質(zhì)體ATP/ADP轉(zhuǎn)運蛋白是真核生物中的一大腺苷酸轉(zhuǎn)運系統(tǒng),位于細胞的質(zhì)體內(nèi)膜上,負責能量的運輸,為質(zhì)體中的各種物質(zhì)代謝反應提供能量,可影響植物中淀粉和脂質(zhì)的含量等。本研究用實驗室構建的吉林人參248,993 Unigenes數(shù)據(jù)庫,篩選出199條具有完整保守域的吉林人參MFS Unigenes（PgMFSs）,利用生物信息學手段,分別從基因篩選、功能注釋、表達分析和進化起源等方面,挖掘并分析吉林人參中的主要協(xié)同轉(zhuǎn)運蛋白超家族（Major Facilitator Superfamily,MFS）。從中篩選出PgMFS060基因,并以農(nóng)桿菌介導法成功轉(zhuǎn)化胡蘿卜,為該基因的功能驗證奠定基礎,研究結(jié)果如下:1、199條PgMFSs長度大約分布在1000 bp-3000 bp之間;在Level 2水平上,一共注釋到了10條GO亞功能,且富集分析顯示,轉(zhuǎn)運活性、膜、細胞部分、細胞器部分、膜部分這五個亞功能存在極顯著差異。2、利用NJ法繪制進化樹,顯示具有完整保守域的來自不同轉(zhuǎn)錄本下合并的141條PgMFSs被分成8個亞家族,相同家族的基因基本聚類在一起,在進化上大都具有保守性。3、分析了PgMF... 

【文章來源】：吉林農(nóng)業(yè)大學吉林省

【文章頁數(shù)】：81 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

MVA途徑和MEP途徑Fig.1.1MVApathwayandMEPpathway

圖 1.2 類胡蘿卜素的合成途徑Fig.1.2 Carotenoid biosynthetic pathway與意義TP/ADP 轉(zhuǎn)運蛋白位于細胞的質(zhì)體內(nèi)膜上負責能量的運輸，參與質(zhì)應。目前在植物中淀粉和脂質(zhì)代謝途徑研究較為深入，而在人參皂究報道，推測在位于質(zhì)體的人參皂苷合成途徑的 MEP 途徑中，為量。本研究用實驗室構建的吉林人參 248,993 Unigenes 數(shù)據(jù)庫，利別從基因篩選、功能注釋、表達分析和進化起源等方面，挖掘并分同轉(zhuǎn)運蛋白超家族，并篩選出一條與皂苷合成相關的質(zhì)體 ATP/A0），以胡蘿卜為受體，克隆 PgMFS060 并進行異源受體轉(zhuǎn)化，為該礎。本研究充實了人參中基因家族分析平臺，為人參中重要的新基新皂苷生產(chǎn)方式和創(chuàng)新種質(zhì)資源奠定基礎。

S 超基因家族生物信息學分析Ss 的篩選BI 上下載所有植物中 MFS 超家族的 mRNA 序列，共獲得 17,631 條構建的吉林人參 248,993 Unigenes 數(shù)據(jù)庫進行本地 Blast 異源比對序列；通過 Blast 2GO 軟件在線與 NCBI 比對，刪除沒有注釋到 M域的序列，獲得 437 條基因；利用 Vector 軟件對同一轉(zhuǎn)錄本下的序獲得 199 條基因，并對這些基因進行后續(xù)統(tǒng)計分析。Ss 功能注釋與富集分析MFSs GO 功能注釋結(jié)果統(tǒng)計分析last 2GO 軟件，將最終獲得的 199 條 PgMFSs 序列進行在線比對分的長度大都分布在 1000 bp-3000 bp 之間（圖 3.1），且序列在 GO 水evel 2 到 level 6 水平上（圖 3.2）。

【參考文獻】：
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本文編號：3480228