基于單細(xì)胞擴(kuò)增技術(shù)的細(xì)菌多樣性及功能基因分析
發(fā)布時(shí)間:2022-08-23 23:35
本研究采用單細(xì)胞擴(kuò)增技術(shù)與宏基因組學(xué)相結(jié)合策略以期全面了解產(chǎn)婦腸道細(xì)菌多樣性及基因功能信息,為深入理解微生物代謝特性及潛能提供理論基礎(chǔ)。對(duì)來(lái)自5位健康產(chǎn)婦共計(jì)40份糞便樣本稀釋液進(jìn)行細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)及基因功能組成分析,并鑒于短鏈脂肪酸(short-chain fatty acids, SCFAs)在孕期能量及免疫調(diào)節(jié)中的關(guān)鍵作用,進(jìn)一步探討其生物合成相關(guān)功能基因分布及與核心菌群相關(guān)性。共享核心菌門4個(gè),依次為厚壁菌門(0.88%)、擬桿菌門(0.07%)、變形菌門(0.02%)和廣古菌門(0.02%),其中厚壁菌門與擬桿菌門(17.59∶1)較普通健康成人(1∶1)差異顯著;共享核心菌屬25個(gè),占樣品微生物總量的77.99%,樣本間差異顯著;蚬δ苌婕稗D(zhuǎn)運(yùn)因子、DNA修復(fù)、重組蛋白、核糖體等306個(gè)功能大類;相關(guān)性熱圖顯示腸道細(xì)菌為難消化多糖轉(zhuǎn)化SCFAs提供完整遺傳代謝途徑,其中擬桿菌門和厚壁菌門相關(guān)菌屬分別在多糖降解和SCFAs生成中表現(xiàn)各自優(yōu)勢(shì)。細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)具顯著妊娠特癥,且屬水平表現(xiàn)較大宿主特異性;其中SCFAs途徑菌間代謝偏好差異及互補(bǔ)特性提示腸道細(xì)菌可能存在復(fù)雜的菌間互養(yǎng)cr...
【文章頁(yè)數(shù)】:10 頁(yè)
【文章目錄】:
1 結(jié)果與分析
1.1 腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)分析
1.1.1 門水平細(xì)菌組成
1.1.2 屬水平細(xì)菌組成
1.2.1 核心基因功能分析
1.2.2 多糖代謝到短鏈脂肪酸生成相關(guān)功能基因分析
2 討論
3 材料與方法
3.1 樣品采集
3.2 單細(xì)胞獲取及測(cè)序
3.3 序列組裝及注釋
3.4 核苷酸序列登錄號(hào)
作者貢獻(xiàn)
本文編號(hào):3678693
【文章頁(yè)數(shù)】:10 頁(yè)
【文章目錄】:
1 結(jié)果與分析
1.1 腸道細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)分析
1.1.1 門水平細(xì)菌組成
1.1.2 屬水平細(xì)菌組成
1.2.1 核心基因功能分析
1.2.2 多糖代謝到短鏈脂肪酸生成相關(guān)功能基因分析
2 討論
3 材料與方法
3.1 樣品采集
3.2 單細(xì)胞獲取及測(cè)序
3.3 序列組裝及注釋
3.4 核苷酸序列登錄號(hào)
作者貢獻(xiàn)
本文編號(hào):3678693
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