8個地理種群紅條毛膚石鱉COI基因的遺傳多樣性分析
發(fā)布時間:2022-09-27 19:40
[目的]分析我國8個沿海潮間帶紅條毛膚石鱉地理種群的COI基因的遺傳多樣性。[方法]利用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)技術(shù)擴增8個地區(qū)80個紅條毛膚石鱉樣品的COI基因。使用DNASP5.10.01、MEGA7.0等軟件對所得序列進行分析,得到片段堿基含量、遺傳距離以及遺傳多樣性參數(shù)等數(shù)據(jù),并通過構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹的方式,結(jié)合遺傳多樣性數(shù)據(jù)分析結(jié)果。[結(jié)果]獲得的COI基因片段長度為659 bp,COI基因位于線粒體編碼區(qū)中,平均A、T、C、G的堿基含量分別20.4%、41.7%、14.9%和23.0%,存在明顯的AT偏向,結(jié)合Acanthochitona crinita為外群系統(tǒng)發(fā)育樹的結(jié)果來看,中國沿海地區(qū)紅條毛膚石鱉種群分成2個明顯的聚群,將它們定義為北方群體和南方群體,遺傳距離為0.000 66~0.087 85。單倍型遺傳多樣性數(shù)據(jù)顯示,多樣性數(shù)值較高,但核苷酸多樣性較低。[結(jié)論]紅條毛膚石鱉北方群體的遺傳多樣性與南方群體存在差異,2個群體應(yīng)該分別采取相應(yīng)措施來保護遺傳多樣性。
【文章頁數(shù)】:4 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 樣品采集
1.2 試驗方法
1.2.1 DNA提取。
1.2.2 PCR擴增。
1.2.3 序列處理和分析。
2 結(jié)果與分析
2.1 產(chǎn)物檢測結(jié)果
2.2 堿基含量分析
2.3 各地區(qū)遺傳距離分析
2.4 紅條毛膚石鱉COI基因遺傳多樣性分析
2.5 系統(tǒng)發(fā)育樹分析
3 結(jié)論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]我國不同地區(qū)小鼠Y染色體Zfy1基因遺傳差異分析[J]. 陳夢璇,于立強,靖美東. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(08)
[2]環(huán)渤海紅條毛膚石鱉種群遺傳多樣性研究[J]. 王儒曉,李媛媛,劉傳林,杜文曉,侯建海,姚文君,張俊凱,張運發(fā),王宇,曲江勇. 四川動物. 2019(01)
[3]基于COⅠ基因序列的東、黃海區(qū)野生與養(yǎng)殖大黃魚遺傳多樣性分析[J]. 諶微,張鳳英,王景,魏鴻擎,姜亞洲,張輝,凌建忠,程家驊,馬凌波. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2016(06)
[4]基于殼板和齒舌形態(tài)對中國沿岸幾種常見多板綱軟體動物的分類研究[J]. 張均龍,史振平,王承,張樹乾,張素萍. 海洋科學(xué). 2015(11)
[5]16種環(huán)節(jié)動物線粒體基因排列、特征比較及系統(tǒng)發(fā)育分析[J]. 李石磊,張明,王慶志,王笑月,李大成,劉衛(wèi)東,劉忠穎,陳遠(yuǎn). 水產(chǎn)科學(xué). 2015(02)
[6]9種石鱉殼板的形態(tài)研究[J]. 陳道海,孫世春. 中國海洋大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2010(06)
[7]基于線粒體COI基因序列探討泥蚶的遺傳分化[J]. 鄭文娟,朱世華,沈錫權(quán),劉必謙,潘志崇,葉央芳. 動物學(xué)研究. 2009(01)
[8]6種簾蛤科貝類及4個地理種群文蛤線粒體COI基因片段序列分析[J]. 程漢良,夏德全,吳婷婷,孟學(xué)平,吉紅九,董志國,陳淑吟. 海洋學(xué)報(中文版). 2007(05)
[9]紅條毛膚石鱉生殖周期的研究[J]. 於宏華,趙青松,徐鎮(zhèn),丁震. 寧波大學(xué)學(xué)報(理工版). 2006(01)
[10]紅條毛膚石鱉齒舌牙齒內(nèi)的納米磁性礦物質(zhì)[J]. 錢霞,劉維,趙見高. 科學(xué)通報. 2002(01)
碩士論文
[1]基于線粒體DNA的長江上游四種薄鰍屬魚類遺傳多樣性研究[D]. 申紹祎.西南大學(xué) 2018
本文編號:3681497
【文章頁數(shù)】:4 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 樣品采集
1.2 試驗方法
1.2.1 DNA提取。
1.2.2 PCR擴增。
1.2.3 序列處理和分析。
2 結(jié)果與分析
2.1 產(chǎn)物檢測結(jié)果
2.2 堿基含量分析
2.3 各地區(qū)遺傳距離分析
2.4 紅條毛膚石鱉COI基因遺傳多樣性分析
2.5 系統(tǒng)發(fā)育樹分析
3 結(jié)論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]我國不同地區(qū)小鼠Y染色體Zfy1基因遺傳差異分析[J]. 陳夢璇,于立強,靖美東. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(08)
[2]環(huán)渤海紅條毛膚石鱉種群遺傳多樣性研究[J]. 王儒曉,李媛媛,劉傳林,杜文曉,侯建海,姚文君,張俊凱,張運發(fā),王宇,曲江勇. 四川動物. 2019(01)
[3]基于COⅠ基因序列的東、黃海區(qū)野生與養(yǎng)殖大黃魚遺傳多樣性分析[J]. 諶微,張鳳英,王景,魏鴻擎,姜亞洲,張輝,凌建忠,程家驊,馬凌波. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2016(06)
[4]基于殼板和齒舌形態(tài)對中國沿岸幾種常見多板綱軟體動物的分類研究[J]. 張均龍,史振平,王承,張樹乾,張素萍. 海洋科學(xué). 2015(11)
[5]16種環(huán)節(jié)動物線粒體基因排列、特征比較及系統(tǒng)發(fā)育分析[J]. 李石磊,張明,王慶志,王笑月,李大成,劉衛(wèi)東,劉忠穎,陳遠(yuǎn). 水產(chǎn)科學(xué). 2015(02)
[6]9種石鱉殼板的形態(tài)研究[J]. 陳道海,孫世春. 中國海洋大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2010(06)
[7]基于線粒體COI基因序列探討泥蚶的遺傳分化[J]. 鄭文娟,朱世華,沈錫權(quán),劉必謙,潘志崇,葉央芳. 動物學(xué)研究. 2009(01)
[8]6種簾蛤科貝類及4個地理種群文蛤線粒體COI基因片段序列分析[J]. 程漢良,夏德全,吳婷婷,孟學(xué)平,吉紅九,董志國,陳淑吟. 海洋學(xué)報(中文版). 2007(05)
[9]紅條毛膚石鱉生殖周期的研究[J]. 於宏華,趙青松,徐鎮(zhèn),丁震. 寧波大學(xué)學(xué)報(理工版). 2006(01)
[10]紅條毛膚石鱉齒舌牙齒內(nèi)的納米磁性礦物質(zhì)[J]. 錢霞,劉維,趙見高. 科學(xué)通報. 2002(01)
碩士論文
[1]基于線粒體DNA的長江上游四種薄鰍屬魚類遺傳多樣性研究[D]. 申紹祎.西南大學(xué) 2018
本文編號:3681497
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