目的:本研究擬通過分析EGFR、KRAS突變肺腺癌特有及共有的轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò),篩選EGFR、KRAS突變肺腺癌特有及共有關(guān)鍵分子標(biāo)志物。探討臨床EGFR、KRAS突變肺腺癌轉(zhuǎn)移、復(fù)發(fā)、耐藥及預(yù)后不良機(jī)制,為EGFR、KRAS突變肺腺癌現(xiàn)有臨床方案的優(yōu)化提供理論依據(jù)。方法:首先,以來自GEO和TCGA數(shù)據(jù)集的EGFR、KRAS突變肺腺癌的基因芯片及高通量測序原始數(shù)據(jù)為研究對象,按照擬定標(biāo)準(zhǔn)處理建立二級數(shù)據(jù)庫。而后,應(yīng)用差異表達(dá)分析、功能富集分析、網(wǎng)絡(luò)分析等方法分別建立EGFR、KRAS突變肺腺癌轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò),分析轉(zhuǎn)移、復(fù)發(fā)、耐藥相關(guān)基因,應(yīng)用生存分析法篩選預(yù)后相關(guān)基因。隨后,應(yīng)用關(guān)聯(lián)分析法建立EGFR、KRAS突變肺腺癌共有轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò),分析兩者轉(zhuǎn)錄水平的共有關(guān)系及相互作用,篩選共有關(guān)鍵基因。結(jié)果:本研究建立了1個(gè)EGFR、KRAS突變肺腺癌轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫,包括對應(yīng)生存數(shù)據(jù)庫9個(gè),其中基因芯片數(shù)據(jù)庫3個(gè),轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫6個(gè),共納入肺癌患者1542例。構(gòu)建并分析EGFR突變肺腺癌轉(zhuǎn)錄調(diào)控圖譜及mRNA子網(wǎng)絡(luò),發(fā)現(xiàn)關(guān)鍵基因共492個(gè),其中mRNA 323個(gè)、lncRNA 156個(gè)、miRNA 13... 

【文章頁數(shù)】：101 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
中文摘要
英文摘要
1 引言
    1.1 問題的提出與研究意義
    1.2 國內(nèi)外相關(guān)研究綜述
    1.3 研究方法
    1.4 數(shù)據(jù)來源與處理
    1.5 論文框架
    1.6 論文的創(chuàng)新點(diǎn)
2 EGFR、KRAS突變肺腺癌組學(xué)二級數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建
    2.1 對象與方法
    2.2 結(jié)果
    2.3 小結(jié)
3 EGFR突變相關(guān)肺腺癌轉(zhuǎn)錄調(diào)控圖譜的構(gòu)建
    3.1 篩選差異表達(dá)基因
    3.2 EGFR突變肺腺癌轉(zhuǎn)錄調(diào)控圖譜構(gòu)建
    3.3 圖譜內(nèi)關(guān)鍵基因的功能富集分析
    3.4 圖譜內(nèi)關(guān)鍵基因的生存分析
    3.5 小結(jié)
4 KRAS突變相關(guān)肺腺癌轉(zhuǎn)錄調(diào)控圖譜的構(gòu)建
    4.1 篩選差異表達(dá)基因
    4.2 KRAS突變肺腺癌轉(zhuǎn)錄調(diào)控圖譜構(gòu)建
    4.3 關(guān)鍵基因的功能富集分析
    4.4 圖譜內(nèi)關(guān)鍵基因的生存分析
    4.5 小結(jié)
5 EGFR、KRAS突變肺腺癌組學(xué)關(guān)聯(lián)分析及共有轉(zhuǎn)錄調(diào)控圖譜的構(gòu)建
    5.1 EGFR、KRAS突變肺腺癌關(guān)聯(lián)分析
    5.2 EGFR、KRAS突變肺腺癌共有轉(zhuǎn)錄調(diào)控圖譜構(gòu)建
    5.3 小結(jié)
6 結(jié)結(jié)論與討論
    6.1 結(jié)論
    6.2 建議
    6.3 不足與展望
參考文獻(xiàn)
致謝
在學(xué)期間承擔(dān)/參與的科研課題與研究成果
個(gè)人簡歷


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號：3666637