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低溫及激素對(duì)毛百合甘油-3-磷酸�;D(zhuǎn)移酶(LpGPAT)基因表達(dá)的影響

發(fā)布時(shí)間:2021-12-19 04:58
  低溫脅迫是花卉栽培常見(jiàn)的一種災(zāi)害,是影響花卉生產(chǎn)質(zhì)量的重要因素之一;同時(shí),激素參與花卉生長(zhǎng)發(fā)育以及低溫、干旱、鹽脅迫等非生物脅迫的響應(yīng)機(jī)制,為花卉提供抗逆性。對(duì)花卉抗性的研究是科研服務(wù)于生產(chǎn)的需要,因此研究花卉的抗性機(jī)制,掌握低溫脅迫及激素處理下基因表達(dá)變化規(guī)律,對(duì)于提高花卉的生產(chǎn)質(zhì)量、選育抗性新品種等方面具有十分重要的意義。因此,耐冷性強(qiáng),抗旱性強(qiáng)的毛百合(Lilium dauricum),同時(shí)也是作為園林雜交育種的重要野生資源,探究其具體的抗性機(jī)制是十分必要的。在本課題組早期研究基礎(chǔ)上,選取毛百合LpGPAT基因作為探究百合抗性機(jī)制的目的基因。本研究利用生物信息學(xué)分析對(duì)毛百合LpGPAT氨基酸序列9個(gè)其他物種的同源質(zhì)體GPAT氨基酸序列及擬南芥中10個(gè)GPAT氨基酸序列進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建,對(duì)LpGPAT與同源GPAT進(jìn)行氨基酸序列比對(duì),分析蛋白在保守結(jié)構(gòu)域的差異,以此探究GPAT蛋白結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系。運(yùn)用實(shí)時(shí)熒光定量技術(shù)分析在低溫和不同激素(50μM脫落酸、100μM水楊酸、50μM乙烯利、10μM茉莉酸甲酯)誘導(dǎo)下,LpGPAT基因在毛百合葉片的轉(zhuǎn)錄表達(dá)水平。同時(shí)根據(jù)LpGP... 

【文章來(lái)源】:沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省

【文章頁(yè)數(shù)】:83 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

低溫及激素對(duì)毛百合甘油-3-磷酸�;D(zhuǎn)移酶(LpGPAT)基因表達(dá)的影響


GPAT基因系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(shù)(采用鄰比法)

序列,質(zhì)體,序列,蛋白


沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文15軟件中進(jìn)行序列比對(duì),并利用Bio-linux系統(tǒng)meme-v4.12.0程序包運(yùn)算獲得11個(gè)GPAT蛋白的保守motof分布。結(jié)果表明:11個(gè)質(zhì)體GPAT蛋白的氨基酸序列比較保守,同源性非常高,11個(gè)氨基酸序列比對(duì)的一致性高達(dá)60.64%,且都具有甘油3磷酸酰基轉(zhuǎn)移酶家族保守結(jié)構(gòu)域(BOXⅠ~BOXⅣ)(圖2-2)。另外,在Bio-linux系統(tǒng)預(yù)測(cè)GPAT蛋白的保守motif中,一共鑒定了10個(gè)保守motif(motif1~10)。毛百合LpGPAT與同在一分支的鳳梨GPAT相差一個(gè)motif6,11個(gè)GPAT蛋白都含有8個(gè)保守motif。由此可見(jiàn)質(zhì)體GPAT進(jìn)化上是保守的(圖2-3)。圖2-2質(zhì)體GPAT蛋白氨基酸序列比對(duì)結(jié)果Fig.2-2AminoacidsequencealignmentresultsofplastidGPATprotein圖2-3質(zhì)體GPAT蛋白保守motif分布Fig.2-3ConservedmotifdistributionofplastidGPATprotein2.2.3本章小結(jié)生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn)毛百合LpGPAT基因及同源基因成員與擬南芥的質(zhì)體GPAT(ATS1)在系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)中聚集在一起,與擬南芥的其他GPAT基因不在同一分支上聚類(lèi),BOXⅠBOXⅡBOXⅢBOXⅣ

質(zhì)體,蛋白


沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文15軟件中進(jìn)行序列比對(duì),并利用Bio-linux系統(tǒng)meme-v4.12.0程序包運(yùn)算獲得11個(gè)GPAT蛋白的保守motof分布。結(jié)果表明:11個(gè)質(zhì)體GPAT蛋白的氨基酸序列比較保守,同源性非常高,11個(gè)氨基酸序列比對(duì)的一致性高達(dá)60.64%,且都具有甘油3磷酸�;D(zhuǎn)移酶家族保守結(jié)構(gòu)域(BOXⅠ~BOXⅣ)(圖2-2)。另外,在Bio-linux系統(tǒng)預(yù)測(cè)GPAT蛋白的保守motif中,一共鑒定了10個(gè)保守motif(motif1~10)。毛百合LpGPAT與同在一分支的鳳梨GPAT相差一個(gè)motif6,11個(gè)GPAT蛋白都含有8個(gè)保守motif。由此可見(jiàn)質(zhì)體GPAT進(jìn)化上是保守的(圖2-3)。圖2-2質(zhì)體GPAT蛋白氨基酸序列比對(duì)結(jié)果Fig.2-2AminoacidsequencealignmentresultsofplastidGPATprotein圖2-3質(zhì)體GPAT蛋白保守motif分布Fig.2-3ConservedmotifdistributionofplastidGPATprotein2.2.3本章小結(jié)生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn)毛百合LpGPAT基因及同源基因成員與擬南芥的質(zhì)體GPAT(ATS1)在系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)中聚集在一起,與擬南芥的其他GPAT基因不在同一分支上聚類(lèi),BOXⅠBOXⅡBOXⅢBOXⅣ

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[6]大豆油脂的合成途徑及關(guān)鍵酶GPAT基因的研究進(jìn)展[J]. 魯中爽,劉思言,李廣隆,王蕊,劉明明,么夢(mèng)凡,關(guān)淑艷,姚丹.  廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(11)
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博士論文
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碩士論文
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[2]毛百合與松葉百合組培技術(shù)研究[D]. 汪娜.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
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[4]低溫脅迫下不同百合的抗寒生理研究[D]. 王玲麗.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012



本文編號(hào):3543806

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