源自野生二粒小麥高籽粒蛋白含量的候選基因分析
發(fā)布時間:2023-04-29 18:23
小麥籽粒蛋白含量(GPC)與小麥營養(yǎng)和加工品質(zhì)密切相關(guān)。但是,由于小麥GPC和產(chǎn)量的負相關(guān)性,在長期聚焦高產(chǎn)的育種目標指導下,致使現(xiàn)代育成普通小麥品種的GPC較低。野生二粒小麥(Triticum turgidum ssp.dicoccoides,2n=4x=28,AABB)具有高GPC特性,并能通過遠緣雜交提高普通小麥的GPC,但由于GPC這一性狀的復雜性,使得GPC相關(guān)候選基因的研究進展緩慢。前人研究表明,NAM-B1基因與GPC密切相關(guān)。本課題前期研究發(fā)現(xiàn),以含有功能型NAM-B1基因的野生二粒小麥D1和D97為父本,分別與不含功能型NAM-B1基因的低蛋白弱筋普通小麥品種(Triticum aestivum,2n=6x=42,AABBDD)川農(nóng)16(CN16)雜交并連續(xù)自交獲得的穩(wěn)定高世代株系中,BAd107-4(CN16×D1)含有功能型NAM-B1基因,并且含有高的GPC;BAd7-209(CN16×D97)不含功能型NAM-B1基因,卻仍然具有較高的GPC;BAd23-1(CN16×D97)不含有功能型NAM-B1基因,具有低的GPC。可見,在野生二粒小麥中還具有NAM-B...
【文章頁數(shù)】:82 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 文獻綜述
1.1 小麥及小麥籽粒蛋白含量的重要性
1.2 小麥籽粒蛋白含量相關(guān)的基因和QTL定位
1.3 野生二粒小麥的重要性
1.4 野生二粒小麥遠緣雜交對普通小麥籽粒蛋白含量的改良
1.5 野生二粒小麥中與籽粒蛋白含量相關(guān)位點的研究
1.6 二代測序技術(shù)
1.7 二代測序技術(shù)在小麥候選基因發(fā)掘上的應(yīng)用
1.8 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)
1.9 本研究的目的與意義
第二章 野生二粒小麥D1漸滲系的籽粒蛋白含量相關(guān)的候選基因分析
2.1 前言
2.2 材料與方法
2.2.1 研究材料
2.2.2 RNA提取、文庫構(gòu)建以及Illumina測序
2.2.3 農(nóng)藝性狀調(diào)查和籽粒蛋白含量的測定
2.2.4 測序數(shù)據(jù)的質(zhì)控和過濾
2.2.5 基因表達水平分析
2.2.6 RNA-seq相關(guān)性分析
2.2.7 基因差異表達分析
2.2.8 差異表達基因的功能注釋
2.2.9 qRT-PCR的表達驗證以及引物設(shè)計
2.2.10 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建
2.3 結(jié)果
2.3.1 BAd107-4 及親本農(nóng)藝性狀和籽粒蛋白含量分析
2.3.2 BAd107-4 及親本灌漿期籽粒轉(zhuǎn)錄組分析
2.3.3 中國春作為參考基因組的轉(zhuǎn)錄組分析
2.3.4 野生二粒小麥作為參考基因組的轉(zhuǎn)錄組分析
2.3.5 籽粒蛋白含量密切相關(guān)的候選基因
2.4 討論
2.4.1 野生二粒小麥D1 豐富的籽粒蛋白相關(guān)位點及其向普通小麥的整合效應(yīng)
2.4.2 野生二粒小麥D1中特異的氮素代謝相關(guān)基因及其對普通小麥籽粒蛋白的影響
2.4.3 野生二粒小麥優(yōu)異的儲藏蛋白基因?qū)ζ胀ㄐ←溩蚜5鞍椎挠绊?br>第三章 野生二粒小麥D97漸滲系高籽粒蛋白含量的候選基因分析
3.1 前言
3.2 材料和方法
3.2.1 研究材料
3.2.2 RNA提取、文庫構(gòu)建以及Illumina測序
3.2.3 農(nóng)藝性狀調(diào)查和籽粒蛋白含量測定
3.2.4 測序數(shù)據(jù)的質(zhì)控和過濾
3.2.5 基因表達水平分析
3.2.6 RNA-seq相關(guān)性分析
3.2.7 基因差異表達分析
3.2.8 差異表達基因的功能注釋
3.2.9 qRT-PCR的表達驗證以及引物設(shè)計
3.2.10 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建
3.3 結(jié)果
3.3.1 田間農(nóng)藝性狀調(diào)查
3.3.2 BAd7-209、BAd23-1及其親本灌漿期籽粒轉(zhuǎn)錄組分析
3.3.3 以中國春為參考基因組的差異基因分析
3.3.4 以野生二粒小麥為參考基因組的差異基因分析
3.3.5 籽粒蛋白含量密切相關(guān)的候選基因
3.3.6 qRT-PCR驗證
3.4 討論
3.4.1 源自D97 籽粒蛋白含量相關(guān)的候選基因
3.4.2 蛋白質(zhì)在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上的加工相關(guān)基因及其對普通小麥籽粒蛋白的影響
3.4.3 蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)換,翻譯后修飾,分子伴侶相關(guān)基因及其對普通小麥籽粒蛋白的影響
3.4.4 儲藏蛋白基因?qū)ζ胀ㄐ←溩蚜5鞍椎挠绊?br> 3.4.5 D1和D97 及其后代的小麥籽粒蛋白含量形成機制比較
3.5 結(jié)論
3.6 創(chuàng)新性
參考文獻
致謝
作者簡歷
本文編號:3805502
【文章頁數(shù)】:82 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 文獻綜述
1.1 小麥及小麥籽粒蛋白含量的重要性
1.2 小麥籽粒蛋白含量相關(guān)的基因和QTL定位
1.3 野生二粒小麥的重要性
1.4 野生二粒小麥遠緣雜交對普通小麥籽粒蛋白含量的改良
1.5 野生二粒小麥中與籽粒蛋白含量相關(guān)位點的研究
1.6 二代測序技術(shù)
1.7 二代測序技術(shù)在小麥候選基因發(fā)掘上的應(yīng)用
1.8 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)
1.9 本研究的目的與意義
第二章 野生二粒小麥D1漸滲系的籽粒蛋白含量相關(guān)的候選基因分析
2.1 前言
2.2 材料與方法
2.2.1 研究材料
2.2.2 RNA提取、文庫構(gòu)建以及Illumina測序
2.2.3 農(nóng)藝性狀調(diào)查和籽粒蛋白含量的測定
2.2.4 測序數(shù)據(jù)的質(zhì)控和過濾
2.2.5 基因表達水平分析
2.2.6 RNA-seq相關(guān)性分析
2.2.7 基因差異表達分析
2.2.8 差異表達基因的功能注釋
2.2.9 qRT-PCR的表達驗證以及引物設(shè)計
2.2.10 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建
2.3 結(jié)果
2.3.1 BAd107-4 及親本農(nóng)藝性狀和籽粒蛋白含量分析
2.3.2 BAd107-4 及親本灌漿期籽粒轉(zhuǎn)錄組分析
2.3.3 中國春作為參考基因組的轉(zhuǎn)錄組分析
2.3.4 野生二粒小麥作為參考基因組的轉(zhuǎn)錄組分析
2.3.5 籽粒蛋白含量密切相關(guān)的候選基因
2.4 討論
2.4.1 野生二粒小麥D1 豐富的籽粒蛋白相關(guān)位點及其向普通小麥的整合效應(yīng)
2.4.2 野生二粒小麥D1中特異的氮素代謝相關(guān)基因及其對普通小麥籽粒蛋白的影響
2.4.3 野生二粒小麥優(yōu)異的儲藏蛋白基因?qū)ζ胀ㄐ←溩蚜5鞍椎挠绊?br>第三章 野生二粒小麥D97漸滲系高籽粒蛋白含量的候選基因分析
3.1 前言
3.2 材料和方法
3.2.1 研究材料
3.2.2 RNA提取、文庫構(gòu)建以及Illumina測序
3.2.3 農(nóng)藝性狀調(diào)查和籽粒蛋白含量測定
3.2.4 測序數(shù)據(jù)的質(zhì)控和過濾
3.2.5 基因表達水平分析
3.2.6 RNA-seq相關(guān)性分析
3.2.7 基因差異表達分析
3.2.8 差異表達基因的功能注釋
3.2.9 qRT-PCR的表達驗證以及引物設(shè)計
3.2.10 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建
3.3 結(jié)果
3.3.1 田間農(nóng)藝性狀調(diào)查
3.3.2 BAd7-209、BAd23-1及其親本灌漿期籽粒轉(zhuǎn)錄組分析
3.3.3 以中國春為參考基因組的差異基因分析
3.3.4 以野生二粒小麥為參考基因組的差異基因分析
3.3.5 籽粒蛋白含量密切相關(guān)的候選基因
3.3.6 qRT-PCR驗證
3.4 討論
3.4.1 源自D97 籽粒蛋白含量相關(guān)的候選基因
3.4.2 蛋白質(zhì)在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上的加工相關(guān)基因及其對普通小麥籽粒蛋白的影響
3.4.3 蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)換,翻譯后修飾,分子伴侶相關(guān)基因及其對普通小麥籽粒蛋白的影響
3.4.4 儲藏蛋白基因?qū)ζ胀ㄐ←溩蚜5鞍椎挠绊?br> 3.4.5 D1和D97 及其后代的小麥籽粒蛋白含量形成機制比較
3.5 結(jié)論
3.6 創(chuàng)新性
參考文獻
致謝
作者簡歷
本文編號:3805502
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