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基于線粒體Cytb基因序列的西江流域廣西境內(nèi)卷口魚(yú)遺傳多樣性分析

發(fā)布時(shí)間:2023-04-23 02:01
  為了解西江流域廣西境內(nèi)卷口魚(yú)(Ptychidio jordani)種群遺傳結(jié)構(gòu)及分化程度,采用線粒體Cytb基因序列對(duì)西江流域廣西境內(nèi)6個(gè)江段的139尾野生卷口魚(yú)的遺傳多樣性進(jìn)行了分析。結(jié)果顯示,線粒體Cytb基因長(zhǎng)度為1 053 bp,堿基T、C、A、G的平均含量分別為29.1%、27.7%、29.3%、13.9%,其中A+T (58.4%)高于C+G(41.6%)。共定義20個(gè)單倍型,并聚為2個(gè)分支,未觀察到明顯的地理聚群。6個(gè)卷口魚(yú)群體的平均單倍型多樣性和平均核苷酸多樣性分別為0.768 2、0.002 3,其中紅水河群體(單倍型多樣性h=0.748 7,核苷酸多樣性π=0.003 3)遺傳多樣性最高,柳江群體(h=0.274 4,π=0.000 4)和左江群體(h=0.374 7,π=0.000 3)的遺傳多樣性相對(duì)較低。卷口魚(yú)總體的遺傳分化指數(shù)(FST)為0.461 4 (P<0.01),表現(xiàn)出較大的遺傳分化。兩兩群體間遺傳分化結(jié)果顯示,左江和柳江種群之間的遺傳分化程度最大,而柳江和西江之間最小。AMOVA分析表明西江流域的卷口魚(yú)群體遺傳變異一半來(lái)...

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