凹線仙女蜆Cytb基因片段序列分析及系統(tǒng)進(jìn)化樹初步構(gòu)建
發(fā)布時間:2023-04-28 00:38
初步探究凹線仙女蜆的系統(tǒng)發(fā)育地位,為凹線仙女蜆的分子遺傳學(xué)研究提供前期數(shù)據(jù)。采用PCR方法擴(kuò)增得到凹線仙女蜆Cyrenobatissa subsulcata線粒體細(xì)胞色素b (Cytb)基因片段序列,序列長為624bp,并在NCBI上使用NT數(shù)據(jù)庫進(jìn)行Blast比對分析,進(jìn)而構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,探討凹線仙女蜆的分類地位。結(jié)果顯示NT數(shù)據(jù)庫中未見凹線仙女蜆的Cytb基因信息。研究擴(kuò)增獲得的序列與蜆屬其他種的Cytb基因片段有88%的相似性,與其他簾蛤目貝類的相似度77.02%~78.53%,表明擴(kuò)增出的片段是凹線仙女蜆?biāo)赜械腃ytb基因片段�;贙imura′s 2-Parameter模型計(jì)算得出,3個樣本個體的遺傳距離僅為0~0.001 6,遠(yuǎn)小于蜆屬內(nèi)種間遺傳距離(0.002~0.114),與蜆屬的遺傳距離為0.127~0.144、與簾蛤目簾蛤科種類遺傳距離為0.282~0.335。進(jìn)化樹顯示,凹線仙女蜆樣品獨(dú)立聚為一支,與蜆屬聚為一大支,支持度為99,表明仙女蜆屬與蜆屬的親緣關(guān)系較近,與簾蛤科的遺傳距離較遠(yuǎn)。
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.1.1 凹線仙女蜆樣本信息
1.1.2 試驗(yàn)儀器
1.1.3 試驗(yàn)試劑
1.2 試驗(yàn)方法
1.2.1 形態(tài)學(xué)性狀測定
1.2.2 凹線仙女蜆基因組DNA的提取
1.2.3 凹線仙女蜆Cytb基因片段的克隆和序列測定
1.3 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 凹線仙女蜆形態(tài)學(xué)性狀分析
2.2 凹線仙女蜆Cytb基因片段分析
2.2.1 凹線仙女蜆基因組DNA的提取
2.2.2 凹線仙女蜆Cytb基因片段擴(kuò)增
2.2.3 凹線仙女蜆Cytb基因片段比對分析
2.2.4 凹線仙女蜆Cytb基因片段序列
2.2.5 凹線仙女蜆Cytb基因片段序列特征分析
2.2.6 凹線仙女蜆種群內(nèi)遺傳距離
2.2.7 凹線仙女蜆與參比種的屬間遺傳距離
2.2.8 凹線仙女蜆的系統(tǒng)進(jìn)化樹
3 討論
本文編號:3803392
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1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.1.1 凹線仙女蜆樣本信息
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1.1.3 試驗(yàn)試劑
1.2 試驗(yàn)方法
1.2.1 形態(tài)學(xué)性狀測定
1.2.2 凹線仙女蜆基因組DNA的提取
1.2.3 凹線仙女蜆Cytb基因片段的克隆和序列測定
1.3 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 凹線仙女蜆形態(tài)學(xué)性狀分析
2.2 凹線仙女蜆Cytb基因片段分析
2.2.1 凹線仙女蜆基因組DNA的提取
2.2.2 凹線仙女蜆Cytb基因片段擴(kuò)增
2.2.3 凹線仙女蜆Cytb基因片段比對分析
2.2.4 凹線仙女蜆Cytb基因片段序列
2.2.5 凹線仙女蜆Cytb基因片段序列特征分析
2.2.6 凹線仙女蜆種群內(nèi)遺傳距離
2.2.7 凹線仙女蜆與參比種的屬間遺傳距離
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