石斑魚(Epinephelus spp.)以其味道鮮美、營養(yǎng)豐富、肉質(zhì)細(xì)嫩成為熱帶和亞熱帶地區(qū)最受歡迎的養(yǎng)殖品種之一。本課題組前期開展了褐點(diǎn)石斑魚(Epinephelus fuscoguttatus,♀)×清水石斑魚(E.polyphekadion,♂)雜交育種研究,并成功完成雜交石斑魚子一代的培育。該雜交石斑魚在免疫應(yīng)答、抗病力等方面的表現(xiàn)尚不清晰,本研究圍繞雜交石斑魚及其母本褐點(diǎn)石斑魚在免疫應(yīng)答方面的差異開展了以下研究:1、雜交石斑魚和褐點(diǎn)石斑魚免疫相關(guān)組織的轉(zhuǎn)錄組測序采用Illumina/Hiseq-2000 RNA-Seq技術(shù)對雜交石斑魚[褐點(diǎn)石斑魚(E.fuscoguttatus,♀)×清水石斑魚(E.polyphekadion,♂)]和褐點(diǎn)石斑魚注射polyI:C 24h后的脾臟和頭腎進(jìn)行RNA-seq測序。共得到62,238條高質(zhì)量unigenes,平均長度為1,150bp,N50為2,499bp。功能注釋結(jié)果顯示,至少有27,305(43.94%)個(gè)unigenes在一個(gè)數(shù)據(jù)庫中被注釋,有11,622(23.07%)個(gè)unigenes在4個(gè)數(shù)據(jù)庫中都被注釋。根據(jù)差異基因...

【文章頁數(shù)】：69 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
1 文獻(xiàn)綜述
    1.1 雜交機(jī)制研究進(jìn)展
        1.1.1 顯性假說
        1.1.2 超顯性假說
        1.1.3 上位性假說
    1.2 雜交石斑魚的研究進(jìn)展
        1.2.1 石斑魚的介紹
        1.2.2 石斑魚雜交優(yōu)勢的初步探究
    1.3 轉(zhuǎn)錄組技術(shù)及其在硬骨魚類中的應(yīng)用
        1.3.1 轉(zhuǎn)錄組的概念
        1.3.2 轉(zhuǎn)錄組技術(shù)的建立
        1.3.3 轉(zhuǎn)錄組技術(shù)在魚類中的研究
    1.4 研究目的與意義
2 雜交石斑魚和褐點(diǎn)石斑魚的轉(zhuǎn)錄組分析
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料
    2.2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.2.1 雜交石斑魚和褐點(diǎn)石斑魚組織的收集
        2.2.2 RNA提取和文庫的構(gòu)建
        2.2.3 測序和從頭組裝de novo
        2.2.4 Unigenes的功能注釋
        2.2.5 差異表達(dá)基因(DEGs)的篩選和富集分析
        2.2.6 qRT-PCR驗(yàn)證
    2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
        2.3.1 轉(zhuǎn)錄組測序和de novo
        2.3.2 Unigenes的功能注釋
        2.3.3 差異表達(dá)基因的鑒定和富集分析
        2.3.4 轉(zhuǎn)錄組qRT-PCR驗(yàn)證
    2.4 討論
        2.4.1 JAK信號轉(zhuǎn)導(dǎo)子和轉(zhuǎn)錄激活因子(STAT)通路
        2.4.2 Toll樣受體信號通路
        2.4.3 Wnt信號通路
3 模式受體基因的表達(dá)特性分析及IRF3 基因的克隆
    3.1 外周血淋巴細(xì)胞的分離和模式受體基因的表達(dá)分析
        3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        3.1.2 實(shí)驗(yàn)方法
        3.1.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        3.1.4 討論
    3.2 IRF3基因的克隆
        3.2.1 實(shí)驗(yàn)材料
        3.2.2 實(shí)驗(yàn)方法
        3.2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        3.2.4 討論
4 PolyI:C和LPS刺激對雜交石斑魚外周血淋巴中三種酶活力的影響
    4.1 實(shí)驗(yàn)材料
    4.2 實(shí)驗(yàn)方法
    4.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
    4.4 討論
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡介
導(dǎo)師簡介



本文編號：3763765