉綠體序列變異在白櫟組物種界定研究中的局限性。最后,利用19個單拷貝核基因序列的數(shù)據(jù)對在中國和日本分布的白櫟組進(jìn)行了物種界定,以及中國白櫟組的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系研究。主要研究結(jié)果如下:1)根據(jù)蒙古櫟和夏櫟的轉(zhuǎn)錄組序列開發(fā)了19個位點單拷貝基因序列標(biāo)記,通過所開發(fā)的引物擴(kuò)增櫟屬白櫟組、土耳其櫟組和紅櫟組部分物種的DNA樣品,發(fā)現(xiàn)這些標(biāo)記可在櫟...

【文章頁數(shù)】：79 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第一章 緒論
    1.1 引言
        1.1.1 研究背景
        1.1.2 國內(nèi)外研究現(xiàn)狀及評述
    1.2 研究目標(biāo)和主要研究內(nèi)容
        1.2.1 關(guān)鍵的科學(xué)問題與研究目標(biāo)
        1.2.2 主要研究內(nèi)容
第二章 白櫟組單拷貝核基因標(biāo)記的開發(fā)及其在物種形成中分析中的應(yīng)用
    2.1 材料與方法
        2.1.1 試驗材料
        2.1.2 引物設(shè)計
        2.1.3 引物篩選
        2.1.4 PCR擴(kuò)增及測序
        2.1.5 序列比對和核苷酸多樣性
        2.1.6 系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系的重建
        2.1.7 貝葉斯聚類分析及對比
        2.1.8 蒙古櫟和遼東櫟的分化
    2.2 結(jié)果與分析
        2.2.1 試驗結(jié)果
        2.2.2 試驗分析
    2.3 小結(jié)
第三章 白櫟組葉綠體變異研究
    3.1 材料與方法
        3.1.1 試驗材料
        3.1.2 分子標(biāo)記實驗
        3.1.3 序列數(shù)據(jù)分析
    3.2 結(jié)果與分析
        3.2.1 試驗結(jié)果
        3.2.2 試驗分析
    3.3 小結(jié)
第四章 白櫟組分子系統(tǒng)發(fā)育學(xué)的研究
    4.1 材料與方法
        4.1.1 試驗材料
        4.1.2 PCR擴(kuò)增及測序
        4.1.3 數(shù)據(jù)分析
    4.2 結(jié)果與分析
        4.2.1 試驗結(jié)果
        4.2.2 試驗分析
    4.3 小結(jié)
第五章 結(jié)論
    5.1 結(jié)論
    5.2 展望
參考文獻(xiàn)
在讀期間的學(xué)術(shù)研究
致謝??



本文編號：3823669