扁蓿豆MrDREB1轉錄因子調(diào)控下游基因的鑒定及其作用機制的初步研究
發(fā)布時間:2022-07-27 17:00
在復雜的逆境脅迫環(huán)境中,DREB(Dehydration Responsive Element Binding Protein)類轉錄因子發(fā)揮重要作用,目前的研究大多集中在對其功能的分析研究,而對其調(diào)控機制少見報道。DREB結合蛋白中第14位氨基酸(纈氨酸V)和第19位氨基酸(谷氨酸E)對于結合DRE/CRT元件非常關鍵,已有研究表明外源MrDREB1基因可以調(diào)控下游逆境脅迫應答基因MrCAS15A的表達,因此,預測MrDREB1通過與MrCAS15A啟動子區(qū)域的DRE/CRT元件直接結合,調(diào)控其表達。本研究主要取得結果如下:1.提取生長4周的幼苗基因組DNA(Deoxyribonucleic Acid),通過PCR克隆得到大小為1266 bp的MrCAS15A的DNA序列,再利用擴增得到的基因組序列信息,運用Genome Walking技術擴增獲得1968 bp MrCAS15A啟動子片段。Plant CARE預測分析結果顯示,該啟動子序列中含有多個抗逆相關的功能元件,其中DRE元件(ATGTCGGTA)位于-(1643-1651)bp,該啟動子中還包含與脫落酸、水楊酸等激素響應相關...
【文章頁數(shù)】:60 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略詞表Abbreviations
一 引言
1.1 扁蓿豆簡介
1.2 植物啟動子概述
1.2.1 啟動子的結構
1.2.2 啟動子的類型
1.2.3 啟動子克隆方法
1.2.4 啟動子功能研究方法
1.3 轉錄因子作用機制及研究進展
1.3.1 轉錄因子與DNA互作的研究進展
1.3.2 轉錄因子與DNA互作研究方法
1.3.3 DREB轉錄因子作用機制
1.3.4 受DREB調(diào)控的下游基因
1.4 本研究目的與意義
二 材料與方法
2.1 實驗材料
2.1.1 植物材料
2.1.2 菌種與菌株
2.1.3 常用試劑與試劑盒
2.1.4 引物序列
2.2 實驗方法
2.2.1 MrCAS15A啟動子的克隆
2.2.2 酵母單雜交實驗
2.2.3 扁蓿豆MrDREB1 下游抗逆基因的鑒定
三 結果與分析
3.1 MrCAS15A啟動子的克隆和序列分析
3.1.1 扁蓿豆基因組DNA的提取
3.1.2 MrCAS15A DNA序列的內(nèi)含子預測
3.1.3 PCR克隆MrCAS15A DNA序列
3.1.4 MrCAS15A DNA序列測序比對結果
3.1.5 MrCAS15A啟動子克隆
3.1.6 MrCAS15A的啟動子的生物信息學分析
3.2 酵母單雜交實驗
3.2.1 酵母表達載體pAbAi-3×DRE/3×DRE mutant的構建
3.2.2 pAbAi-3×DRE/3×DRE mutant酵母誘餌菌株的獲得
3.2.3 假陽性檢測
3.2.4 酵母表達載體pGADT7 AD-MrDREB1 的構建
3.2.5 pGADT7-MrDREB1-pAbAi-3×DRE/3×DRE mutant酵母菌株的獲得
3.2.6 DRE元件與MrDREB1 蛋白互作
3.3 轉基因扁蓿豆MrDREB1 的功能驗證
3.3.1 扁蓿豆轉基因根部的熒光檢測
3.3.2 逆境脅迫下轉基因扁蓿豆的根部表型統(tǒng)計
3.3.3 扁蓿豆轉基因根部的生理生化指標檢測
3.3.4 扁蓿豆RNA的提取
3.3.5 qRT-PCR
四 結論與討論
4.1 討論
4.2 結論
參考文獻
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]啟動子的類型及應用[J]. 賀飛燕,閆建俊,白云鳳,馮瑞云,施俊鳳. 山西農(nóng)業(yè)科學. 2017(01)
[2]牡丹抗逆轉錄因子基因PsDREB的功能解析[J]. 劉慧春,馬廣瑩,朱開元,鄒清成,周江華,田丹青. 浙江大學學報(農(nóng)業(yè)與生命科學版). 2016(06)
[3]荔枝古樹胚性愈傷組織LcCu/Zn-SOD3基因啟動子的克隆及功能驗證[J]. 練從龍,盧秉國,賴鐘雄,馮新,林玉玲,陳裕坤,張梓浩. 西北植物學報. 2015(01)
[4]植物逆境脅迫耐受性啟動子的研究進展[J]. 張晶紅,那杰. 植物生理學報. 2014(06)
[5]內(nèi)蒙古扁蓿豆葉片解剖性狀與抗旱性的研究[J]. 李鴻雁,李志勇,師文貴,蔡麗艷,劉磊. 草業(yè)學報. 2012(03)
[6]內(nèi)蒙古扁蓿豆野生資源形態(tài)特征研究[J]. 韓海波,師文貴,王曉娜,李志勇,李鴻雁,李興酉,劉磊. 植物遺傳資源學報. 2011(05)
[7]植物誘導型啟動子的研究進展[J]. 王志新,趙琳,李文濱. 大豆科技. 2011(03)
[8]扁蓿豆的抗性研究進展[J]. 韓海波,師文貴,李志勇,李鴻雁,李興酉,劉磊,王曉娜. 草業(yè)科學. 2011(04)
[9]植物組織特異性啟動子的研究進展[J]. 糜賽男,曹明富. 生物學教學. 2010(07)
[10]藻類基因啟動子結構與功能研究進展[J]. 張學成,郭楠,宋曉金. 中國海洋大學學報(自然科學版). 2008(03)
博士論文
[1]扁蓿豆抗寒相關基因的克隆與表達分析[D]. 張宇.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2013
[2]大豆、小麥抗逆相關Gm/TaAREB轉錄因子基因、啟動子克隆及功能鑒定[D]. 高世慶.中國農(nóng)業(yè)科學院 2007
碩士論文
[1]陸地棉GhMBF1c基因及其啟動子的克隆與分析[D]. 楊召恩.中國農(nóng)業(yè)科學院 2013
[2]基于芯片數(shù)據(jù)的水稻非生物逆境相關基因篩選及其啟動子分析[D]. 李嘉平.湖南農(nóng)業(yè)大學 2012
[3]水稻種胚特異基因OsESG1及其啟動子的研究[D]. 房孝良.山東師范大學 2012
[4]枳根特異性contig2基因及啟動子的克隆與分析[D]. 李鳳龍.西南大學 2012
[5]一種啟動子探針載體的構建及低溫誘導啟動子的研究[D]. 沈林麗.南京理工大學 2010
本文編號:3665835
【文章頁數(shù)】:60 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略詞表Abbreviations
一 引言
1.1 扁蓿豆簡介
1.2 植物啟動子概述
1.2.1 啟動子的結構
1.2.2 啟動子的類型
1.2.3 啟動子克隆方法
1.2.4 啟動子功能研究方法
1.3 轉錄因子作用機制及研究進展
1.3.1 轉錄因子與DNA互作的研究進展
1.3.2 轉錄因子與DNA互作研究方法
1.3.3 DREB轉錄因子作用機制
1.3.4 受DREB調(diào)控的下游基因
1.4 本研究目的與意義
二 材料與方法
2.1 實驗材料
2.1.1 植物材料
2.1.2 菌種與菌株
2.1.3 常用試劑與試劑盒
2.1.4 引物序列
2.2 實驗方法
2.2.1 MrCAS15A啟動子的克隆
2.2.2 酵母單雜交實驗
2.2.3 扁蓿豆MrDREB1 下游抗逆基因的鑒定
三 結果與分析
3.1 MrCAS15A啟動子的克隆和序列分析
3.1.1 扁蓿豆基因組DNA的提取
3.1.2 MrCAS15A DNA序列的內(nèi)含子預測
3.1.3 PCR克隆MrCAS15A DNA序列
3.1.4 MrCAS15A DNA序列測序比對結果
3.1.5 MrCAS15A啟動子克隆
3.1.6 MrCAS15A的啟動子的生物信息學分析
3.2 酵母單雜交實驗
3.2.1 酵母表達載體pAbAi-3×DRE/3×DRE mutant的構建
3.2.2 pAbAi-3×DRE/3×DRE mutant酵母誘餌菌株的獲得
3.2.3 假陽性檢測
3.2.4 酵母表達載體pGADT7 AD-MrDREB1 的構建
3.2.5 pGADT7-MrDREB1-pAbAi-3×DRE/3×DRE mutant酵母菌株的獲得
3.2.6 DRE元件與MrDREB1 蛋白互作
3.3 轉基因扁蓿豆MrDREB1 的功能驗證
3.3.1 扁蓿豆轉基因根部的熒光檢測
3.3.2 逆境脅迫下轉基因扁蓿豆的根部表型統(tǒng)計
3.3.3 扁蓿豆轉基因根部的生理生化指標檢測
3.3.4 扁蓿豆RNA的提取
3.3.5 qRT-PCR
四 結論與討論
4.1 討論
4.2 結論
參考文獻
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]啟動子的類型及應用[J]. 賀飛燕,閆建俊,白云鳳,馮瑞云,施俊鳳. 山西農(nóng)業(yè)科學. 2017(01)
[2]牡丹抗逆轉錄因子基因PsDREB的功能解析[J]. 劉慧春,馬廣瑩,朱開元,鄒清成,周江華,田丹青. 浙江大學學報(農(nóng)業(yè)與生命科學版). 2016(06)
[3]荔枝古樹胚性愈傷組織LcCu/Zn-SOD3基因啟動子的克隆及功能驗證[J]. 練從龍,盧秉國,賴鐘雄,馮新,林玉玲,陳裕坤,張梓浩. 西北植物學報. 2015(01)
[4]植物逆境脅迫耐受性啟動子的研究進展[J]. 張晶紅,那杰. 植物生理學報. 2014(06)
[5]內(nèi)蒙古扁蓿豆葉片解剖性狀與抗旱性的研究[J]. 李鴻雁,李志勇,師文貴,蔡麗艷,劉磊. 草業(yè)學報. 2012(03)
[6]內(nèi)蒙古扁蓿豆野生資源形態(tài)特征研究[J]. 韓海波,師文貴,王曉娜,李志勇,李鴻雁,李興酉,劉磊. 植物遺傳資源學報. 2011(05)
[7]植物誘導型啟動子的研究進展[J]. 王志新,趙琳,李文濱. 大豆科技. 2011(03)
[8]扁蓿豆的抗性研究進展[J]. 韓海波,師文貴,李志勇,李鴻雁,李興酉,劉磊,王曉娜. 草業(yè)科學. 2011(04)
[9]植物組織特異性啟動子的研究進展[J]. 糜賽男,曹明富. 生物學教學. 2010(07)
[10]藻類基因啟動子結構與功能研究進展[J]. 張學成,郭楠,宋曉金. 中國海洋大學學報(自然科學版). 2008(03)
博士論文
[1]扁蓿豆抗寒相關基因的克隆與表達分析[D]. 張宇.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學 2013
[2]大豆、小麥抗逆相關Gm/TaAREB轉錄因子基因、啟動子克隆及功能鑒定[D]. 高世慶.中國農(nóng)業(yè)科學院 2007
碩士論文
[1]陸地棉GhMBF1c基因及其啟動子的克隆與分析[D]. 楊召恩.中國農(nóng)業(yè)科學院 2013
[2]基于芯片數(shù)據(jù)的水稻非生物逆境相關基因篩選及其啟動子分析[D]. 李嘉平.湖南農(nóng)業(yè)大學 2012
[3]水稻種胚特異基因OsESG1及其啟動子的研究[D]. 房孝良.山東師范大學 2012
[4]枳根特異性contig2基因及啟動子的克隆與分析[D]. 李鳳龍.西南大學 2012
[5]一種啟動子探針載體的構建及低溫誘導啟動子的研究[D]. 沈林麗.南京理工大學 2010
本文編號:3665835
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/3665835.html
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