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青海地區(qū)藏、漢族胃癌差異表達(dá)基因的篩選研究

發(fā)布時(shí)間:2022-09-27 19:51
  目的:以青海地區(qū)藏族和漢族胃癌血漿、組織標(biāo)本為研究對(duì)象,采用mi RNA芯片等相關(guān)檢測(cè)方法,分析青海地區(qū)藏、漢族胃癌發(fā)生發(fā)展過(guò)程中的基因表達(dá)差異。方法:收集2017年10月-2019年03月在青海省人民醫(yī)院行手術(shù)治療胃癌患者胃癌、癌旁組織及術(shù)前靜脈血各80例,同時(shí)收集健康者靜脈血10例(其中藏族5例,漢族5例),并采集臨床資料。從75例胃癌手術(shù)患者中隨機(jī)選取5例藏族、5例漢族胃癌患者胃癌組織、術(shù)前血漿作為病例組進(jìn)行mi RNA芯片檢測(cè),5例藏族、5例漢族健康者靜脈血血漿為對(duì)照組進(jìn)行mi RNA芯片檢測(cè),篩選出差異表達(dá)的mi RNA并通過(guò)相關(guān)軟件預(yù)測(cè)差異mi RNA可能的靶基因,并對(duì)這些靶基因進(jìn)行聚類分析、基因功能及信號(hào)通路分析。結(jié)果:1.通過(guò)基因芯片檢測(cè)及進(jìn)一步篩選得到了235個(gè)可能有意義的差異mi RNA,其中表達(dá)上調(diào)的118個(gè),下調(diào)的117個(gè)(P<0.05且FC≥2)。2.通過(guò)12種數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè)得到差異mi RNA可能的靶基因,以及靶基因可能的功能、靶基因可能富集到的一些信號(hào)通路。3.根據(jù)P值及FC值從每組篩選出10個(gè)差異mi RNA共40個(gè)差異mi RNA準(zhǔn)備進(jìn)行下一步驗(yàn)證。結(jié)論:... 

【文章頁(yè)數(shù)】:63 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
主要符號(hào)對(duì)照表
第一章 引言
第二章 材料與方法
    2.1 研究對(duì)象
    2.2 實(shí)驗(yàn)材料
        2.2.1 主要試劑
        2.2.2 主要儀器及設(shè)備
    2.3 資料收集
    2.4 實(shí)驗(yàn)方法
        2.4.1 標(biāo)本采集及保存
        2.4.2 血漿樣本實(shí)驗(yàn)步驟
        2.4.3 組織樣本實(shí)驗(yàn)步驟
    2.5 生物信息學(xué)研究
        2.5.1 聚類分析
        2.5.2 差異miRNA靶基因預(yù)測(cè)
        2.5.3 差異miRNA靶基因功能分析(Gene Ontology,GO)和信號(hào)通路分析(Pathway)
    2.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
第三章 結(jié)果
    3.1 一般臨床特征
    3.2 RNA質(zhì)量控制
    3.3 芯片檢測(cè)得到的差異miRNA
        3.3.1 血漿樣本中差異miRNA數(shù)量統(tǒng)計(jì)
        3.3.2 組織樣本中差異miRNA數(shù)量統(tǒng)計(jì)
    3.4 差異miRNA的靶基因富集分析
        3.4.1 漢族胃癌血漿與對(duì)照血漿組GO和 Pathway分析
        3.4.2 藏族胃癌血漿與對(duì)照血漿組GO和 Pathway分析
        3.4.3 漢族胃癌組織與癌旁組織組GO和 Pathway分析
        3.4.4 藏族胃癌組織與癌旁組織組GO和 Pathway分析
    3.5 篩選出的待驗(yàn)證差異miRNA
第四章 討論
    4.1 胃癌發(fā)病及預(yù)后現(xiàn)狀
    4.2 芯片檢測(cè)得到的差異miRNA
    4.3 待驗(yàn)證的差異miRNA
        4.3.1 漢族胃癌血漿與正常血漿實(shí)驗(yàn)組
        4.3.2 漢族胃癌組織與癌旁組織實(shí)驗(yàn)組
        4.3.3 藏族胃癌血漿與正常血漿實(shí)驗(yàn)組
        4.3.4 藏族胃癌組織與癌旁組織實(shí)驗(yàn)組
    4.4 本研究的優(yōu)勢(shì)與局限
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
綜述 miRNA在胃癌診療中的研究進(jìn)展
    參考文獻(xiàn)
作者簡(jiǎn)歷


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]MicroRNAs在腫瘤相關(guān)成纖維細(xì)胞促進(jìn)腫瘤發(fā)展進(jìn)程中的作用[J]. 郭雪茹,徐克.  中國(guó)腫瘤生物治療雜志. 2019(11)
[2]miRNAs在高級(jí)別漿液性卵巢癌中的作用[J]. 熊嬌,李娜,王東紅.  醫(yī)學(xué)綜述. 2019(22)
[3]miRNA與動(dòng)脈粥樣硬化炎癥機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 顧燕妮,謝春毅.  中國(guó)免疫學(xué)雜志. 2019(20)
[4]藥物性肝損傷與非編碼RNA的研究進(jìn)展[J]. 盧西雅,王菲,楊長(zhǎng)青.  國(guó)際消化病雜志. 2019(05)
[5]microRNA集合富集分析工具的研究進(jìn)展[J]. 李建偉,徐夢(mèng)夢(mèng),楊宵月,劉磊波,杜燕波,韓小芬.  生理科學(xué)進(jìn)展. 2019(05)
[6]微小RNA在心臟傳導(dǎo)系統(tǒng)中的研究現(xiàn)狀[J]. 朱煙朦,謝冰鑫,孫麗華.  中國(guó)臨床藥理學(xué)雜志. 2019(19)
[7]MicroRNA-320a suppresses tumor progression by targeting PBX3 in gastric cancer and is downregulated by DNA methylation[J]. Yong-Shuang Li,Ying Zou,Dong-Qiu Dai.  World Journal of Gastrointestinal Oncology. 2019(10)
[8]miR-335、Survivin表達(dá)及對(duì)乳腺癌術(shù)后患者預(yù)后評(píng)估的價(jià)值[J]. 余進(jìn)松,李忠,徐毅,李淵,賈韻豪,丁波.  現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué). 2019(13)
[9]下調(diào)miRNA-214表達(dá)抑制胃癌SGC-7901/DDP細(xì)胞順鉑耐藥、遷移和上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化[J]. 朱艷,劉瑋麗,吳明東,莊永衛(wèi),葉淑芳,施旭紅.  世界華人消化雜志. 2019(12)
[10]miRNA調(diào)控腫瘤微環(huán)境的研究進(jìn)展[J]. 李欣,羅小玲.  現(xiàn)代免疫學(xué). 2019(03)

碩士論文
[1]胃腺癌腫瘤干細(xì)胞中異常表達(dá)的miRNA初篩及miR-199b-5p的初步研究[D]. 曹陽(yáng).河北大學(xué) 2017



本文編號(hào):3681514

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