斑塊型銀屑病患者外周血SLC35E2B基因的表達及其變異研究
發(fā)布時間:2022-07-08 09:25
目的通過檢測斑塊型銀屑病患者外周血中SLC35E2B的表達情況,并利用數(shù)據(jù)庫分析基因富集的功能和參與的通路,探討SLC35E2B在銀屑病發(fā)病機制中的作用。方法收集斑塊型銀屑病47例、正常對照14例的外周靜脈血,提取樣本基因組DNA,用外顯子捕獲-高通量測序(exon-capture high-throughput sequencing,EC-HTS)技術進行檢測,數(shù)據(jù)經(jīng)過Calling、數(shù)據(jù)庫比對、軟件分析得到最終SLC35E2B基因病理性突變位點,利用GO和KEGG pathway數(shù)據(jù)庫分析基因富集的功能和參與的通路。結果對61例樣本所得數(shù)據(jù)進行生物信息學分析得到致病性突變位點1個:SLC35E2Bc.833C>T(p.T278M),僅見于斑塊型銀屑病組,正常組未見;GO富集提示SLC35E2B生物學過程主要涉及調節(jié)IL-12家族細胞因子、IL-17家族細胞因子、調節(jié)對生物刺激的細胞應答、TNF的合成、調節(jié)Th1細胞相關的免疫應答以及抵抗病原微生物等多細胞生物過程;KEGG通路分析提示SLC35E2B基因主要與結核病、1型糖尿病、弓形蟲病、哮喘、類風濕性關節(jié)炎等疾病相關。結論 ...
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
SLC35E2B KEGG pathway 分析結果
本文編號:3656765
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