海島棉5個CBF/DREB基因的克隆與表達分析
發(fā)布時間:2023-04-15 14:26
低溫、干旱和鹽漬是影響作物生長、產(chǎn)量和全球地理分布的重要非生物脅迫。CBF/DREB轉錄因子是參與植物非生物脅迫應答反應的重要調控蛋白。為了更好地了解棉花CBF家族基因,通過生物信息學的方法,從海島棉中克隆了5個具有完整開放閱讀框的CBF基因,命名為Gb CBF1―Gb CBF5。這5個基因編碼的蛋白與其他植物冷脅迫相關的CBF蛋白具有高度的保守性,含有1個AP2功能結構域和2個特征基序。系統(tǒng)進化樹分析表明,這5個基因與擬南芥的3個參與冷脅迫的CBF基因一起聚類在DREB亞家族中的A-1亞組。通過RT-PCR的方法分析了海島棉基因Gb CBF1―5在高鹽(200 mmol·L-1 Na Cl)、干旱、4℃低溫等非生物脅迫處理下的表達模式。結果表明其中2個基因在冷脅迫下上調表達,5個基因在干旱和鹽處理下均下調表達。這些為進一步探索CBF基因在棉花逆境脅迫應激反應中的作用提供了有價值的信息。
【文章頁數(shù)】:10 頁
【文章目錄】:
1 材料和方法
1.1 材料培養(yǎng)與處理
1.2 總RNA的提取和c DNA的制備
1.3 棉花CBF基因的克隆
1.4 棉花Gb CBF基因的生物信息學分析
1.5 棉花Gb CBF基因的半定量RT-PCR
2 結果與分析
2.1 5 個Gb CBF基因的克隆與序列分析
2.2 5 個Gb CBF基因編碼的氨基酸序列比對分析
2.3 與陸地棉CBF同源基因的比對結果
2.4 5 個棉花Gb CBF蛋白的系統(tǒng)進化樹分析
2.5 5 個Gb CBF基因編碼蛋白的三級結構預測
2.6 非生物脅迫處理下5 個Gb CBF基因的表達譜分析
3 討論與結論
本文編號:3791019
【文章頁數(shù)】:10 頁
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1 材料和方法
1.1 材料培養(yǎng)與處理
1.2 總RNA的提取和c DNA的制備
1.3 棉花CBF基因的克隆
1.4 棉花Gb CBF基因的生物信息學分析
1.5 棉花Gb CBF基因的半定量RT-PCR
2 結果與分析
2.1 5 個Gb CBF基因的克隆與序列分析
2.2 5 個Gb CBF基因編碼的氨基酸序列比對分析
2.3 與陸地棉CBF同源基因的比對結果
2.4 5 個棉花Gb CBF蛋白的系統(tǒng)進化樹分析
2.5 5 個Gb CBF基因編碼蛋白的三級結構預測
2.6 非生物脅迫處理下5 個Gb CBF基因的表達譜分析
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