水稻OsGBP轉(zhuǎn)錄因子家族基因的功能研究及雌雄配子不育基因MFS的定位與功能分析
發(fā)布時(shí)間:2021-11-13 10:41
轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制是真核生物基因表達(dá)中的重要調(diào)節(jié)方式,在植物的生長(zhǎng)發(fā)育、抗逆和抗病響應(yīng)、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)以及次生代謝過(guò)程中發(fā)揮著重要的作用。轉(zhuǎn)錄因子(Transcription factor),也稱反式作用因子,它作為轉(zhuǎn)錄調(diào)控的主體,在植物基因組中大量存在,并參與了植物的眾多生物學(xué)過(guò)程。GAGA-binding protein(GBP)是植物特有的一類(lèi)轉(zhuǎn)錄因子,能特異地與GAGA重復(fù)序列結(jié)合而調(diào)控下游基因的表達(dá)。本研究通過(guò)生物信息學(xué)方法,從全基因組水平上對(duì)水稻OsGBP基因家族進(jìn)行了鑒定以及對(duì)該家族進(jìn)行進(jìn)化分析;通過(guò)轉(zhuǎn)基因方法,對(duì)其水稻家族基因的功能進(jìn)行了研究,主要結(jié)果如下:1.水稻基因組中OsGBP家族含4個(gè)同源基因,系統(tǒng)發(fā)生進(jìn)化分析表明該家族被劃分為兩個(gè)亞類(lèi),其中OsGBP1屬于第一亞類(lèi),而OsGBP2、OsGBP3、OsGBP4屬于第二個(gè)亞類(lèi),并且串聯(lián)分布在第10染色體上;蛳嗨菩苑治霭l(fā)現(xiàn)OsGBP1同其它基因最高相似度為53%,其它三個(gè)基因相似度在82%以上,并且OsGBP2與OsGBP3是兩個(gè)相同拷貝的基因;氨基酸序列分析顯示OsGBP家族的蛋白在C端含有一個(gè)非常保守的鋅指類(lèi)的DNA-b...
【文章來(lái)源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:166 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
水稻和擬南芥GBP蛋白的序列比對(duì)用CLUSTALW軟件對(duì)來(lái)源于擬南芥和水稻的GBP蛋白序列進(jìn)行多序列比對(duì)
3 GBPs 的共線性分析于水稻、高粱、玉米、大麥和短柄草的 GBPs 的共線分析. 3 Extensive microsynteny of GBPs across several speciesza sativa (Os), Sorghum bicolor (Sb), Zea mays (Zm), Hordeum vulgare (Hv), Brachypodium distachyon). Orthologues of GBPs in these four grasses are shown in the circle. Color Lines show syntenic relationships.2 OsGBP1 基因的功能分析2.1 osgbp1 突變體影響幼苗生長(zhǎng)和種子粒型為了研究 OsGBP1 基因的功能,本研究從韓國(guó) Postech 突變體庫(kù)中獲得一編號(hào)為 1B-11615.L 的突變體,該突變體的 T-DNA 插入位點(diǎn)位于 OsGBP1 的二個(gè)內(nèi)含子,位于 ATG 下游 662bp 處(圖 4A)。根據(jù) T-DNA 插入位點(diǎn)兩端
OsGBP 轉(zhuǎn)錄因子家族基因的功能研究及雌雄配子不育基因 MFS 的定位與功則為純合 T-DNA 插入,若引物 LP/RP 擴(kuò)增為陽(yáng)性,而 RP分離的野生型植株,若兩組引物均擴(kuò)增為陽(yáng)性,則為雜合。根據(jù) DNA 檢測(cè)結(jié)果,抽提突變體葉片 RNA,檢測(cè) OsG發(fā)現(xiàn)在突變體 osgbp1 中 OsGBP1 基本不表達(dá)(圖 4B, C)錄Ⅰ附表 1。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]OsGRF4 controls grain shape, panicle length and seed shattering in rice[J]. Pingyong Sun,Wuhan Zhang,Yihua Wang,Qiang He,Fu Shu,Hai Liu,Jie Wang,Jianmin Wang,Longping Yuan,Huafeng Deng. Journal of Integrative Plant Biology. 2016(10)
[2]Stamen specification and anther development in rice[J]. WILSON Zoe A. Chinese Science Bulletin. 2009(14)
[3]植物轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)與調(diào)控作用[J]. 劉強(qiáng),張貴友,陳受宜. 科學(xué)通報(bào). 2000(14)
[4]水稻胚囊形成過(guò)程與分期[J]. 劉向東,徐雪賓,盧永根,徐是雄. 中國(guó)水稻科學(xué). 1997(03)
碩士論文
[1]水稻GAGA Element的預(yù)測(cè)與分析[D]. 張韜.電子科技大學(xué) 2008
本文編號(hào):3492873
【文章來(lái)源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:166 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
水稻和擬南芥GBP蛋白的序列比對(duì)用CLUSTALW軟件對(duì)來(lái)源于擬南芥和水稻的GBP蛋白序列進(jìn)行多序列比對(duì)
3 GBPs 的共線性分析于水稻、高粱、玉米、大麥和短柄草的 GBPs 的共線分析. 3 Extensive microsynteny of GBPs across several speciesza sativa (Os), Sorghum bicolor (Sb), Zea mays (Zm), Hordeum vulgare (Hv), Brachypodium distachyon). Orthologues of GBPs in these four grasses are shown in the circle. Color Lines show syntenic relationships.2 OsGBP1 基因的功能分析2.1 osgbp1 突變體影響幼苗生長(zhǎng)和種子粒型為了研究 OsGBP1 基因的功能,本研究從韓國(guó) Postech 突變體庫(kù)中獲得一編號(hào)為 1B-11615.L 的突變體,該突變體的 T-DNA 插入位點(diǎn)位于 OsGBP1 的二個(gè)內(nèi)含子,位于 ATG 下游 662bp 處(圖 4A)。根據(jù) T-DNA 插入位點(diǎn)兩端
OsGBP 轉(zhuǎn)錄因子家族基因的功能研究及雌雄配子不育基因 MFS 的定位與功則為純合 T-DNA 插入,若引物 LP/RP 擴(kuò)增為陽(yáng)性,而 RP分離的野生型植株,若兩組引物均擴(kuò)增為陽(yáng)性,則為雜合。根據(jù) DNA 檢測(cè)結(jié)果,抽提突變體葉片 RNA,檢測(cè) OsG發(fā)現(xiàn)在突變體 osgbp1 中 OsGBP1 基本不表達(dá)(圖 4B, C)錄Ⅰ附表 1。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]OsGRF4 controls grain shape, panicle length and seed shattering in rice[J]. Pingyong Sun,Wuhan Zhang,Yihua Wang,Qiang He,Fu Shu,Hai Liu,Jie Wang,Jianmin Wang,Longping Yuan,Huafeng Deng. Journal of Integrative Plant Biology. 2016(10)
[2]Stamen specification and anther development in rice[J]. WILSON Zoe A. Chinese Science Bulletin. 2009(14)
[3]植物轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)與調(diào)控作用[J]. 劉強(qiáng),張貴友,陳受宜. 科學(xué)通報(bào). 2000(14)
[4]水稻胚囊形成過(guò)程與分期[J]. 劉向東,徐雪賓,盧永根,徐是雄. 中國(guó)水稻科學(xué). 1997(03)
碩士論文
[1]水稻GAGA Element的預(yù)測(cè)與分析[D]. 張韜.電子科技大學(xué) 2008
本文編號(hào):3492873
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