水稻葉色黃化基因YL2的精細(xì)定位以及候選基因分析
發(fā)布時(shí)間:2022-08-13 17:48
植物的光合作用是植物能源的主要來(lái)源,與作物產(chǎn)量密切相關(guān),而作為光合作用發(fā)生的場(chǎng)所,功能葉綠體的建立無(wú)疑是與絕大多數(shù)作物生長(zhǎng)發(fā)育和產(chǎn)量最緊密相關(guān)的一個(gè)重要過(guò)程。本研究以利用60Co-γ射線輻射秈稻廣占63S誘變產(chǎn)生的能夠穩(wěn)定遺傳的黃葉突變體HuangS為研究材料,對(duì)其的形態(tài)特征以及生理生化特性進(jìn)行了分析,隨后在前期的研究基礎(chǔ)上運(yùn)用圖位克隆方法進(jìn)行了目的基因的精細(xì)定位以及生物信息學(xué)分析。主要結(jié)果如下:1、突變體HuangS葉片在全生育期均為黃色表型,為溫鈍型。突變體HuangS葉綠素a、葉綠素b以及胡蘿卜素的含量顯著低于野生型,但葉綠素a/b卻顯著高于野生型。葉綠體超微結(jié)構(gòu)觀察發(fā)現(xiàn)突變體HuangS細(xì)胞內(nèi)葉綠體數(shù)目較少、體積小,分布不規(guī)則,且基粒片層和類(lèi)囊體膜有所減少。對(duì)比突變體HuangS的表型與水稻黃葉突變體YL1表型發(fā)現(xiàn)兩者表型類(lèi)似,故將控制突變體HuangS表型的基因命名為YL2。2、利用圖位克隆法將YL2基因定位于第2染色體短臂AP004126和AP004093BAC克隆上物理距離為47.16 kb的SSR標(biāo)記ab1-9以及InDel標(biāo)記InDel-25之間...
【文章頁(yè)數(shù)】:65 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略表
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 水稻功能基因組的研究方法——圖位克隆
1.1.1 水稻功能基因組
1.1.2 圖位克隆
1.1.3 圖位克隆技術(shù)環(huán)節(jié)
1.2 水稻葉色黃化突變體研究進(jìn)展
1.2.1 水稻葉片黃色突變體的來(lái)源
1.2.2 水稻葉片黃色突變體的遺傳基礎(chǔ)
1.2.3 水稻葉片黃化基因的分布
1.2.4 水稻黃化突變體的分子機(jī)理
1.2.5 水稻葉色突變體研究意義
1.3 本研究的目的與意義
第二章 突變體HuangS的生理生化及細(xì)胞形態(tài)學(xué)分析
2.1 試驗(yàn)材料
2.2 試驗(yàn)內(nèi)容與方法
2.2.1 HuangS形態(tài)學(xué)觀察
2.2.2 HuangS溫度敏感性
2.2.3 光照對(duì)HuangS表型的影響
2.2.4 光合色素的提取和含量的測(cè)定
2.2.5 野生型和突變體葉綠素合成速率測(cè)定
2.2.6 光合指標(biāo)的測(cè)定
2.2.7 葉綠體超微結(jié)構(gòu)的觀察
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 HuangS的形態(tài)特征分析
2.3.2 突變體HuangS與野生型在葉綠素含量和光合特性的差異分析
2.3.3 葉綠素合成速率的測(cè)定
2.3.4 突變體HuangS與野生型的葉綠體超微結(jié)構(gòu)的分析
2.4 本章小結(jié)
第三章 突變基因YL2的精細(xì)定位
3.1 試驗(yàn)材料和方法
3.1.1 試驗(yàn)材料
3.1.2 DNA的提取
3.1.3 SSR標(biāo)記和InDel標(biāo)記的開(kāi)發(fā)
3.1.4 基因精細(xì)定位和圖譜構(gòu)建
3.1.5 候選基因的預(yù)測(cè)
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 黃化突變體HuangS的精細(xì)定位
3.2.2 候選基因的鑒定及測(cè)序比對(duì)結(jié)果
3.3 本章小結(jié)
第四章 突變基因YL2的生物信息學(xué)及相關(guān)基因的表達(dá)分析
4.1 試驗(yàn)材料
4.2 試驗(yàn)方法
4.2.1 相關(guān)基因的表達(dá)分析
4.2.2 基因結(jié)構(gòu)的生物信息學(xué)分析
4.3 結(jié)果與分析
4.3.1 YL2基因生物信息學(xué)分析
4.3.2 YL2基因組織表達(dá)分析
4.3.3 葉色及光合相關(guān)基因的表達(dá)分析
4.4 本章小結(jié)
第五章 討論
5.1 YL2是一個(gè)新的控制黃葉基因
5.2 YL2突變影響葉綠素的合成
5.3 YL2突變影響葉綠體的發(fā)育以及光合作用
5.4 YL2基因的功能與表達(dá)蛋白的預(yù)測(cè)分析
5.5 小結(jié)與展望
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄
本文編號(hào):3677478
【文章頁(yè)數(shù)】:65 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略表
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 水稻功能基因組的研究方法——圖位克隆
1.1.1 水稻功能基因組
1.1.2 圖位克隆
1.1.3 圖位克隆技術(shù)環(huán)節(jié)
1.2 水稻葉色黃化突變體研究進(jìn)展
1.2.1 水稻葉片黃色突變體的來(lái)源
1.2.2 水稻葉片黃色突變體的遺傳基礎(chǔ)
1.2.3 水稻葉片黃化基因的分布
1.2.4 水稻黃化突變體的分子機(jī)理
1.2.5 水稻葉色突變體研究意義
1.3 本研究的目的與意義
第二章 突變體HuangS的生理生化及細(xì)胞形態(tài)學(xué)分析
2.1 試驗(yàn)材料
2.2 試驗(yàn)內(nèi)容與方法
2.2.1 HuangS形態(tài)學(xué)觀察
2.2.2 HuangS溫度敏感性
2.2.3 光照對(duì)HuangS表型的影響
2.2.4 光合色素的提取和含量的測(cè)定
2.2.5 野生型和突變體葉綠素合成速率測(cè)定
2.2.6 光合指標(biāo)的測(cè)定
2.2.7 葉綠體超微結(jié)構(gòu)的觀察
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 HuangS的形態(tài)特征分析
2.3.2 突變體HuangS與野生型在葉綠素含量和光合特性的差異分析
2.3.3 葉綠素合成速率的測(cè)定
2.3.4 突變體HuangS與野生型的葉綠體超微結(jié)構(gòu)的分析
2.4 本章小結(jié)
第三章 突變基因YL2的精細(xì)定位
3.1 試驗(yàn)材料和方法
3.1.1 試驗(yàn)材料
3.1.2 DNA的提取
3.1.3 SSR標(biāo)記和InDel標(biāo)記的開(kāi)發(fā)
3.1.4 基因精細(xì)定位和圖譜構(gòu)建
3.1.5 候選基因的預(yù)測(cè)
3.2 結(jié)果與分析
3.2.1 黃化突變體HuangS的精細(xì)定位
3.2.2 候選基因的鑒定及測(cè)序比對(duì)結(jié)果
3.3 本章小結(jié)
第四章 突變基因YL2的生物信息學(xué)及相關(guān)基因的表達(dá)分析
4.1 試驗(yàn)材料
4.2 試驗(yàn)方法
4.2.1 相關(guān)基因的表達(dá)分析
4.2.2 基因結(jié)構(gòu)的生物信息學(xué)分析
4.3 結(jié)果與分析
4.3.1 YL2基因生物信息學(xué)分析
4.3.2 YL2基因組織表達(dá)分析
4.3.3 葉色及光合相關(guān)基因的表達(dá)分析
4.4 本章小結(jié)
第五章 討論
5.1 YL2是一個(gè)新的控制黃葉基因
5.2 YL2突變影響葉綠素的合成
5.3 YL2突變影響葉綠體的發(fā)育以及光合作用
5.4 YL2基因的功能與表達(dá)蛋白的預(yù)測(cè)分析
5.5 小結(jié)與展望
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄
本文編號(hào):3677478
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