【目的】分析多鱗鱚（Sillago sihama）脯氨酸羥化酶（prolyl hydroxylases, Phds）基因家族序列特征,探討其在低氧響應(yīng)過程的作用�！痉椒ā客ㄟ^硬骨魚類phds基因,在多鱗鱚轉(zhuǎn)錄組和基因組數(shù)據(jù)中比對(duì)篩選多鱗鱚phds基因。對(duì)多鱗鱚Phds蛋白序列進(jìn)行結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)、系統(tǒng)進(jìn)化和共線性分析等。采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)phds基因在低氧脅迫和復(fù)氧后的表達(dá)變化。【結(jié)果】在多鱗鱚基因組中共鑒定到三個(gè)phds基因,分別是phd1、phd2和phd3,開放閱讀框（ORF）全長(zhǎng)分別為1 635、1 092、723 bp,分別編碼544、363、240個(gè)氨基酸。結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)表明,多鱗鱚Phd1、Phd2、Phd3蛋白均含有P4Hc保守結(jié)構(gòu)域。系統(tǒng)進(jìn)化分析發(fā)現(xiàn),多鱗鱚Phds均與大黃魚（Larimichthys crocea）親緣關(guān)系最近。共線性分析表明,多鱗鱚phds與尼羅羅非魚（Oreochromis niloticus）上下游基因高度一致。phd1、phd2在低氧處理4 h鰓組織中m RNA表達(dá)顯著高于常氧組（P ＜0.05）,但在心臟中無顯著性差異（P＞ 0.05）;ph... 

【文章頁數(shù)】：8 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 多鱗鱚phds基因鑒定
    1.2 多鱗鱚phds基因序列分析
    1.3 phds基因系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建與結(jié)構(gòu)分析
    1.4 phds基因共線性分析
    1.5 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物和低氧脅迫處理
    1.6 RNA提取和逆轉(zhuǎn)錄
    1.7 實(shí)時(shí)熒光定量PCR(q PCR）檢測(cè)
2 結(jié)果分析
    2.1 多鱗鱚phds基因的鑒定和序列分析
    2.2 phds基因系統(tǒng)進(jìn)化分析
    2.3 phds基因結(jié)構(gòu)分析
    2.4 phds基因共線性分析
    2.5 低氧脅迫處理后多鱗鱚phds基因表達(dá)變化
3 討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[4]多鱗(魚喜)生物學(xué)特性及室內(nèi)養(yǎng)殖試驗(yàn)[J]. 杜濤,黃洋.  水產(chǎn)養(yǎng)殖. 2009(03)
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博士論文
[1]團(tuán)頭魴phds基因家族參與低氧應(yīng)答的分子機(jī)理解析[D]. 陳楠.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017

碩士論文
[1]鱚科幾種魚類的形態(tài)學(xué)及遺傳學(xué)研究[D]. 薛泰強(qiáng).中國(guó)海洋大學(xué) 2010



本文編號(hào)：3722459