目的:分析胃癌（gastric cancer,GC）與癌旁組織間的差異表達(dá)基因,尋找與GC的發(fā)生、發(fā)展及預(yù)后相關(guān)的關(guān)鍵基因。方法:基于基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)（gene expression omnibus,GEO）篩選GC與癌旁組織間顯著差異表達(dá)的基因,利用京都基因與基因組百科全書(shū)（Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）行通路富集分析。在癌癥基因組圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)（the cancer genome altlas,TCGA）中分析差異基因在GC中的表達(dá)及其與GC分期和預(yù)后的關(guān)系。最后在GC臨床樣本中驗(yàn)證。結(jié)果:在GEO中共篩選出1 353個(gè)差異表達(dá)基因。對(duì)GC中顯著高表達(dá)的31個(gè)基因進(jìn)行KEGG分析發(fā)現(xiàn),其主要參與細(xì)胞外基質(zhì)受體相互作用和蛋白消化與吸收。TCGA中分析顯示此通路中的3個(gè)基因（COL1A1、COMP及THBS2）在GC中顯著高表達(dá),其中COL1A1高表達(dá)與GC的分期、預(yù)后不良顯著相關(guān)。免疫組化結(jié)果證實(shí)COL1A1在GC中顯著高表達(dá),其表達(dá)與GC患者的預(yù)后相關(guān)。結(jié)論:COL1A1在GC中顯著高表達(dá),其與GC的發(fā)生發(fā)展及預(yù)后有重要關(guān)系。 

【文章來(lái)源】：腫瘤預(yù)防與治療. 2020,33(10)

【文章頁(yè)數(shù)】：7 頁(yè)

【部分圖文】：

GC與正常/癌旁組織的差異表達(dá)基因及韋恩圖。

GSE54129和GSE79973中高表達(dá)基因的KEGG通路富集分析

COL1A1呈棕黃色，主要在細(xì)胞間質(zhì)中表達(dá)。與癌旁組織相比，COL1A1在GC組織中顯著高表達(dá)(P<0.001，圖4A～C)。COL1A1的表達(dá)與GC的分期明顯相關(guān)(P=0.022),COL1A1表達(dá)水平越高，分期越晚(圖4D)，且COL1A1與GC的預(yù)后顯著相關(guān)(P=0.001)(圖4E)。圖4 COL1A1在GC中的表達(dá)及其與預(yù)后的關(guān)系

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]人TERT基因啟動(dòng)子區(qū)生物信息學(xué)分析[J]. 夏得淳,雷子賢,趙娟,李婷婷,趙娟,康曉靜.  腫瘤預(yù)防與治療. 2020(03)
[2]胃癌關(guān)鍵基因和通路的生物信息學(xué)和功能分析[J]. 吳茜,宋興勃,鐘慧鈺,溫陽(yáng),應(yīng)斌武.  腫瘤預(yù)防與治療. 2020(02)



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