水稻細(xì)菌性條斑病（bacterial leaf streak,簡稱細(xì)條病或BLS）是一種由細(xì)菌（Xanthomonas oryzae pv.Oryzicole,Xoc）引起的檢疫性病害。水稻細(xì)條病抗性屬于數(shù)量性狀。本實(shí)驗(yàn)室定位克隆了一個細(xì)條病抗性主效QTL（qBlsr5a）,發(fā)現(xiàn)其功能基因LOC_Os05g01710就是白葉枯病抗性基因xa5,但關(guān)于該基因控制細(xì)條病抗性的分子機(jī)理還不清楚。另外,本實(shí)驗(yàn)室研究發(fā)現(xiàn),水稻去甲基化酶基因OsROS1a和OsROS1c的表達(dá)對細(xì)條病病菌侵染具有明顯響應(yīng),這暗示它們可能與細(xì)條病抗病有關(guān),但還有待實(shí)驗(yàn)證明。本論文針對上述問題開展了研究。主要結(jié)果如下:（1）對Xa5-RNAi株系及其野生型對照明恢86進(jìn)行細(xì)條病抗性鑒定,發(fā)現(xiàn)前者病斑長度顯著小于后者,證明xa5確實(shí)是qBlsr5a的功能基因。（2）用RNA-Seq分析比較Xa5-RNAi植株和明恢86對細(xì)條病菌侵染（接種后9 h）的轉(zhuǎn)錄響應(yīng)。在Xa5-RNAi植株和明恢86中分別檢測到3115和157個差異表達(dá)基因,說明前者對細(xì)條病菌的響應(yīng)要比后者強(qiáng)烈得多。GO分析表明:Xa5-R... 

【文章來源】：福建農(nóng)林大學(xué)福建省

【文章頁數(shù)】：59 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

Xa5干擾材料與對照明恢86病斑情況

圖 2-2 樣品總 RNA 電泳檢測結(jié)果Fig.2-2 The result of agarose gel lectrophoresis of total RNA注：1-3：Xa5-RNAi 接種（XRI）; 4-6：Xa5-RNAi 模擬接種(XRM); 7-9：對照接種(WTI); 10-12：照模擬接種(WTM)。2.5 測序質(zhì)量評估2.5.1 比對結(jié)果分析12個樣品均獲得五千萬以上的讀段，將測序數(shù)據(jù)與參考基因組進(jìn)行比對，結(jié)果如表2-3所示，12個樣品測序讀段的匹配率均高于80%，并且所有樣品中多匹配讀段數(shù)（Multiple Mapped Reads or Fragments）的比例均低于4%（表2-3），該結(jié)果表明測序質(zhì)量良好，滿足后續(xù)分析的要求。表2-3 不同樣品間的比對結(jié)果Table.2-3 The comparison result of the blast in different samples樣本 Sample 總讀段數(shù)Total reads比對率Overallalignmentrate未匹配讀段數(shù)Unmapped單一匹配讀段數(shù)Unique多個匹配讀段數(shù)Multiple

不同樣品的FPKM箱線圖

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號：3552822