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基于高密度遺傳圖譜構建的葡萄抗寒性QTL定位及候選基因篩選研究

發(fā)布時間:2021-11-04 19:35
  本研究以葡萄品種‘赤霞珠’ב左優(yōu)紅’及它們的200株雜交后代為試材,利用SSR分子標記進行真假雜種鑒定,得到真雜種單株181株,以該群體及其雜交后代一年生枝條為試材,利用差熱分析(Differential Thermal Analysis,DTA)系統(tǒng)對葡萄枝條抗寒性進行表型鑒定,并進行簡化基因組RAD測序,構建了含有大量SNP標記的高密度分子遺傳圖譜,結合3年抗寒性表型數(shù)據(jù)進行葡萄抗寒性QTL定位研究,得到葡萄抗寒相關QTL計算其貢獻率,并根據(jù)定位出的QTL篩選出于抗寒性相關的候選基因,本試驗獲得如下主要結果:1.采用SSR分子標記法結合聚丙烯酰胺凝膠電泳鑒定‘赤霞珠’ב左優(yōu)紅’后代雜種真實性,從現(xiàn)有SSR引物中篩選出兩對具有清晰條帶且為ab×cd帶型的引物,利用親本對這兩對引物的最佳退火溫度進行篩選,在最適溫度下利用這兩對引物鑒定了200株后代的雜種真實性,鑒定出真雜種181株,真雜種率為90.5%,將這181株真雜種單株用于后期簡化基因組RAD測序。2.利用低溫差熱分析系統(tǒng)對‘赤霞珠’ב左優(yōu)紅’親本及其雜交后代一年生枝條進行抗寒性進行低溫放熱分析(LTE),得到枝條溫度-傷... 

【文章來源】:沈陽農(nóng)業(yè)大學遼寧省

【文章頁數(shù)】:61 頁

【學位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 文獻綜述
    1.1 葡萄抗寒機制研究進展
        1.1.1 葡萄抗寒生理機制研究進展
        1.1.2 葡萄抗寒遺傳機制研究進展
        1.1.3 葡萄抗寒分子機制研究進展
    1.2 簡化基因組測序技術在葡萄中的應用
    1.3 葡萄遺傳圖譜構建及抗寒性QTL定位研究進展
        1.3.1 葡萄遺傳圖譜構建研究進展
        1.3.2 抗寒性QTL定位
    1.4 葡萄抗寒性鑒定與評價
        1.4.1 DTA系統(tǒng)鑒定葡萄抗寒性
        1.4.2 葡萄抗寒性的評價
    1.5 本研究的目的與意義
第二章 基于RAD測序的葡萄遺傳圖譜構建
    2.1 試驗材料
    2.2 試驗方法
        2.2.1 DNA的提取
        2.2.2 DNA濃度與質(zhì)量檢測
        2.2.3 SSR反應體系、PCR擴增及產(chǎn)物檢測
        2.2.4 用于假雜種鑒定的SSR引物篩選
        2.2.5 RAD-seq的主要技術流程
        2.2.6 RAD-seq數(shù)據(jù)分析
        2.2.7 遺傳圖譜構建
    2.3 結果與分析
        2.3.1 DNA提取濃度與純度檢測
        2.3.2 SSR引物篩選
        2.3.3 雜交群體的真假雜種鑒定
        2.3.4 RAD-seq數(shù)據(jù)分析及SNP標記開發(fā)
        2.3.5 葡萄高密度遺傳圖譜的構建
        2.3.6 遺傳圖譜的評價
    2.4 討論
        2.4.1 作圖親本的選擇
        2.4.2 雜種鑒定
        2.4.3 RAD-seq圖譜構建與誤差來源
第三章 作圖群體抗寒性QTL定位及候選基因篩選
    3.1 試驗材料
    3.2 試驗方法
        3.2.1 試驗儀器
        3.2.2 試驗材料準備
        3.2.3 葡萄枝條LTE測定
        3.2.4 數(shù)據(jù)分析
        3.2.5 葡萄抗寒性QTL定位
    3.3 結果與分析
        3.3.1 葡萄抗寒性LT-I分析
        3.3.2 雜交后代群體抗寒性分析
        3.3.3 雜交群體后代抗寒性遺傳分析
        3.3.4 抗寒性QTL位點檢測
        3.3.5 抗寒性候選基因篩選
    3.4 討論
        3.4.1 葡萄抗寒性的鑒定與評價
        3.4.2 抗寒性QTL位點分布
        3.4.3 抗寒性相關候選基因
第四章 結論
參考文獻
致謝


【參考文獻】:
期刊論文
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碩士論文
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[9]柑橘遺傳圖譜的延伸加密以及抗寒性遺傳分析和QTL定位[D]. 馬喜軍.西南大學 2012
[10]葡萄抗寒砧木的組織培養(yǎng)、試管苗微嫁接及抗寒生理生化特性研究[D]. 劉文瑜.甘肅農(nóng)業(yè)大學 2011



本文編號:3476323

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