高原鼢鼠p53基因?qū)Φ脱醯膽?yīng)答及對(duì)下游靶基因表達(dá)調(diào)控的特異性
發(fā)布時(shí)間:2022-07-01 10:15
高原鼢鼠(Myospalax baileyi)生活在海拔2 800 m-4 200 m的地區(qū),是世居青藏高原的一種地下鼠,對(duì)嚴(yán)重的低氧環(huán)境有很強(qiáng)的適應(yīng)性。p53是一個(gè)重要的腫瘤抑制因子,通過(guò)一系列下游靶基因調(diào)控細(xì)胞周期、細(xì)胞凋亡、DNA損傷修復(fù)和血管生成等,對(duì)動(dòng)物壽命和防癌具有重要的作用。為了進(jìn)一步探討高原鼢鼠對(duì)高海拔洞道嚴(yán)重低氧環(huán)境的適應(yīng)機(jī)制,本文采用RT-PCR技術(shù)克隆得到了高原鼢鼠p53的編碼區(qū)序列,利用生物信息學(xué)方法對(duì)p53及其下游細(xì)胞周期、細(xì)胞凋亡、DNA修復(fù)相關(guān)基因序列進(jìn)行了進(jìn)化特異性分析,并以SD大鼠為對(duì)照,研究了p53及其下游基因在不同海拔條件下(3 300 m和2 260 m)的表達(dá)模式。結(jié)果表明:(1)高原鼢鼠p53基因的編碼區(qū)序列長(zhǎng)1179bp,編碼372個(gè)氨基酸殘基。高原鼢鼠p53基因序列與編碼的氨基酸序列與甘肅鼢鼠和以色列鼴鼠p53的同源性最高,分別為98.47%、98.98%和93.30%、95.41%;高原鼢鼠與甘肅鼢鼠、以色列鼴鼠、裸鼴鼠和大鼠p53氨基酸序列相比,分別有4、17、48和59處變異,其中在DNA結(jié)合域分別有2、3、12和16處變異;高原鼢...
【文章頁(yè)數(shù)】:143 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
第一章 引言
1.1 青藏高原
1.1.1 青藏高原自然環(huán)境
1.1.2 高原低氧環(huán)境對(duì)人和動(dòng)物的影響及其適應(yīng)
1.2 地下鼠及其對(duì)低氧環(huán)境的適應(yīng)
1.2.1 地下鼠及其生境特點(diǎn)
1.2.2 地下鼠對(duì)地下洞道生境的適應(yīng)
1.2.3 高原鼢鼠及其生境特征
1.2.4 高原鼢鼠對(duì)地下低氧環(huán)境的適應(yīng)
1.2.5 地下鼠長(zhǎng)壽抗癌的機(jī)制
1.3 p53
1.3.1 p53及其結(jié)構(gòu)
1.3.2 p53功能
1.3.3 p53突變
1.3.4 低氧與p53
1.3.5 地下鼠與p53
1.4 本論文的主要科學(xué)問(wèn)題、研究?jī)?nèi)容、目的及意義
1.4.1 本論文的主要科學(xué)問(wèn)題
1.4.2 本論文的研究?jī)?nèi)容
1.4.3 本論文的目的及意義
第二章 高原鼢鼠p53基因的克隆及其對(duì)不同低氧環(huán)境的應(yīng)答
2.1 材料與方法
2.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
2.1.2 主要實(shí)驗(yàn)儀器
2.1.3 主要試劑
2.1.4 實(shí)驗(yàn)方法
2.2 結(jié)果
2.2.1 高原鼢鼠p53基因的克隆及序列分析
2.2.2 高原鼢鼠p53變異位點(diǎn)分析
2.2.3 物種樹(shù)的構(gòu)建
2.2.4 高原鼢鼠p53選擇壓力分析
2.2.5 高原鼢鼠p53序列進(jìn)化分析
2.2.6 高原鼢鼠p53變異位點(diǎn)對(duì)其功能影響的評(píng)估
2.2.7 不同海拔條件下高原鼢鼠和SD大鼠組織中p53表達(dá)水平
2.2.8 HIF-1α 與p53結(jié)合位點(diǎn)比對(duì)分析
2.3 討論
第三章 高原鼢鼠p53下游細(xì)胞周期相關(guān)基因的進(jìn)化和表達(dá)
3.1 材料與方法
3.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
3.1.2 高原鼢鼠細(xì)胞周期相關(guān)基因序列獲取
3.1.3 高原鼢鼠細(xì)胞周期相關(guān)基因序列分析
3.1.4 高原鼢鼠細(xì)胞周期相關(guān)基因選擇壓力、進(jìn)化分析
3.1.5 高原鼢鼠細(xì)胞周期相關(guān)基因變異位點(diǎn)對(duì)其功能影響的評(píng)估
3.1.6 表達(dá)水平測(cè)定
3.2 結(jié)果
3.2.1 高原鼢鼠細(xì)胞周期相關(guān)基因序列分析及同源性比對(duì)
3.2.2 高原鼢鼠細(xì)胞周期相關(guān)基因選擇壓力分析
3.2.3 高原鼢鼠細(xì)胞周期相關(guān)基因序列進(jìn)化分析
3.2.4 高原鼢鼠細(xì)胞周期相關(guān)基因序列變異位點(diǎn)對(duì)其功能影響的評(píng)估
3.2.5 高原鼢鼠和SD大鼠肝臟組織中細(xì)胞周期基因表達(dá)水平
3.2.6 高原鼢鼠和SD大鼠肺臟組織中細(xì)胞周期基因表達(dá)水平
3.2.7 高原鼢鼠和SD大鼠骨骼肌組織中細(xì)胞周期基因表達(dá)水平
3.3 討論
第四章 高原鼢鼠p53下游細(xì)胞凋亡相關(guān)基因的進(jìn)化和表達(dá)
4.1 材料與方法
4.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
4.1.2 高原鼢鼠細(xì)胞凋亡相關(guān)基因序列獲取
4.1.3 高原鼢鼠細(xì)胞凋亡相關(guān)基因序列分析
4.1.4 高原鼢鼠細(xì)胞凋亡相關(guān)基因選擇壓力、進(jìn)化分析
4.1.5 高原鼢鼠細(xì)胞凋亡相關(guān)基因變異位點(diǎn)對(duì)其功能影響的評(píng)估
4.1.6 表達(dá)水平測(cè)定
4.2 結(jié)果
4.2.1 高原鼢鼠細(xì)胞凋亡相關(guān)基因序列分析及同源性比對(duì)
4.2.2 高原鼢鼠細(xì)胞凋亡相關(guān)基因選擇壓力分析
4.2.3 高原鼢鼠細(xì)胞凋亡相關(guān)基因序列進(jìn)化分析
4.2.4 高原鼢鼠細(xì)胞凋亡相關(guān)基因序列變異位點(diǎn)對(duì)其功能影響的評(píng)估
4.2.5 高原鼢鼠和SD大鼠組織中細(xì)胞凋亡基因表達(dá)水平
4.3 討論
第五章 高原鼢鼠p53下游DNA修復(fù)相關(guān)基因的進(jìn)化和表達(dá)
5.1 材料與方法
5.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
5.1.2 高原鼢鼠DNA修復(fù)相關(guān)基因序列獲取
5.1.3 高原鼢鼠DNA修復(fù)相關(guān)基因序列分析
5.1.4 高原鼢鼠DNA修復(fù)相關(guān)基因選擇壓力、進(jìn)化分析
5.1.5 高原鼢鼠DNA修復(fù)相關(guān)基因變異位點(diǎn)對(duì)其功能影響的評(píng)估
5.1.6 表達(dá)水平測(cè)定
5.2 結(jié)果
5.2.1 高原鼢鼠DNA修復(fù)相關(guān)基因序列分析及同源性比對(duì)
5.2.2 高原鼢鼠DNA修復(fù)相關(guān)基因選擇壓力分析
5.2.3 高原鼢鼠DNA修復(fù)相關(guān)基因序列進(jìn)化分析
5.2.4 高原鼢鼠DNA修復(fù)相關(guān)基因序列變異位點(diǎn)對(duì)其功能影響的評(píng)估
5.2.5 高原鼢鼠和SD大鼠組織中DNA修復(fù)基因表達(dá)水平
5.3 討論
第六章 全文總結(jié)
6.1 主要結(jié)論
6.2 論文創(chuàng)新點(diǎn)
6.3 論文的不足
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡(jiǎn)歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]青藏高原史前人類定居歷史與藏族人群對(duì)高原低氧環(huán)境的適應(yīng)機(jī)制[J]. 崔超英,祁學(xué)斌,歐珠羅布,吳天一,宿兵. 高原科學(xué)研究. 2017(01)
[2]藏、漢族中遺傳差異與高原低氧適應(yīng)研究[J]. 李小薇,李翠瑩. 中國(guó)輸血雜志. 2017(08)
[3]祁連山東段高原鼢鼠采食洞道氣體研究[J]. 田永亮,牛鈺杰,姬程鵬,周延山,楚彬,花立民. 獸類學(xué)報(bào). 2017(02)
[4]環(huán)境低氧對(duì)高原鼢鼠和高原鼠兔肝臟組織VEGFxxx的表達(dá)和微血管密度的影響[J]. 魏蓮,陳林,許麗娜,魏登邦. 青海大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2015(03)
[5]利用轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析高原鼢鼠和裸鼴鼠基因的趨同進(jìn)化[J]. 鄧小弓,王堃,張守棟,蘇建平,張同作,林恭華. 獸類學(xué)報(bào). 2014(02)
[6]低氧應(yīng)激下甘肅鼢鼠與SD大鼠心臟抗氧化酶和ATP酶活性的比較[J]. 唐燕紅,王劍,李金鋼,謝惠春,李濤,何建平. 獸類學(xué)報(bào). 2013(02)
[7]細(xì)胞凋亡通路研究進(jìn)展[J]. 趙彥超,顧耘. 現(xiàn)代醫(yī)學(xué). 2013(04)
[8]模擬高原低氧對(duì)p53及其靶基因表達(dá)的調(diào)節(jié)[J]. 王銘洋,趙陽(yáng),張圣婷,陳學(xué)群,杜繼曾. 中國(guó)應(yīng)用生理學(xué)雜志. 2013(02)
[9]藏羚羊與藏綿羊心肌、骨骼肌中肌紅蛋白含量和乳酸脫氫酶活性的比較[J]. 馬蘭,楊應(yīng)忠,靳國(guó)恩,格日力. 動(dòng)物學(xué)雜志. 2012(03)
[10]高原習(xí)服與低氧預(yù)適應(yīng)[J]. 陳良恩,安瑞卿. 國(guó)際病理科學(xué)與臨床雜志. 2012(02)
博士論文
[1]藏羚羊STAT3、HIF-1α和HIF-2α基因表達(dá)的生物學(xué)意義[D]. 劉芳.青海大學(xué) 2012
碩士論文
[1]高原鼢鼠血紅蛋白氧合特性及其分子機(jī)制[D]. 蒲鵬.蘭州大學(xué) 2018
[2]高原鼢鼠和甘肅鼢鼠MDM2轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)及p53甲基化分析[D]. 楊志.浙江大學(xué) 2017
[3]高原鼢鼠洞道氣體變化研究[D]. 張小剛.蘭州大學(xué) 2016
[4]甘肅鼢鼠血氧親和力與血液酸堿特性研究[D]. 嚴(yán)婷婷.陜西師范大學(xué) 2011
[5]高原鼢鼠(Myospalax baileyi)血紅蛋白的基因克隆[D]. 劉丹.曲阜師范大學(xué) 2010
[6]高原鼢鼠、高原鼠兔的骨骼肌對(duì)低氧環(huán)境的適應(yīng)機(jī)制[D]. 朱世海.青海大學(xué) 2009
[7]高原鼢鼠HIF-1α及HO-1在組織中的季節(jié)性表達(dá)[D]. 張建梅.青海大學(xué) 2007
本文編號(hào):3654052
【文章頁(yè)數(shù)】:143 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
第一章 引言
1.1 青藏高原
1.1.1 青藏高原自然環(huán)境
1.1.2 高原低氧環(huán)境對(duì)人和動(dòng)物的影響及其適應(yīng)
1.2 地下鼠及其對(duì)低氧環(huán)境的適應(yīng)
1.2.1 地下鼠及其生境特點(diǎn)
1.2.2 地下鼠對(duì)地下洞道生境的適應(yīng)
1.2.3 高原鼢鼠及其生境特征
1.2.4 高原鼢鼠對(duì)地下低氧環(huán)境的適應(yīng)
1.2.5 地下鼠長(zhǎng)壽抗癌的機(jī)制
1.3 p53
1.3.1 p53及其結(jié)構(gòu)
1.3.2 p53功能
1.3.3 p53突變
1.3.4 低氧與p53
1.3.5 地下鼠與p53
1.4 本論文的主要科學(xué)問(wèn)題、研究?jī)?nèi)容、目的及意義
1.4.1 本論文的主要科學(xué)問(wèn)題
1.4.2 本論文的研究?jī)?nèi)容
1.4.3 本論文的目的及意義
第二章 高原鼢鼠p53基因的克隆及其對(duì)不同低氧環(huán)境的應(yīng)答
2.1 材料與方法
2.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
2.1.2 主要實(shí)驗(yàn)儀器
2.1.3 主要試劑
2.1.4 實(shí)驗(yàn)方法
2.2 結(jié)果
2.2.1 高原鼢鼠p53基因的克隆及序列分析
2.2.2 高原鼢鼠p53變異位點(diǎn)分析
2.2.3 物種樹(shù)的構(gòu)建
2.2.4 高原鼢鼠p53選擇壓力分析
2.2.5 高原鼢鼠p53序列進(jìn)化分析
2.2.6 高原鼢鼠p53變異位點(diǎn)對(duì)其功能影響的評(píng)估
2.2.7 不同海拔條件下高原鼢鼠和SD大鼠組織中p53表達(dá)水平
2.2.8 HIF-1α 與p53結(jié)合位點(diǎn)比對(duì)分析
2.3 討論
第三章 高原鼢鼠p53下游細(xì)胞周期相關(guān)基因的進(jìn)化和表達(dá)
3.1 材料與方法
3.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
3.1.2 高原鼢鼠細(xì)胞周期相關(guān)基因序列獲取
3.1.3 高原鼢鼠細(xì)胞周期相關(guān)基因序列分析
3.1.4 高原鼢鼠細(xì)胞周期相關(guān)基因選擇壓力、進(jìn)化分析
3.1.5 高原鼢鼠細(xì)胞周期相關(guān)基因變異位點(diǎn)對(duì)其功能影響的評(píng)估
3.1.6 表達(dá)水平測(cè)定
3.2 結(jié)果
3.2.1 高原鼢鼠細(xì)胞周期相關(guān)基因序列分析及同源性比對(duì)
3.2.2 高原鼢鼠細(xì)胞周期相關(guān)基因選擇壓力分析
3.2.3 高原鼢鼠細(xì)胞周期相關(guān)基因序列進(jìn)化分析
3.2.4 高原鼢鼠細(xì)胞周期相關(guān)基因序列變異位點(diǎn)對(duì)其功能影響的評(píng)估
3.2.5 高原鼢鼠和SD大鼠肝臟組織中細(xì)胞周期基因表達(dá)水平
3.2.6 高原鼢鼠和SD大鼠肺臟組織中細(xì)胞周期基因表達(dá)水平
3.2.7 高原鼢鼠和SD大鼠骨骼肌組織中細(xì)胞周期基因表達(dá)水平
3.3 討論
第四章 高原鼢鼠p53下游細(xì)胞凋亡相關(guān)基因的進(jìn)化和表達(dá)
4.1 材料與方法
4.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
4.1.2 高原鼢鼠細(xì)胞凋亡相關(guān)基因序列獲取
4.1.3 高原鼢鼠細(xì)胞凋亡相關(guān)基因序列分析
4.1.4 高原鼢鼠細(xì)胞凋亡相關(guān)基因選擇壓力、進(jìn)化分析
4.1.5 高原鼢鼠細(xì)胞凋亡相關(guān)基因變異位點(diǎn)對(duì)其功能影響的評(píng)估
4.1.6 表達(dá)水平測(cè)定
4.2 結(jié)果
4.2.1 高原鼢鼠細(xì)胞凋亡相關(guān)基因序列分析及同源性比對(duì)
4.2.2 高原鼢鼠細(xì)胞凋亡相關(guān)基因選擇壓力分析
4.2.3 高原鼢鼠細(xì)胞凋亡相關(guān)基因序列進(jìn)化分析
4.2.4 高原鼢鼠細(xì)胞凋亡相關(guān)基因序列變異位點(diǎn)對(duì)其功能影響的評(píng)估
4.2.5 高原鼢鼠和SD大鼠組織中細(xì)胞凋亡基因表達(dá)水平
4.3 討論
第五章 高原鼢鼠p53下游DNA修復(fù)相關(guān)基因的進(jìn)化和表達(dá)
5.1 材料與方法
5.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
5.1.2 高原鼢鼠DNA修復(fù)相關(guān)基因序列獲取
5.1.3 高原鼢鼠DNA修復(fù)相關(guān)基因序列分析
5.1.4 高原鼢鼠DNA修復(fù)相關(guān)基因選擇壓力、進(jìn)化分析
5.1.5 高原鼢鼠DNA修復(fù)相關(guān)基因變異位點(diǎn)對(duì)其功能影響的評(píng)估
5.1.6 表達(dá)水平測(cè)定
5.2 結(jié)果
5.2.1 高原鼢鼠DNA修復(fù)相關(guān)基因序列分析及同源性比對(duì)
5.2.2 高原鼢鼠DNA修復(fù)相關(guān)基因選擇壓力分析
5.2.3 高原鼢鼠DNA修復(fù)相關(guān)基因序列進(jìn)化分析
5.2.4 高原鼢鼠DNA修復(fù)相關(guān)基因序列變異位點(diǎn)對(duì)其功能影響的評(píng)估
5.2.5 高原鼢鼠和SD大鼠組織中DNA修復(fù)基因表達(dá)水平
5.3 討論
第六章 全文總結(jié)
6.1 主要結(jié)論
6.2 論文創(chuàng)新點(diǎn)
6.3 論文的不足
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡(jiǎn)歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]青藏高原史前人類定居歷史與藏族人群對(duì)高原低氧環(huán)境的適應(yīng)機(jī)制[J]. 崔超英,祁學(xué)斌,歐珠羅布,吳天一,宿兵. 高原科學(xué)研究. 2017(01)
[2]藏、漢族中遺傳差異與高原低氧適應(yīng)研究[J]. 李小薇,李翠瑩. 中國(guó)輸血雜志. 2017(08)
[3]祁連山東段高原鼢鼠采食洞道氣體研究[J]. 田永亮,牛鈺杰,姬程鵬,周延山,楚彬,花立民. 獸類學(xué)報(bào). 2017(02)
[4]環(huán)境低氧對(duì)高原鼢鼠和高原鼠兔肝臟組織VEGFxxx的表達(dá)和微血管密度的影響[J]. 魏蓮,陳林,許麗娜,魏登邦. 青海大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2015(03)
[5]利用轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析高原鼢鼠和裸鼴鼠基因的趨同進(jìn)化[J]. 鄧小弓,王堃,張守棟,蘇建平,張同作,林恭華. 獸類學(xué)報(bào). 2014(02)
[6]低氧應(yīng)激下甘肅鼢鼠與SD大鼠心臟抗氧化酶和ATP酶活性的比較[J]. 唐燕紅,王劍,李金鋼,謝惠春,李濤,何建平. 獸類學(xué)報(bào). 2013(02)
[7]細(xì)胞凋亡通路研究進(jìn)展[J]. 趙彥超,顧耘. 現(xiàn)代醫(yī)學(xué). 2013(04)
[8]模擬高原低氧對(duì)p53及其靶基因表達(dá)的調(diào)節(jié)[J]. 王銘洋,趙陽(yáng),張圣婷,陳學(xué)群,杜繼曾. 中國(guó)應(yīng)用生理學(xué)雜志. 2013(02)
[9]藏羚羊與藏綿羊心肌、骨骼肌中肌紅蛋白含量和乳酸脫氫酶活性的比較[J]. 馬蘭,楊應(yīng)忠,靳國(guó)恩,格日力. 動(dòng)物學(xué)雜志. 2012(03)
[10]高原習(xí)服與低氧預(yù)適應(yīng)[J]. 陳良恩,安瑞卿. 國(guó)際病理科學(xué)與臨床雜志. 2012(02)
博士論文
[1]藏羚羊STAT3、HIF-1α和HIF-2α基因表達(dá)的生物學(xué)意義[D]. 劉芳.青海大學(xué) 2012
碩士論文
[1]高原鼢鼠血紅蛋白氧合特性及其分子機(jī)制[D]. 蒲鵬.蘭州大學(xué) 2018
[2]高原鼢鼠和甘肅鼢鼠MDM2轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)及p53甲基化分析[D]. 楊志.浙江大學(xué) 2017
[3]高原鼢鼠洞道氣體變化研究[D]. 張小剛.蘭州大學(xué) 2016
[4]甘肅鼢鼠血氧親和力與血液酸堿特性研究[D]. 嚴(yán)婷婷.陜西師范大學(xué) 2011
[5]高原鼢鼠(Myospalax baileyi)血紅蛋白的基因克隆[D]. 劉丹.曲阜師范大學(xué) 2010
[6]高原鼢鼠、高原鼠兔的骨骼肌對(duì)低氧環(huán)境的適應(yīng)機(jī)制[D]. 朱世海.青海大學(xué) 2009
[7]高原鼢鼠HIF-1α及HO-1在組織中的季節(jié)性表達(dá)[D]. 張建梅.青海大學(xué) 2007
本文編號(hào):3654052
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