【目的】分析多鱗鱚（Sillago sihama）脯氨酸羥化酶（prolyl hydroxylases, Phds）基因家族序列特征,探討其在低氧響應過程的作用�！痉椒ā客ㄟ^硬骨魚類phds基因,在多鱗鱚轉錄組和基因組數據中比對篩選多鱗鱚phds基因。對多鱗鱚Phds蛋白序列進行結構域預測、系統進化和共線性分析等。采用實時熒光定量PCR檢測phds基因在低氧脅迫和復氧后的表達變化。【結果】在多鱗鱚基因組中共鑒定到三個phds基因,分別是phd1、phd2和phd3,開放閱讀框（ORF）全長分別為1 635、1 092、723 bp,分別編碼544、363、240個氨基酸。結構域預測表明,多鱗鱚Phd1、Phd2、Phd3蛋白均含有P4Hc保守結構域。系統進化分析發(fā)現,多鱗鱚Phds均與大黃魚（Larimichthys crocea）親緣關系最近。共線性分析表明,多鱗鱚phds與尼羅羅非魚（Oreochromis niloticus）上下游基因高度一致。phd1、phd2在低氧處理4 h鰓組織中m RNA表達顯著高于常氧組（P ＜0.05）,但在心臟中無顯著性差異（P＞ 0.05）;ph... 

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 多鱗鱚phds基因鑒定
    1.2 多鱗鱚phds基因序列分析
    1.3 phds基因系統進化樹構建與結構分析
    1.4 phds基因共線性分析
    1.5 實驗動物和低氧脅迫處理
    1.6 RNA提取和逆轉錄
    1.7 實時熒光定量PCR(q PCR）檢測
2 結果分析
    2.1 多鱗鱚phds基因的鑒定和序列分析
    2.2 phds基因系統進化分析
    2.3 phds基因結構分析
    2.4 phds基因共線性分析
    2.5 低氧脅迫處理后多鱗鱚phds基因表達變化
3 討論


【參考文獻】：
期刊論文
[1]低氧信號傳導途徑與魚類低氧適應[J]. 肖武漢.  中國科學:生命科學. 2014(12)
[2]多鱗鱚Sillago sihama Forskál人工繁殖研究[J]. 黃洋,杜濤,黃海立.  廣東海洋大學學報. 2013(01)
[3]多鱗鱚采捕暫養(yǎng)的初步研究[J]. 杜濤,黃洋,曹劍香.  養(yǎng)殖與飼料. 2009(10)
[4]多鱗(魚喜)生物學特性及室內養(yǎng)殖試驗[J]. 杜濤,黃洋.  水產養(yǎng)殖. 2009(03)
[5]低氧誘導因子及其低氧調節(jié)機制[J]. 李福祥,全燕,夏前明.  中國臨床康復. 2004(30)

博士論文
[1]團頭魴phds基因家族參與低氧應答的分子機理解析[D]. 陳楠.華中農業(yè)大學 2017

碩士論文
[1]鱚科幾種魚類的形態(tài)學及遺傳學研究[D]. 薛泰強.中國海洋大學 2010



本文編號：3722459