DUF538基因家族是一類含有未知功能域的蛋白,目前已有研究表明該家族基因參與植物多個生長發(fā)育和脅迫應(yīng)答過程,但DUF538基因家族在植物中的分布、系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系、基因結(jié)構(gòu)、序列和表達(dá)進(jìn)化相關(guān)狀況尚不明確。本研究對植物DUF538基因家族進(jìn)行了較為全面的序列進(jìn)化分析,其次利用公共數(shù)據(jù)庫分析了水稻和玉米DUF538基因家族在正常與干旱下的表達(dá)進(jìn)化,并通過Real-Time PCR實驗分析了玉米DUF538基因家族在CaCl₂脅迫下的表達(dá)進(jìn)化,主要研究結(jié)果如下:1.從13種植物中鑒定了196個含保守DUF538功能域的基因,其中來自小立碗蘚（Physcomitrella patens）3個,江南卷柏（Selaginella moellendorffii）5個,玉米（Zea mays）20個,水稻（Oryza sativa）14個,大麥（Hordeum vulgare）14個,毛竹（Phyllostachys heterocycla）12個,菠蘿（Ananas comosus）8個,甘藍(lán)型油菜（Brassica napus）40個,甘藍(lán)（Brassica oleracea... 

【文章來源】：四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：65 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

植物DUF538基因家族A1和B2亞家族系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系

253.4.2植物DUF538基因?qū)x擇壓分析為了檢測196個DUF538基因之間的選擇壓情況，我們一共計算了19110對兩兩基因間的dN/dS值（圖3，其中有2個基因?qū)τ捎赿S<0.0001造成dN/dS值異常大，沒有在柱狀圖中展示），結(jié)果發(fā)現(xiàn)19104個基因?qū)Φ膁N/dS值均小于1，其中有7231個基因?qū)Φ膁N/dS值小于0.01，5080個基因?qū)Φ膁N/dS值在0.01與0.02之間，占總基因?qū)Φ?4.4%（分別占37.8%，26.6%），其次dN/dS值在0.10-0.20之間的有1900個基因?qū)�，只�?個基因?qū)Γ℅lyma13g03534.1-Glyma05g06040.1：1.9934，Glyma13g03534.1-Glyma10g02180.1：1.6079，CDY62633-CDY40302：1.2859，Glyma05g06040.1-Glyma18g14130.2：1.0253，CDY代表甘藍(lán)型油菜，Glyma代表大豆）的dN/dS值大于1。因此，DUF538基因?qū)χ饕軓娏业募儍暨x擇，只有極少數(shù)基因?qū)υ馐苷蜻x擇。圖3DUF538基因家族中基因?qū)N/dS分布Figure3DistributionofdN/dSforgenepairinDUF538genefamily

27圖4玉米和水稻DUF538蛋白互作關(guān)系。紅色圓圈代表DUF538蛋白，藍(lán)色圓圈代表非DUF538蛋白，紅色連線代表DUF538蛋白跟非DUF538蛋白互作，灰色連線代表非DUF538蛋白之間互作，線的粗細(xì)代表基因間的互作強度。Figure4InteractionofDUF538proteinsinmaizeandrice.TheredcirclerepresentsDUF538protein,thebluecirclerepresentsnon-DUF538protein,theredlinerepresentsinteractionbetweenDUF538proteinandnon-DUF538protein,thegraylinerepresentstheinteractionbetweentwonon-DUF538proteins,andthedegreeofthicknessforlinerepresentsthestrengthofinteractionbetweengenes.

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[2]重復(fù)基因的進(jìn)化--回顧與進(jìn)展[J]. 孫紅正,葛頌.  植物學(xué)報. 2010(01)



本文編號：3536612