基于mtCOI基因序列的中國蔥斑潛蠅不同地理種群遺傳多樣性分析
發(fā)布時間:2022-02-20 19:05
【目的】蔥斑潛蠅Liriomyza chinensis是蔥蒜類蔬菜上的重要經(jīng)濟害蟲,在我國廣泛分布。本研究旨在闡析中國蔥斑潛蠅的地理種群遺傳分化!痉椒ā恳灾袊8省12個不同地理種群的253頭蔥斑潛蠅為樣本,測定其mtCOI基因序列;依據(jù)獲得的mtCOI基因序列,利用MEGA7.0, DnaSP 6.1和Arlequin 3.5等軟件對蔥斑潛蠅地理種群的遺傳多樣性、基因流水平和遺傳變異等進行分析。【結(jié)果】在253頭個體的759 bp mtCOI基因片段中,獲得13個單倍型,各單倍型間K2P遺傳距離均小于0.02;其中單倍型Hap1為12個地理種群所共享,總發(fā)生頻率高達81.82%。總?cè)后w單倍型多樣性較低(Hd=0.327),核苷酸多樣性(Pi)為0.00159,核苷酸平均差異數(shù)(K)為1.21011;蔥斑潛蠅總?cè)后w遺傳分化程度中等(FST=0.06971),基因交流較充分(Nm=3.33629)。分子方差分析(AMOVA)結(jié)果表明,遺傳變異來源為群體內(nèi);總?cè)后wTajima’s D檢驗值為顯著負值;Mantel檢測結(jié)果說明種群間的遺傳距離與地理距離沒有相關(guān)性!窘Y(jié)論...
【文章來源】:昆蟲學(xué)報. 2020,63(06)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:10 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 供試蟲源
1.2 基因組DNA提取
1.3 mtCOI基因序列的擴增
1.4 PCR產(chǎn)物的純化及克隆測序
1.5 序列整理及數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果
2.1 蔥斑潛蠅線粒體COI基因的堿基組成及單倍型分布
2.2 蔥斑潛蠅種群的遺傳多樣性及中性檢驗
2.3 蔥斑潛蠅mtCOI基因單倍型遺傳距離及系統(tǒng)進化分析
2.4 不同地理種群間的遺傳分化、基因交流和分子方差分析
3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]蔥斑潛蠅在大蔥上的發(fā)生與防治[J]. 梁超峰,蒙星,巨亞絨,胡作棟. 西北園藝(綜合). 2018(06)
[2]大蔥種植與機械化收獲分析[J]. 彭帥,楊勇,陳龍,江志鵬. 中國農(nóng)機化學(xué)報. 2017(09)
[3]分子標(biāo)記技術(shù)在昆蟲種群遺傳學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 何恒果. 西華師范大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2008(04)
[4]不同地理種群美洲斑潛蠅及近緣種的rDNA-ITS1序列分析和比較[J]. 王莉萍,杜予州,何婭婷,陸亞娟,陸自強. 昆蟲學(xué)報. 2007(06)
[5]美洲斑潛蠅在不同溫度下的飛行能力[J]. 雷仲仁,王音,黃冬如,程登發(fā). 昆蟲學(xué)報. 2002(03)
[6]蔥斑潛蠅發(fā)生危害與防治[J]. 魏國先,王忠武,李文羽. 植物保護. 2001(05)
[7]蔥斑潛蠅生物學(xué)特性研究[J]. 潘秀美,姜官恒. 昆蟲知識. 2001(05)
[8]蔥斑潛蠅的生物學(xué)特性[J]. 王立霞,張永軍,蔣玉文. 昆蟲知識. 2000(04)
[9]分子生物學(xué)技術(shù)在昆蟲系統(tǒng)學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 成新躍,周紅章,張廣學(xué). 動物分類學(xué)報. 2000(02)
[10]我國斑潛蠅的發(fā)生危害及其防治對策[J]. 王進忠,孫淑玲,蘇紅田. 北京農(nóng)學(xué)院學(xué)報. 2000(01)
本文編號:3635641
【文章來源】:昆蟲學(xué)報. 2020,63(06)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:10 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 供試蟲源
1.2 基因組DNA提取
1.3 mtCOI基因序列的擴增
1.4 PCR產(chǎn)物的純化及克隆測序
1.5 序列整理及數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果
2.1 蔥斑潛蠅線粒體COI基因的堿基組成及單倍型分布
2.2 蔥斑潛蠅種群的遺傳多樣性及中性檢驗
2.3 蔥斑潛蠅mtCOI基因單倍型遺傳距離及系統(tǒng)進化分析
2.4 不同地理種群間的遺傳分化、基因交流和分子方差分析
3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]蔥斑潛蠅在大蔥上的發(fā)生與防治[J]. 梁超峰,蒙星,巨亞絨,胡作棟. 西北園藝(綜合). 2018(06)
[2]大蔥種植與機械化收獲分析[J]. 彭帥,楊勇,陳龍,江志鵬. 中國農(nóng)機化學(xué)報. 2017(09)
[3]分子標(biāo)記技術(shù)在昆蟲種群遺傳學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 何恒果. 西華師范大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2008(04)
[4]不同地理種群美洲斑潛蠅及近緣種的rDNA-ITS1序列分析和比較[J]. 王莉萍,杜予州,何婭婷,陸亞娟,陸自強. 昆蟲學(xué)報. 2007(06)
[5]美洲斑潛蠅在不同溫度下的飛行能力[J]. 雷仲仁,王音,黃冬如,程登發(fā). 昆蟲學(xué)報. 2002(03)
[6]蔥斑潛蠅發(fā)生危害與防治[J]. 魏國先,王忠武,李文羽. 植物保護. 2001(05)
[7]蔥斑潛蠅生物學(xué)特性研究[J]. 潘秀美,姜官恒. 昆蟲知識. 2001(05)
[8]蔥斑潛蠅的生物學(xué)特性[J]. 王立霞,張永軍,蔣玉文. 昆蟲知識. 2000(04)
[9]分子生物學(xué)技術(shù)在昆蟲系統(tǒng)學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 成新躍,周紅章,張廣學(xué). 動物分類學(xué)報. 2000(02)
[10]我國斑潛蠅的發(fā)生危害及其防治對策[J]. 王進忠,孫淑玲,蘇紅田. 北京農(nóng)學(xué)院學(xué)報. 2000(01)
本文編號:3635641
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