發(fā)布時間：2023-03-26 12:50

　　本論文運用形態(tài)學(xué)和分子生物學(xué)的鑒定分析方法,對采集自山西省不同地區(qū)的番茄枯萎病罹病植株中所分離的鐮孢菌進行了病原種類鑒定和遺傳多樣性分析;運用生物信息學(xué)的方法,利用STRING蛋白互作網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫、Cytoscape軟件和DAVID在線分析工具,構(gòu)建了尖孢鐮孢菌番茄�；途瓴煌虏∫蜃拥牡鞍谆プ骶W(wǎng)絡(luò),并對預(yù)測的相關(guān)基因進行了分析;基于生物信息學(xué)的分析結(jié)果,采用實時熒光定量PCR法,對選取的尖孢鐮孢菌番茄專化型的樞紐基因、致病相關(guān)功能基因、pri-milRNAs、milRNAs靶基因和番茄病程相關(guān)基因進行基因表達(dá)研究。旨在明確引起山西省番茄枯萎病害的主要病原種類及其遺傳分化特征、病原菌侵染寄主時所涉及樞紐基因的互作調(diào)控機制及生物學(xué)功能以及尖孢鐮孢菌侵染寄主相關(guān)基因的分子功能及調(diào)控機制等。此外,本論文還采用形態(tài)學(xué)觀察、致病性測定和分子標(biāo)記等方法,對禾谷鐮孢菌和層出鐮孢菌繼代培養(yǎng)菌株的生物學(xué)特性和遺傳多樣性進行了研究,以探尋野生菌株繼代培養(yǎng)對菌株遺傳變異的影響。主要研究結(jié)果如下:1.山西省番茄枯萎病的病原共有4種,分別為尖孢鐮孢菌、茄病鐮孢菌、輪枝鐮孢菌和串珠鐮孢菌膠孢變種。其中,尖孢鐮孢菌...

【文章頁數(shù)】：151 頁

【學(xué)位級別】：博士

【文章目錄】：
摘要
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1. 鐮孢菌的分類研究概況
    2. 尖孢鐮孢菌分類鑒定及遺傳多樣性的研究概況
        2.1 尖孢鐮孢菌的鑒定研究概況
            2.1.1 尖孢鐮孢菌�；秃蜕硇》N的傳統(tǒng)分類鑒定方法
            2.1.2 尖孢鐮孢菌專化型和生理小種的分子鑒定方法
        2.2 尖孢鐮孢菌的遺傳多樣性及系統(tǒng)發(fā)育學(xué)研究進展
    3. 生物信息學(xué)技術(shù)在鐮孢菌致病機理研究中的運用
        3.1 鐮孢菌基因組學(xué)的研究概況
        3.2 鐮孢菌生物信息數(shù)據(jù)庫
        3.3 基于生物信息數(shù)據(jù)庫序列分析技術(shù)在鐮孢菌研究中的應(yīng)用
        3.4 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)研究涉及的生物信息學(xué)工具介紹
    4. 鐮孢菌與寄主互作機制研究概況
        4.1 鐮孢菌侵染植物分子機制研究概況
        4.2 植物抗病分子機制研究概況
    5. 植物病原真菌菌株變異研究概況
        5.1 植物病原真菌變異的遺傳機制
        5.2 菌種退化現(xiàn)象及應(yīng)對策略
        5.3 正確合理應(yīng)用菌種退化
    6. 本研究的意義和內(nèi)容
第二章 山西番茄枯萎病菌種類鑒定及遺傳多樣性分析
    1 材料與方法
        1.1 材料
        1.2 方法
    2 結(jié)果與分析
        2.1 番茄枯萎病病原的形態(tài)學(xué)鑒定結(jié)果
        2.2 尖孢鐮孢菌分子生物學(xué)鑒定結(jié)果
        2.3 尖孢鐮孢菌番茄�；蜕硇》N鑒定結(jié)果
        2.4 菌株致病性測定結(jié)果
        2.5 尖孢鐮孢菌ISSR遺傳多樣性分析結(jié)果
    3 結(jié)論與討論
第三章 基于蛋白互作網(wǎng)絡(luò)尖鐮孢致病樞紐基因研究
    1 材料與方法
        1.1 數(shù)據(jù)收集
        1.2 軟件工具
        1.3 尖孢鐮孢菌致病因子蛋白互作網(wǎng)絡(luò)及模塊的構(gòu)建
        1.4 基因功能富集分析
        1.5 尖孢鐮孢菌致病蛋白互作網(wǎng)絡(luò)樞紐基因篩選及蛋白互作網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建
    2 結(jié)果與分析
        2.1 尖孢鐮孢菌各個致病因子的蛋白互作網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建與核心模塊分析
        2.2 尖孢鐮孢菌致病樞紐基因篩選及蛋白互作網(wǎng)絡(luò)模塊構(gòu)建
    3 結(jié)論與討論
        3.1 尖孢鐮孢菌各致病因子蛋白互作網(wǎng)絡(luò)及基因分析
        3.2 尖孢鐮孢菌致病樞紐基因篩選及蛋白互作網(wǎng)絡(luò)模塊構(gòu)建
第四章 尖孢鐮孢菌-寄主互作中相關(guān)基因的表達(dá)研究
    1 材料與方法
        1.1 供試菌種
        1.2 供試寄主
        1.3 接種及取樣方法
        1.4 DNA和RNA的提取與反轉(zhuǎn)錄合成單鏈cDNA
        1.5 基因表達(dá)的實時熒光定量PCR分析
        1.6 數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析
    2 結(jié)果與分析
        2.1 尖孢鐮孢菌與寄主互作中致病相關(guān)基因表達(dá)分析
        2.2 尖孢鐮孢菌與寄主互作中番茄幼苗相關(guān)抗性基因表達(dá)分析
    3 結(jié)論與討論
第五章 尖孢鐮孢菌milRNA調(diào)控功能研究
    1 材料與方法
        1.1 實驗材料
        1.2 實驗方法
    2 結(jié)果與分析
        2.1 pri-milRNA和milRNA靶基因引物設(shè)計與篩選
        2.2 milRNA與其靶基因的生物信息學(xué)分析
        2.3 milRNA及其靶基因的基因表達(dá)分析
    3 結(jié)論與討論
第六章 鐮孢菌繼代培養(yǎng)菌株生物學(xué)特性及遺傳多樣性研究
    1 材料與方法
        1.1 供試材料
        1.2 菌株繼代培養(yǎng)
        1.3 繼代培養(yǎng)菌株生物學(xué)特性研究
        1.4 繼代培養(yǎng)菌株致病力測定
        1.5 繼代培養(yǎng)菌株遺傳多樣性研究
    2 結(jié)果與分析
        2.1 繼代培養(yǎng)菌株生物學(xué)特性研究
        2.2 繼代培養(yǎng)菌株的致病力測定
        2.3 繼代培養(yǎng)菌株遺傳多樣性研究
    3 結(jié)論與討論
第七章 總結(jié)
    1 山西番茄枯萎病病原研究結(jié)果
    2 尖孢鐮孢菌致病樞紐基因及其蛋白互作網(wǎng)絡(luò)模塊的研究結(jié)果
        2.1 尖孢鐮孢菌各致病因子蛋白互作網(wǎng)絡(luò)及基因分析結(jié)果
        2.2 尖孢鐮孢菌致病樞紐基因篩選及蛋白互作網(wǎng)絡(luò)模塊構(gòu)建
    3 尖孢鐮孢菌和番茄病程相關(guān)基因表達(dá)模式研究結(jié)果
        3.1 尖孢鐮孢菌致病相關(guān)基因表達(dá)研究結(jié)果
        3.2 番茄病程相關(guān)基因表達(dá)研究結(jié)果
    4 尖孢鐮孢菌milRNA基因調(diào)控機制研究結(jié)果
    5 鐮孢菌遺傳變異的研究結(jié)果
參考文獻(xiàn)
Abstract
攻讀博士期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
致謝



本文編號：3770989