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基于數(shù)據(jù)挖掘分析SLC22A1基因在肝細胞癌組織中的表達及其預后意義

發(fā)布時間:2022-02-21 08:00
  目的探討陽離子轉(zhuǎn)運蛋白1(SLC22A1)基因在肝細胞癌中的表達情況和預后意義。方法用The Human Protein Atlas(HAP)數(shù)據(jù)庫分析SLC22A1蛋白在肝細胞癌中的表達情況。利用Oncomine和GEPIA數(shù)據(jù)庫分析SLC22A1基因在肝細胞癌和肝正常組織中的表達水平。利用GEPIA和Linked Omics數(shù)據(jù)庫分析SLC22A1基因與肝細胞癌患者臨床相關性:總生存期(OS)、無瘤生存期(DFS)、病理分期和種族。采用Metascape在線工具對SLC22A1相關基因進行功能和通路富集分析。結(jié)果 LC22A1蛋白和m RNA在肝細胞癌組織中顯著低于正常組織,且與肝細胞癌預后呈正相關(P<0.001)。肝細胞癌中SLC22A1基因表達水平與預后、病理分期存在顯著差異性(P<0.05),與種族無相關性。功能富集分析顯示,SLC22A1基因通過影響小分子分解代謝過程、對異源生物刺激的反應和有機酸生物合成過程等發(fā)揮作用。通路富集分析顯示,SLC22A1基因通過作用于過氧化物酶體、脂肪酸降解和精氨酸和脯氨酸代謝等通路起作用。結(jié)論細胞癌組織中SLC22A1蛋白和m... 

【文章來源】:現(xiàn)代藥物與臨床. 2020,35(07)

【文章頁數(shù)】:6 頁

【文章目錄】:
1 資料和方法
    1.1 SLC22A1蛋白差異表達分析方法
    1.2 Oncomine數(shù)據(jù)庫挖掘分析方法
    1.3 TCGA數(shù)據(jù)庫挖掘分析方法
    1.4 肝細胞癌組織中與SLC22A1基因相關性最高的100個基因及富集分析
    1.5 統(tǒng)計學分析
2 結(jié)果
    2.1 SLC22A1蛋白在肝細胞癌組織和正常組織中表達情況
    2.2 SLC22A1基因在肝細胞癌組織和正常組織中表達情況
    2.3 GEPIA數(shù)據(jù)庫驗證結(jié)果
    2.4 SLC22A1基因表達水平與肝細胞癌患者臨床相關性分析
    2.5 肝細胞癌組織中SLC22A1相關基因及其富集分析
3 討論



本文編號:3636835

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