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日本七鰓鰻CXCL12和CXCR4編碼基因的克隆及生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2022-07-16 18:12
  七鰓鰻是迄今為止最為原始的無(wú)頜類脊椎動(dòng)物,是名副其實(shí)的“活化石”。寒武紀(jì)時(shí)期的甲胄魚(yú)類與七鰓鰻有共同的祖先,七鰓鰻無(wú)論是在脊椎動(dòng)物進(jìn)化研究上還是免疫系統(tǒng)的研究中都被作為適應(yīng)性進(jìn)化和起源的新型模式生物。海七鰓鰻(Petromyzon marinus)作為無(wú)頜類脊椎動(dòng)物的典型代表之一,成為海洋生物進(jìn)化的模式生物。日本七鰓鰻(Lampetra japonica)分布在我國(guó)東北部鴨綠江流域,是與海七鰓鰻親緣關(guān)系極為接近的主要七鰓鰻物種。目前有關(guān)七鰓鰻的基礎(chǔ)研究工作,主要集中在已經(jīng)完成全基因組測(cè)序的日本七鰓鰻和海七鰓鰻。在哺乳動(dòng)物中,趨化因子配體12(Chemokine(C-X-C motif)ligand 12,CXCL12),又稱基質(zhì)細(xì)胞衍生因子1(stromal cell-derived factor-1,SDF-1)以及前B細(xì)胞刺激因子(pre-B cell growth-stimulating factor),與其受體CXCR4(CXC chemokine receptor 4)分別屬于CXC類趨化因子和CXCR類G蛋白偶聯(lián)受體(G-protein coupled receptor,G... 

【文章頁(yè)數(shù)】:94 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 引言
    1.1 七鰓鰻簡(jiǎn)介
    1.2 趨化因子
        1.2.1 趨化因子簡(jiǎn)介
        1.2.2 趨化因子數(shù)量與種類
        1.2.3 趨化因子特性與功能
    1.3 CXCL12
        1.3.1 CXCL12簡(jiǎn)介
        1.3.2 CXCL12的分類與結(jié)構(gòu)特征
        1.3.3 CXCL12生理學(xué)作用
    1.4 G蛋白偶聯(lián)受體
        1.4.1 G蛋白偶聯(lián)受體簡(jiǎn)介
        1.4.2 G蛋白偶聯(lián)受體信號(hào)通路及醫(yī)學(xué)價(jià)值
    1.5 CXCL12的受體
        1.5.1 趨化因子受體簡(jiǎn)介
        1.5.2 CXCR4命名與結(jié)構(gòu)特征
        1.5.3 CXCL12/CXCR4信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑
第二章 日本七鰓鰻CXCL12的克隆及生物信息學(xué)分析
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.1.1 實(shí)驗(yàn)用魚(yú)系
        2.1.2 試劑
        2.1.3 儀器
    2.2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.2.1 通過(guò)本地Blast方法挖掘日本七鰓鰻CXCL12基因
        2.2.2 構(gòu)建重組質(zhì)粒pMD19-T-CXCL
        2.2.3 日本七鰓鰻CXCL12蛋白基本性質(zhì)分析
        2.2.4 日本七鰓鰻CXCL12親/疏水性分析
        2.2.5 日本七鰓鰻CXCL12信號(hào)肽預(yù)測(cè)
        2.2.6 日本七鰓鰻CXCL12(mRNA)結(jié)構(gòu)模擬
        2.2.7 日本七鰓鰻CXCL12基因同源性分析
        2.2.8 日本七鰓鰻CXCL12二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
        2.2.9 日本七鰓鰻CXCL12進(jìn)化地位分析
    2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        2.3.1 日本七鰓鰻CXCL12克隆及序列分析
        2.3.2 日本七鰓鰻CXCL12為可溶性蛋白
        2.3.3 日本七鰓鰻CXCL12蛋白基本性質(zhì)分析
        2.3.4 日本七鰓鰻CXCL12含有1 個(gè)信號(hào)肽
        2.3.5 日本七鰓鰻CXCL12蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)以α-螺旋為主
        2.3.6 日本七鰓鰻CXCL12關(guān)鍵基因位點(diǎn)相對(duì)保守
        2.3.7 日本七鰓鰻CXCL12蛋白進(jìn)化地位較為原始
    2.4 討論
第三章 日本七鰓鰻CXCR4的克隆表達(dá)及生物信息學(xué)分析
    3.1 實(shí)驗(yàn)材料
        3.1.1 實(shí)驗(yàn)用魚(yú)系
        3.1.2 試劑
        3.1.3 儀器
    3.2 實(shí)驗(yàn)方法
        3.2.1 通過(guò)本地Blast方法挖掘日本七鰓鰻CXCR4基因序列
        3.2.2 構(gòu)建重組質(zhì)粒Rho-pCMV-CXCR4和Lucy-Rho-pCMV-CXCR4
        3.2.3 日本七鰓鰻CXCR4蛋白基本性質(zhì)分析
        3.2.4 日本七鰓鰻CXCR4親/疏水性分析
        3.2.5 日本七鰓鰻CXCR4蛋白同源性分析
        3.2.6 日本七鰓鰻CXCR4二/三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
        3.2.7 日本七鰓鰻CXCR4跨膜結(jié)構(gòu)域及保守性分析
        3.2.8 日本七鰓鰻CXCR4進(jìn)化地位分析
        3.2.9 日本七鰓鰻CXCR4膜表達(dá)分析
    3.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        3.3.1 日本七鰓鰻CXCR4克隆及序列分析
        3.3.2 日本七鰓鰻CXCR4為可溶性蛋白
        3.3.3 日本七鰓鰻CXCR4蛋白基本性質(zhì)分析
        3.3.4 日本七鰓鰻CXCR4蛋白具有七次跨膜結(jié)構(gòu)域
        3.3.5 日本七鰓鰻CXCR4跨膜區(qū)域相對(duì)保守
        3.3.6 日本七鰓鰻CXCR4蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)以α-螺旋為主
        3.3.7 日本七鰓鰻CXCR4蛋白與常見(jiàn)物種CXCR4蛋白同源性較為一致
        3.3.8 日本七鰓鰻CXCR4進(jìn)化地位較為原始
        3.3.9 日本七鰓鰻CXCR4在HKE293T細(xì)胞膜上表達(dá)
    3.4 討論
第四章 全文總結(jié)與展望
參考文獻(xiàn)
附錄 攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表論文情況
致謝


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[2]基質(zhì)細(xì)胞衍生因子1與其G蛋白偶聯(lián)受體(CXCR4)信號(hào)軸相關(guān)生物學(xué)特性[J]. 吳周玲,白什爾,班桂飛,陳文霞.  中國(guó)組織工程研究. 2019(09)
[3]G蛋白偶聯(lián)受體的信號(hào)通路多樣性及藥物開(kāi)發(fā)[J]. 楊照,肖鵬,于曉,孫金鵬.  中國(guó)科學(xué):生命科學(xué). 2018(11)
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[8]CXCL12-CXCR4/CXCR7趨化軸在結(jié)直腸癌中作用的研究進(jìn)展[J]. 楊丹,褚曉源.  醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報(bào). 2015(01)
[9]CXCL12-α基因編碼區(qū)的克隆與生物信息學(xué)分析[J]. 陳宏遠(yuǎn),譚毅,馬偉峰,劉曉,邵方元,符吳萸,芮雯.  生物技術(shù). 2014(03)
[10]鱸魚(yú)cxcr4 cDNA克隆和序列分析[J]. 吳風(fēng)瑞,丁彪,劉勇,李文雍.  阜陽(yáng)師范學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2013(02)

碩士論文
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[2]西伯利亞鱘CXCR7基因cDNA全長(zhǎng)的克隆及表達(dá)分析[D]. 郭大慶.上海海洋大學(xué) 2012
[3]豬CXCR7基因的克隆及CXCR4與CXCR7基因的功能預(yù)測(cè)、SNP檢測(cè)及性狀關(guān)聯(lián)分析[D]. 任云斌.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[4]人趨化因子受體CXCR4基因克隆表達(dá)及其在乳腺癌中應(yīng)用研究[D]. 王利.華中師范大學(xué) 2006



本文編號(hào):3663015

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