GI和CO在植物光周期開花誘導(dǎo)途徑中起促進(jìn)作用。GI是生物節(jié)理鐘輸出的重要基因,正調(diào)控CO基因的表達(dá)。CO基因可以對光信號和生物鐘信號進(jìn)行整合,并激活下游基因FT的表達(dá),誘導(dǎo)植物開花。因此,本研究通過生物信息學(xué)手段從14個(gè)基因組中鑒定所有的GI、CO基因拷貝。從外顯子-內(nèi)含子結(jié)構(gòu)、結(jié)構(gòu)域和基序分析、基因重復(fù)以及差異表達(dá)分析等方面開展系統(tǒng)發(fā)育分析研究,探討GI和CO基因家族在植物中的潛在功能。1、對14個(gè)基因組已測序的物種（長日照植物、短日照植物和日中性植物各3種,藻類植物、苔蘚植物、蕨類植物和裸子植物各1種,以及原始的被子植物無油樟）GI和CO基因家族進(jìn)行鑒定,GI和CO家族成員分別為20和159個(gè)。2、系統(tǒng)發(fā)育分析顯示,14個(gè)植物基因組的20個(gè)GI基因劃分為單子葉和雙子葉兩個(gè)進(jìn)化枝。159個(gè)CO基因根據(jù)其結(jié)構(gòu)域聚類情況,可以被分成B1-B3進(jìn)化枝,各自代表一個(gè)原始的基因譜系。3、20個(gè)GI基因的209在內(nèi)含子中,有145個(gè)是相位0,而相位1和相位2僅有31,32。形成大量的對稱外顯子。而在CO基因B1-B3亞家族中,大多數(shù)基因大都存在著2-4個(gè)外顯子,尤其在B2亞家族中顯示在每個(gè)CO... 

【文章頁數(shù)】：84 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1.1 引言
    1.2 模式植物擬南芥
    1.3 植物開花調(diào)控途徑
        1.3.1 光周期途徑
        1.3.2 其他開花調(diào)控途徑
            1.3.2.1 春化途徑
            1.3.2.2 自主途徑
            1.3.2.3 赤霉素途徑
            1.3.2.4 溫敏途徑
        1.3.3 成花誘導(dǎo)因子整合
        1.3.4 開花抑制基因
    1.4 GI基因的研究進(jìn)展
        1.4.1 GI的結(jié)構(gòu)
        1.4.2 GI的功能
    1.5 CO基因的研究進(jìn)展
        1.5.1 CO的結(jié)構(gòu)
        1.5.2 CO的功能
    1.6 實(shí)驗(yàn)的目的和意義
第二章 GI基因家族的分子進(jìn)化
    2.1 材料與方法
        2.1.1 數(shù)據(jù)的收集及本地?cái)?shù)據(jù)庫的構(gòu)建
        2.1.2 多序列比對和系統(tǒng)發(fā)育分析
        2.1.3 GI轉(zhuǎn)錄因子家族基因和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)及基序分析
        2.1.4 染色體定位及一級結(jié)構(gòu)和理化性質(zhì)的分析
        2.1.5 串聯(lián)重復(fù)和同線性分析
        2.1.6 GI轉(zhuǎn)錄因子家族基因的表達(dá)分析
    2.2 結(jié)果與分析
        2.2.1 GI轉(zhuǎn)錄因子基因家族成員的鑒定
        2.2.2 GI轉(zhuǎn)錄因子基因家族分子進(jìn)化分析
        2.2.3 GI的結(jié)構(gòu)分析
            2.2.3.1 GI蛋白的一級結(jié)構(gòu)和理化性質(zhì)分析
            2.2.3.2 GI家族成員蛋白磷酸化位點(diǎn)分析
            2.2.3.3 內(nèi)含子和外顯子的分布
            2.2.3.4 結(jié)構(gòu)域和基序分析
        2.2.4 GI基因家族共線性分析和基因復(fù)制事件
        2.2.5 GI家族基因的表達(dá)和功能分化
    2.3 討論
    2.4 小結(jié)
第三章 CO基因家族的分子進(jìn)化
    3.1 材料和方法
        3.1.1 數(shù)據(jù)的收集及本地?cái)?shù)據(jù)庫的構(gòu)建
        3.1.2 多序列比對和系統(tǒng)發(fā)育分析
        3.1.3 CO轉(zhuǎn)錄因子家族基因和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)及基序分析
        3.1.4 染色體定位及一級結(jié)構(gòu)和理化性質(zhì)的分析
        3.1.5 串聯(lián)重復(fù)和同線性分析
        3.1.6 CO轉(zhuǎn)錄因子家族基因的表達(dá)分析
    3.2 結(jié)果和討論
        3.2.1 CO轉(zhuǎn)錄因子基因家族成員的鑒定
        3.2.2 CO轉(zhuǎn)錄因子基因家族分子進(jìn)化分析
        3.2.3 CO家族基因的結(jié)構(gòu)分析
            3.2.3.1 CO蛋白的一級結(jié)構(gòu)和理化性質(zhì)分析
            3.2.3.2 CO家族成員蛋白磷酸化位點(diǎn)分析
            3.2.3.3 內(nèi)含子和外顯子的分布
            3.2.3.4 結(jié)構(gòu)域和基序分析
        3.2.4 CO基因家族共線性分析和基因復(fù)制事件
        3.2.5 CO家族基因的表達(dá)和功能分化
    3.3 討論
    3.4 小結(jié)
參考文獻(xiàn)
個(gè)人簡介
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]高等植物開花誘導(dǎo)研究進(jìn)展[J]. 孫昌輝,鄧曉建,方軍,儲(chǔ)成才.  遺傳. 2007(10)
[2]控制擬南芥和水稻開花時(shí)間光周期途徑的分子機(jī)制[J]. 彭凌濤.  植物生理學(xué)通訊. 2006(06)

博士論文
[1]豆科和禾本科植物熱激轉(zhuǎn)錄因子基因家族的分子進(jìn)化研究[D]. 林勇翔.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013



本文編號：3692789