優(yōu)雅蟈螽Gampsocleis gratiosa Brunner von Wattenwyl是直翅目Orthoptera重要的模式昆蟲,易于飼養(yǎng)和取材,其精子形成過程已研究的較為清楚,這為探究肌球蛋白在優(yōu)雅蟈螽頂體發(fā)生過程中的作用提供了條件。對于傳統(tǒng)的模式動物,例如果蠅頂體發(fā)生過程已經(jīng)有一些研究,但是對于直翅目昆蟲而言,果蠅頂體發(fā)生的模型無法解決直翅目昆蟲頂體發(fā)生過程中的一些問題,因此,探究優(yōu)雅蟈螽頂體發(fā)生過程對于直翅目昆蟲的研究提供了一個良好的參考,也為后續(xù)深入研究奠定基礎(chǔ)。本實驗室前期將優(yōu)雅蟈螽成蟲交給華大科技,使用Illumina Hiseq平臺測得雌雄成體轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),以此為依據(jù)建立了優(yōu)雅蟈螽轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫。本研究從優(yōu)雅蟈螽成體轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫中檢索肌球蛋白基因序列,檢索到的基因在NCBI上進(jìn)行比對。根據(jù)比對結(jié)果,確定了GgMyo18a基因。結(jié)合優(yōu)雅蟈螽差異轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和GgMyo18a不同組織中表達(dá)量分析,本研究發(fā)現(xiàn)GgMyo18a基因在優(yōu)雅蟈螽精巢中的表達(dá)量明顯高于其他組織,推測Myosin 18A蛋白在優(yōu)雅蟈螽頂體發(fā)生過程中發(fā)揮作用。本研究首先擴(kuò)增了GgMyo18a基因,對擴(kuò)增得到... 

【文章來源】：河北大學(xué)河北省

【文章頁數(shù)】：112 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【圖文】：

Myosin18A蛋白與其他物種氨基酸序列比對Fig.2-3MultiplealignmentofaminoacidsequenceofMyosin18Awithotherspecies

河北大學(xué)碩士學(xué)位論文20圖2-3Myosin18A蛋白與其他物種氨基酸序列比對（續(xù)）Fig.2-3MultiplealignmentofaminoacidsequenceofMyosin18Awithotherspecies(Continued)黃色區(qū)域所示為KE-rich序列，綠色區(qū)域所示為PDZ結(jié)構(gòu)域，淺藍(lán)色區(qū)域所示為馬達(dá)結(jié)構(gòu)域，粉色區(qū)域所示為IQ-Motif，黑色箭頭所示為該蛋白尾部結(jié)構(gòu)的起始區(qū)。優(yōu)雅蟈螽（Gampsocleisgratiosa）；小鼠（Musmusculus）：EDL12895.1；黑猩猩（Pantroglodytes）：JAA31795.1；山大齒猛（Odontomachusmonticola）：BBF97917.1；灰倉鼠（Cricetulusgriseus）：EGW14984.1；人（Homosapiens）：NP_510880.2；內(nèi)華達(dá)古白蟻（Zootermopsisnevadensis）：KDR16277.1。TheyellowregionshowstheKE-richsequence,thegreenregionshowsthePDZdomain,thelightblueregionshowstheMotordomain,thepinkregionshowstheIQ-Motif,theblackarrowshowsthestartingregionofthetaildomain.2.2.5系統(tǒng)進(jìn)化分析從NCBI蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中檢索其他物種的Myosin18A蛋白氨基酸序列，使用MEGA6.0軟件以N-J法構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹（圖2-4）。系統(tǒng)進(jìn)化結(jié)果表明：優(yōu)雅蟈螽Myosin18A蛋白在進(jìn)化上更接近于內(nèi)華達(dá)古白蟻（Zootermopsisnevadensis）和山大齒猛蟻（Odontomachusmonticola），在進(jìn)化上位于脊椎動物后，處于較低等級。各分支節(jié)點的數(shù)值均介于99~100之間，可信度較高。

第二章GgMyo18a基因信息學(xué)分析21圖2-4不同物種間Myosin18A蛋白系統(tǒng)進(jìn)化分析Fig.2-4PhylogeneticanalysisofMyosin18Aproteinindifferentspecies在MEGA6.0中用N-J法構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹，Bootstrp值設(shè)置為1000。圖中紅色加粗物種名為優(yōu)雅蟈螽。系統(tǒng)進(jìn)化樹中各物種GeneBank登錄號為：安氏蜂鳥（Calypteanna）：XP_030318562.1；藍(lán)山雀（Cyanistescaeruleus）：XP_023795297.1；多疣壁虎（Gekkojaponicus）：XP_015277384.1；變色龍（Anoliscarolinensis）：XP_016852768.1；人（Homosapiens）：AAH39612.1；小鼠（Musmusculus）：AAI38367.1；雙條吻蚓（Rhinatremabivittatum）：XP_029466989.1；斑馬擬麗魚（Maylandiazebra）：XP_023010026.1；大彈涂魚（Boleophthalmuspectinirostris）：XP_020789156.1；山大齒猛蟻（Odontomachusmonticola）：BBF97917.1；內(nèi)華達(dá)古白蟻（Zootermopsisnevadensis）：KDR16277.1。ThephylogenetictreewasconstructedusingtheN-JmethodinMEGA6.0,theBootstrpvaluewassetto1000.Gampsocleisgratiosawasmarkedinredbold.2.2.6蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域分析利用SMART在線工具對Myosin18A蛋白進(jìn)行結(jié)構(gòu)域預(yù)測（圖2-5）。結(jié)果顯示：Myosin18A蛋白在360-441氨基酸位置為PDZ結(jié)構(gòu)域（氨基酸序列：GDFGFSLRRAMVVERLASGQMKAVIFAEPGTIVQHNNETGLLPGDRLLEVNGVVVDDKSREEIIDLIKSSSSSVTVKVQPVP），549~1326氨基酸位置為馬達(dá)結(jié)構(gòu)域，1327~1349氨基酸位置為IQ-Motif（氨基酸序列：RLTDHVVRLQARCRGYLARRRLA），1386~1487氨基酸位置為Coiled-coilregion1結(jié)構(gòu)域，1511~2083氨基酸位置為Coiled-coilregion2

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號：3584585